227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4527 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  100 
 
 		 435 aa  874    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1631  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  71.25 
 
 		 424 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1454  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  71.01 
 
 		 425 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5899  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  68.21 
 
 		 423 aa  543  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1449  nitrate transporter component, nrtA  46.21 
 
 		 403 aa  333  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1085  nitrate transporter component, nrtA  44.91 
 
 		 415 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1761  nitrate transporter component, nrtA  43.56 
 
 		 386 aa  315  9e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.786473  normal  0.0141893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4138  putative nitrate transporter component, nrtA  43.16 
 
 		 384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  37.86 
 
 		 467 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4228  putative nitrate transport protein  42.67 
 
 		 386 aa  306  7e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0904389  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2505  putative nitrate transport protein  45.27 
 
 		 377 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1210  putative nitrate transporter component, nrtA  41.56 
 
 		 387 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1263  nitrate transporter component, nrtA  41.35 
 
 		 403 aa  291  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  38.98 
 
 		 432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0919  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.2 
 
 		 398 aa  269  8.999999999999999e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  41.01 
 
 		 382 aa  266  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2972  nitrate transporter component, nrtA  41.31 
 
 		 402 aa  264  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2820  nitrate transporter  39.04 
 
 		 397 aa  262  8.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.694753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1704  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  37.59 
 
 		 410 aa  257  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4960  putative nitrate transport protein  41.91 
 
 		 338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4497  putative nitrate transport protein  41.62 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1133  nitrate transporter, putative  38.17 
 
 		 406 aa  247  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226657  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2819  putative nitrate transport protein  35 
 
 		 469 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.469609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1662  periplasmic binding protein-like II  38.58 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.429682  hitchhiker  0.00361023 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1969  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transporter, substrate binding protein  35.25 
 
 		 457 aa  244  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001607  nitrate ABC transporter nitrate-binding protein  36.38 
 
 		 449 aa  242  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1115  putative nitrate transport protein  34.89 
 
 		 491 aa  239  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1153  nitrate transporter system, periplasmic component  35 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2417  putative nitrate transport protein  35.17 
 
 		 466 aa  237  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  36.85 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1152  nitrate transporter, putative  37.18 
 
 		 382 aa  237  3e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3769  nitrate transporter, putative  37.25 
 
 		 407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05588  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic component  35.45 
 
 		 454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1084  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system  35.19 
 
 		 467 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3039  putative nitrate transport protein  37.5 
 
 		 389 aa  232  8.000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.58476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03654  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  34.92 
 
 		 469 aa  232  9e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3316  putative nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein  34.67 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163343  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2264  histidine kinase  36.18 
 
 		 470 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00574253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5013  putative nitrate transport protein  40.58 
 
 		 338 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.826042 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3040  putative nitrate transport protein  36.78 
 
 		 452 aa  226  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0757013  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1663  periplasmic binding protein-like II  35.28 
 
 		 455 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550763  normal  0.0123781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.33 
 
 		 669 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  34.53 
 
 		 657 aa  221  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.25 
 
 		 668 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.25 
 
 		 668 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.25 
 
 		 668 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  32.15 
 
 		 405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2528  nitrate transporter, putative  36.39 
 
 		 370 aa  216  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2301  putative nitrate transport protein  40.06 
 
 		 333 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3742  putative nitrate transport protein  42.77 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3446  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  34.36 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4454  putative nitrate transport protein  36.22 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  32.17 
 
 		 434 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  34.76 
 
 		 407 aa  209  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  31.41 
 
 		 419 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  31.95 
 
 		 419 aa  206  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  32.5 
 
 		 431 aa  206  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  35.28 
 
 		 440 aa  206  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.33 
 
 		 668 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  32.59 
 
 		 430 aa  205  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1091  putative regulatory protein NasS  38.27 
 
 		 353 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0089  putative regulatory protein NasS  38.27 
 
 		 353 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.964988  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0332  putative regulatory protein NasS  38.27 
 
 		 353 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0240199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1257  putative regulatory protein NasS  38.27 
 
 		 353 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0276079  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1166  regulatory protein NasS, putative  37.77 
 
 		 353 aa  202  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241228  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  32.09 
 
 		 430 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  32.09 
 
 		 430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  35.19 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4818  ABC transporter nitrate-binding protein  33.67 
 
 		 456 aa  201  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  33.67 
 
 		 450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  31.32 
 
 		 418 aa  200  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  35.37 
 
 		 403 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.42 
 
 		 385 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  32.66 
 
 		 432 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1672  putative regulatory protein  36.53 
 
 		 353 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  30.99 
 
 		 426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  31.39 
 
 		 414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  30.53 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 		 414 aa  197  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  30.75 
 
 		 437 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  30.75 
 
 		 437 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  30.63 
 
 		 414 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0247  nitrate transport ATP-binding protein  36.22 
 
 		 353 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  30.28 
 
 		 414 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  34.61 
 
 		 403 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1760  putative regulatory protein  37.35 
 
 		 353 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  32.29 
 
 		 423 aa  194  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  32.75 
 
 		 444 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  32.75 
 
 		 444 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  32.85 
 
 		 414 aa  193  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  33.85 
 
 		 427 aa  193  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  31.2 
 
 		 457 aa  193  6e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  30.19 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  32.92 
 
 		 442 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  31.38 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  31.11 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  31.23 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  31.25 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  29.98 
 
 		 417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3941  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  38.32 
 
 		 347 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0774649  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>