247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1239 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  100 
 
 		 443 aa  910    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  64.27 
 
 		 444 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  64.27 
 
 		 444 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3527  nitrate transport protein  62.67 
 
 		 442 aa  551  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  61.94 
 
 		 442 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  59.55 
 
 		 437 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  61.67 
 
 		 437 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  61.9 
 
 		 430 aa  523  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  61.99 
 
 		 430 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  61.99 
 
 		 430 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  61.48 
 
 		 431 aa  512  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  54.2 
 
 		 475 aa  495  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4540  twin-arginine translocation pathway signal  57.62 
 
 		 440 aa  494  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  59.34 
 
 		 434 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  58.27 
 
 		 450 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  57.47 
 
 		 438 aa  480  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  56.9 
 
 		 432 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3656  twin-arginine translocation pathway signal  50.11 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4925  bicarbonate transport system substrate-binding protein  48.46 
 
 		 454 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.794472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3521  bicarbonate transport system substrate-binding protein  48.02 
 
 		 457 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2596  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  48.02 
 
 		 457 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1027  bicarbonate transport system substrate-binding protein  48.02 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4678  ABC-type bicarbonate transport system substrate-binding protein  46.34 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1488  membrane protein  46.68 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.976236 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  40.97 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  38.28 
 
 		 405 aa  280  5e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  38.53 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  35.33 
 
 		 467 aa  272  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  39.95 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  38.9 
 
 		 419 aa  268  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  38.67 
 
 		 419 aa  266  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  40.35 
 
 		 419 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  38.25 
 
 		 415 aa  266  5e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  41.21 
 
 		 417 aa  266  8e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  40.15 
 
 		 414 aa  264  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  38.14 
 
 		 417 aa  264  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  41.41 
 
 		 426 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  41.41 
 
 		 426 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  40.15 
 
 		 414 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  40.95 
 
 		 420 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  41.16 
 
 		 434 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  39.2 
 
 		 414 aa  259  7e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  39.8 
 
 		 431 aa  259  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  40.66 
 
 		 437 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  37.25 
 
 		 425 aa  257  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  37.3 
 
 		 418 aa  256  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  39.49 
 
 		 414 aa  255  8e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  36.82 
 
 		 427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  38.79 
 
 		 414 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  39.95 
 
 		 414 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  37.27 
 
 		 426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  38.99 
 
 		 414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  38.29 
 
 		 414 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.2 
 
 		 668 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.82 
 
 		 669 aa  242  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.82 
 
 		 669 aa  242  9e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  35.43 
 
 		 669 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.97 
 
 		 673 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  35.49 
 
 		 663 aa  241  2.9999999999999997e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1438  nitrate-binding proteint  38.16 
 
 		 432 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28551  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  34.75 
 
 		 432 aa  238  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  36.09 
 
 		 403 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.64 
 
 		 668 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.99 
 
 		 668 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.99 
 
 		 668 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  35.61 
 
 		 403 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  34.29 
 
 		 657 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  34.38 
 
 		 440 aa  229  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  34.85 
 
 		 403 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1449  nitrate transporter component, nrtA  34.07 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  35.44 
 
 		 403 aa  223  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  34.92 
 
 		 404 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  34.67 
 
 		 404 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1612  nitrate-binding protein NasS  34.17 
 
 		 400 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.837424  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  35.11 
 
 		 667 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1605  nitrate-binding protein NasS  34.01 
 
 		 421 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2417  putative nitrate transport protein  34.35 
 
 		 466 aa  216  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1085  nitrate transporter component, nrtA  35.47 
 
 		 415 aa  216  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03654  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  34.03 
 
 		 469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3518  hypothetical protein  34.76 
 
 		 402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  33.33 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2264  histidine kinase  33.65 
 
 		 470 aa  209  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00574253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1969  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transporter, substrate binding protein  31.71 
 
 		 457 aa  209  6e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2819  putative nitrate transport protein  33.57 
 
 		 469 aa  209  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.469609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1760  putative regulatory protein  36.64 
 
 		 353 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1166  regulatory protein NasS, putative  36.54 
 
 		 353 aa  206  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241228  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1084  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system  34.37 
 
 		 467 aa  206  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1115  putative nitrate transport protein  30.77 
 
 		 491 aa  206  9e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1257  putative regulatory protein NasS  36.64 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0276079  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1091  putative regulatory protein NasS  36.64 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1704  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  32.36 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0332  putative regulatory protein NasS  36.64 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0240199  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0089  putative regulatory protein NasS  36.64 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.964988  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3316  putative nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein  32.48 
 
 		 461 aa  204  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163343  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4228  putative nitrate transport protein  31.46 
 
 		 386 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0904389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41480  hypothetical protein  33.67 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1663  periplasmic binding protein-like II  33.33 
 
 		 455 aa  204  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550763  normal  0.0123781 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1153  nitrate transporter system, periplasmic component  32.02 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  34.85 
 
 		 385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  30.56 
 
 		 454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>