200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5013 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5013  putative nitrate transport protein  100 
 
 		 338 aa  658    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.826042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4960  putative nitrate transport protein  84.91 
 
 		 338 aa  537  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4497  putative nitrate transport protein  85.8 
 
 		 338 aa  527  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2301  putative nitrate transport protein  58.16 
 
 		 333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3742  putative nitrate transport protein  58.51 
 
 		 334 aa  296  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2505  putative nitrate transport protein  49.13 
 
 		 377 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2870  putative nitrate transport protein  57.61 
 
 		 334 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4228  putative nitrate transport protein  44.38 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0904389  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1210  putative nitrate transporter component, nrtA  42.36 
 
 		 387 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5899  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  41.45 
 
 		 423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  41.04 
 
 		 435 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4138  putative nitrate transporter component, nrtA  41.86 
 
 		 384 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1454  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  40.52 
 
 		 425 aa  232  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1761  nitrate transporter component, nrtA  41.5 
 
 		 386 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.786473  normal  0.0141893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1631  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  40.94 
 
 		 424 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2528  nitrate transporter, putative  38.84 
 
 		 370 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  37.28 
 
 		 467 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1085  nitrate transporter component, nrtA  40.92 
 
 		 415 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1449  nitrate transporter component, nrtA  40.7 
 
 		 403 aa  212  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2820  nitrate transporter  33.43 
 
 		 397 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.694753 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  39.3 
 
 		 432 aa  206  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1704  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  39.18 
 
 		 410 aa  203  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1115  putative nitrate transport protein  34.15 
 
 		 491 aa  199  6e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1263  nitrate transporter component, nrtA  40.18 
 
 		 403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  39.18 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2972  nitrate transporter component, nrtA  39.24 
 
 		 402 aa  193  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1152  nitrate transporter, putative  33.24 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1084  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system  34.34 
 
 		 467 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3316  putative nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein  32.79 
 
 		 461 aa  183  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163343  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1969  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transporter, substrate binding protein  31.96 
 
 		 457 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0919  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.84 
 
 		 398 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3039  putative nitrate transport protein  39.24 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.58476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1153  nitrate transporter system, periplasmic component  30.6 
 
 		 461 aa  179  8e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3446  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  37.87 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1662  periplasmic binding protein-like II  35.94 
 
 		 392 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.429682  hitchhiker  0.00361023 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  32.04 
 
 		 454 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1133  nitrate transporter, putative  36.99 
 
 		 406 aa  176  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226657  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5674  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.48 
 
 		 383 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.679378 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2417  putative nitrate transport protein  31.51 
 
 		 466 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.59 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4404  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  40.06 
 
 		 347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.116895 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3040  putative nitrate transport protein  31.77 
 
 		 452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0757013  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3941  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  40.06 
 
 		 347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0774649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001607  nitrate ABC transporter nitrate-binding protein  31.42 
 
 		 449 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  31.09 
 
 		 433 aa  169  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4511  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  39.81 
 
 		 353 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000302779  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1091  putative regulatory protein NasS  38.79 
 
 		 353 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1663  periplasmic binding protein-like II  31.78 
 
 		 455 aa  169  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550763  normal  0.0123781 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05588  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic component  31.42 
 
 		 454 aa  169  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3857  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  39.68 
 
 		 350 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0089  putative regulatory protein NasS  38.79 
 
 		 353 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.964988  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0332  putative regulatory protein NasS  38.79 
 
 		 353 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0240199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1257  putative regulatory protein NasS  38.79 
 
 		 353 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0276079  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5793  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  39.68 
 
 		 350 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1166  regulatory protein NasS, putative  43.14 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241228  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1734  nitrate transporter, putative  36.36 
 
 		 361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03654  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  29.97 
 
 		 469 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2819  putative nitrate transport protein  31.06 
 
 		 469 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.469609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1339  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  37.46 
 
 		 353 aa  165  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2264  histidine kinase  29.86 
 
 		 470 aa  165  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00574253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1760  putative regulatory protein  38.48 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4143  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  39.75 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553251 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  31.4 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  32.16 
 
 		 414 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3769  nitrate transporter, putative  35.67 
 
 		 407 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0247  nitrate transport ATP-binding protein  41.96 
 
 		 353 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  30.5 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1672  putative regulatory protein  41.96 
 
 		 353 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.18 
 
 		 669 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  31.86 
 
 		 414 aa  160  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  30.81 
 
 		 414 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  32.97 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  30.12 
 
 		 425 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  35.42 
 
 		 423 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  31.47 
 
 		 407 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  32.55 
 
 		 427 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  31.1 
 
 		 414 aa  155  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.18 
 
 		 668 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.18 
 
 		 668 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  33.23 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  31.95 
 
 		 417 aa  153  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  30.99 
 
 		 426 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  35.53 
 
 		 418 aa  152  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.27 
 
 		 668 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  37.32 
 
 		 419 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  31.58 
 
 		 437 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.65 
 
 		 668 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  32.75 
 
 		 420 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  32.16 
 
 		 419 aa  149  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  32.46 
 
 		 419 aa  149  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  30.12 
 
 		 414 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  30.12 
 
 		 414 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  31.18 
 
 		 426 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4454  putative nitrate transport protein  37.98 
 
 		 390 aa  145  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  31.58 
 
 		 434 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  31.18 
 
 		 426 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  32.95 
 
 		 657 aa  145  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  35.67 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  30.75 
 
 		 443 aa  144  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  29.19 
 
 		 431 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>