271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0056 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  100 
 
 
405 aa  832    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  49.51 
 
 
407 aa  418  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  47.48 
 
 
417 aa  349  4e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  46.23 
 
 
414 aa  346  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  46.65 
 
 
423 aa  346  4e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  44.63 
 
 
433 aa  346  4e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  44.25 
 
 
417 aa  345  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  44.42 
 
 
437 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  43.52 
 
 
426 aa  342  5.999999999999999e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  45.5 
 
 
414 aa  342  9e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  43.52 
 
 
414 aa  342  9e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  44.34 
 
 
414 aa  342  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  43.52 
 
 
414 aa  341  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  46.42 
 
 
414 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  43.55 
 
 
420 aa  339  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  42.75 
 
 
418 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  44.55 
 
 
414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  43.93 
 
 
434 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  44.53 
 
 
414 aa  335  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  42.62 
 
 
425 aa  335  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  43.48 
 
 
426 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  43.48 
 
 
426 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  40.72 
 
 
419 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  41.4 
 
 
431 aa  316  6e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  41.87 
 
 
427 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  40.48 
 
 
419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1438  nitrate-binding proteint  42.31 
 
 
432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28551  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  40.34 
 
 
419 aa  313  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  43.39 
 
 
415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  37.84 
 
 
444 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  37.84 
 
 
444 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  38.03 
 
 
403 aa  295  9e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  37.44 
 
 
437 aa  292  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  37.03 
 
 
437 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  37.67 
 
 
404 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  37.67 
 
 
404 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  37.4 
 
 
403 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  37.93 
 
 
403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1612  nitrate-binding protein NasS  36.07 
 
 
400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.837424  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3527  nitrate transport protein  39 
 
 
442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1605  nitrate-binding protein NasS  37.4 
 
 
421 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  36.47 
 
 
432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  36.51 
 
 
440 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  37.93 
 
 
403 aa  280  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  35.29 
 
 
475 aa  279  5e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  38.28 
 
 
443 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  35.73 
 
 
431 aa  276  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  34.27 
 
 
438 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  36.83 
 
 
450 aa  276  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  36.18 
 
 
442 aa  272  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1166  regulatory protein NasS, putative  39.16 
 
 
353 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241228  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  35.51 
 
 
430 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  35.25 
 
 
430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3518  hypothetical protein  36.07 
 
 
402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  35.25 
 
 
430 aa  270  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41480  hypothetical protein  35.37 
 
 
402 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1091  putative regulatory protein NasS  39.27 
 
 
353 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  35.32 
 
 
434 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0332  putative regulatory protein NasS  39.27 
 
 
353 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0240199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1257  putative regulatory protein NasS  39.27 
 
 
353 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0276079  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0089  putative regulatory protein NasS  39.27 
 
 
353 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.964988  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  33.41 
 
 
467 aa  269  8e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1760  putative regulatory protein  38.97 
 
 
353 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1672  putative regulatory protein  39.27 
 
 
353 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0247  nitrate transport ATP-binding protein  39.27 
 
 
353 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4540  twin-arginine translocation pathway signal  37.4 
 
 
440 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3446  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  34.49 
 
 
380 aa  252  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.07 
 
 
669 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  34.48 
 
 
385 aa  249  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  35.11 
 
 
668 aa  249  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3941  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  38.32 
 
 
347 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0774649  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4404  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  38.32 
 
 
347 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.116895 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  33.01 
 
 
432 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3857  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  37.69 
 
 
350 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4511  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  37.69 
 
 
353 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000302779  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5674  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.87 
 
 
383 aa  240  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.679378 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5793  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  37.38 
 
 
350 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2596  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  33 
 
 
457 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1339  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.5 
 
 
353 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3521  bicarbonate transport system substrate-binding protein  33 
 
 
457 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4143  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  38.41 
 
 
347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0553251 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3656  twin-arginine translocation pathway signal  32.54 
 
 
427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.78 
 
 
673 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4925  bicarbonate transport system substrate-binding protein  31.8 
 
 
454 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.794472  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.03 
 
 
668 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.03 
 
 
668 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.33 
 
 
669 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.33 
 
 
669 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  31.46 
 
 
382 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5899  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  33.16 
 
 
423 aa  222  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3676  twin-arginine translocation pathway signal  31.5 
 
 
467 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3730  nitrate transporter  31.5 
 
 
467 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0457947  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2403  ABC transporter nitrate-binding protein  31.41 
 
 
462 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0310148  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1969  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transporter, substrate binding protein  32.36 
 
 
457 aa  219  8.999999999999998e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4678  ABC-type bicarbonate transport system substrate-binding protein  30.96 
 
 
452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  32.15 
 
 
435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5415  putative nitrate ABC transporter (substrate-binding protein) (ntrA-like protein)  31.74 
 
 
461 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2820  nitrate transporter  32.28 
 
 
397 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.694753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1449  nitrate transporter component, nrtA  31.58 
 
 
403 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2054  twin-arginine translocation pathway signal  31.18 
 
 
462 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>