216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0237 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  91.55 
 
 
420 aa  807    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  74.06 
 
 
425 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  86.42 
 
 
437 aa  737    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  74.08 
 
 
414 aa  642    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  72.38 
 
 
414 aa  641    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  72.86 
 
 
414 aa  635    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  86.42 
 
 
434 aa  733    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  99.53 
 
 
426 aa  868    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  77.06 
 
 
414 aa  635    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  73.35 
 
 
414 aa  634    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  74.08 
 
 
414 aa  641    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  70.69 
 
 
431 aa  652    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  100 
 
 
426 aa  870    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  70.17 
 
 
414 aa  622  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  70.9 
 
 
426 aa  622  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  71.95 
 
 
423 aa  609  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  72.68 
 
 
417 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  68.67 
 
 
417 aa  600  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  67.15 
 
 
414 aa  585  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  65.37 
 
 
419 aa  572  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  63.26 
 
 
433 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  62.95 
 
 
419 aa  560  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  63.42 
 
 
419 aa  558  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  63.94 
 
 
418 aa  557  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1438  nitrate-binding proteint  65.25 
 
 
432 aa  547  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28551  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  62.29 
 
 
427 aa  547  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  56.66 
 
 
403 aa  472  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  55.69 
 
 
415 aa  465  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  55.24 
 
 
403 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  54.97 
 
 
403 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  54.83 
 
 
403 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  55.58 
 
 
440 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  54.05 
 
 
404 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  53.79 
 
 
404 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41480  hypothetical protein  53.57 
 
 
402 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1605  nitrate-binding protein NasS  52.74 
 
 
421 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1612  nitrate-binding protein NasS  52.74 
 
 
400 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.837424  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3518  hypothetical protein  52.04 
 
 
402 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  47.18 
 
 
385 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3446  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  46.07 
 
 
380 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5674  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  46.38 
 
 
383 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.679378 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0247  nitrate transport ATP-binding protein  48.7 
 
 
353 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1166  regulatory protein NasS, putative  48.39 
 
 
353 aa  341  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1672  putative regulatory protein  48.7 
 
 
353 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  44.96 
 
 
407 aa  337  3.9999999999999995e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1760  putative regulatory protein  47.54 
 
 
353 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  43.48 
 
 
405 aa  334  1e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1091  putative regulatory protein NasS  47.54 
 
 
353 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0089  putative regulatory protein NasS  47.54 
 
 
353 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.964988  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0332  putative regulatory protein NasS  47.54 
 
 
353 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0240199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1257  putative regulatory protein NasS  47.54 
 
 
353 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0276079  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1339  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  46.18 
 
 
353 aa  316  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4511  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  48.11 
 
 
353 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000302779  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5793  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  48.11 
 
 
350 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3857  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  48.11 
 
 
350 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4404  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  48.28 
 
 
347 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.116895 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3941  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  47.8 
 
 
347 aa  312  9e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0774649  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4143  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  46.63 
 
 
347 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0553251 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  37.25 
 
 
467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  41.78 
 
 
437 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  41.55 
 
 
437 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  40.7 
 
 
430 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  38.88 
 
 
432 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  40.66 
 
 
444 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  40.66 
 
 
444 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  40.72 
 
 
430 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  39.67 
 
 
430 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  38.73 
 
 
475 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  39.85 
 
 
442 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  39.8 
 
 
431 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  41.41 
 
 
443 aa  263  4.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  39.09 
 
 
434 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  38.55 
 
 
450 aa  262  8.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.76 
 
 
669 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  38.35 
 
 
438 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3527  nitrate transport protein  39.39 
 
 
442 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  36.39 
 
 
432 aa  246  6e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.07 
 
 
673 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.82 
 
 
668 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.82 
 
 
668 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4540  twin-arginine translocation pathway signal  37.82 
 
 
440 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  35.31 
 
 
668 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5415  putative nitrate ABC transporter (substrate-binding protein) (ntrA-like protein)  35.18 
 
 
461 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.04 
 
 
669 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.04 
 
 
669 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4663  ABC transporter nitrate-binding protein  34.38 
 
 
453 aa  232  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2403  ABC transporter nitrate-binding protein  33.66 
 
 
462 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0310148  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0964  putative nitrate transporter component  33.25 
 
 
486 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.511943 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2054  twin-arginine translocation pathway signal  34.3 
 
 
462 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2589  putative nitrate transporter component  32.3 
 
 
475 aa  230  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1307  ABC transporter nitrate-binding protein  33.41 
 
 
453 aa  229  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.870256  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0292  ABC transporter nitrate-binding protein  33.5 
 
 
451 aa  229  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1148  ABC transporter nitrate-binding protein  33.41 
 
 
453 aa  229  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294193  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0997  ABC transporter nitrate-binding protein  34.3 
 
 
457 aa  229  7e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  34.28 
 
 
460 aa  229  8e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3656  twin-arginine translocation pathway signal  32.55 
 
 
427 aa  229  9e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  33.49 
 
 
457 aa  228  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3774  putative nitrate transporter component, NrtA  34.07 
 
 
454 aa  226  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.944319  normal  0.102556 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03654  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  32.89 
 
 
469 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1115  putative nitrate transport protein  33.77 
 
 
491 aa  224  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>