276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0589 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  100 
 
 		 432 aa  879    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  56.56 
 
 		 467 aa  501  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2417  putative nitrate transport protein  42.73 
 
 		 466 aa  345  6e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2264  histidine kinase  44.68 
 
 		 470 aa  344  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00574253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03654  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  43.35 
 
 		 469 aa  344  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2819  putative nitrate transport protein  42.63 
 
 		 469 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.469609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1115  putative nitrate transport protein  43.22 
 
 		 491 aa  338  9.999999999999999e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05588  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic component  43.29 
 
 		 454 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1153  nitrate transporter system, periplasmic component  42.76 
 
 		 461 aa  335  9e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1133  nitrate transporter, putative  46.97 
 
 		 406 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226657  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  44.68 
 
 		 454 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001607  nitrate ABC transporter nitrate-binding protein  43.06 
 
 		 449 aa  333  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  47.28 
 
 		 382 aa  333  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1084  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system  42.79 
 
 		 467 aa  332  9e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3316  putative nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein  42.26 
 
 		 461 aa  331  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163343  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1152  nitrate transporter, putative  44.86 
 
 		 382 aa  330  3e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1663  periplasmic binding protein-like II  44.34 
 
 		 455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550763  normal  0.0123781 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3040  putative nitrate transport protein  46.24 
 
 		 452 aa  323  3e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0757013  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1449  nitrate transporter component, nrtA  45.5 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1969  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transporter, substrate binding protein  41.24 
 
 		 457 aa  316  5e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1085  nitrate transporter component, nrtA  44.86 
 
 		 415 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2820  nitrate transporter  45.29 
 
 		 397 aa  309  6.999999999999999e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.694753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.83 
 
 		 669 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1631  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  43.55 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3769  nitrate transporter, putative  41.97 
 
 		 407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1454  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  41.42 
 
 		 425 aa  296  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.56 
 
 		 668 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5899  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  39.47 
 
 		 423 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1704  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  40.1 
 
 		 410 aa  290  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  37.5 
 
 		 431 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1662  periplasmic binding protein-like II  39.02 
 
 		 392 aa  286  7e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.429682  hitchhiker  0.00361023 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  38.98 
 
 		 435 aa  285  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.23 
 
 		 668 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.23 
 
 		 668 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  37.1 
 
 		 433 aa  279  7e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2528  nitrate transporter, putative  43.63 
 
 		 370 aa  276  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  37.5 
 
 		 450 aa  275  9e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1263  nitrate transporter component, nrtA  39.6 
 
 		 403 aa  273  5.000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  37.5 
 
 		 423 aa  272  9e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  37.79 
 
 		 657 aa  272  9e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  35.97 
 
 		 434 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0919  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.85 
 
 		 398 aa  269  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4228  putative nitrate transport protein  39.16 
 
 		 386 aa  269  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0904389  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  35.87 
 
 		 430 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2505  putative nitrate transport protein  41.85 
 
 		 377 aa  268  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  35.87 
 
 		 430 aa  267  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  35.66 
 
 		 442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  35.63 
 
 		 430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  36.6 
 
 		 419 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  35.71 
 
 		 418 aa  263  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  33.01 
 
 		 405 aa  262  1e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  35.47 
 
 		 419 aa  262  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  35.59 
 
 		 437 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  35.22 
 
 		 419 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  36.39 
 
 		 426 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  36.39 
 
 		 426 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4138  putative nitrate transporter component, nrtA  40.57 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  35.06 
 
 		 437 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  36.14 
 
 		 420 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1605  nitrate-binding protein NasS  37.84 
 
 		 421 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1761  nitrate transporter component, nrtA  38.67 
 
 		 386 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.786473  normal  0.0141893 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  33.83 
 
 		 425 aa  259  7e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  35.35 
 
 		 437 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  35.64 
 
 		 414 aa  259  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4373  nitrate transport protein, NrtC like protein  34.33 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  37.59 
 
 		 404 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  35.56 
 
 		 434 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1612  nitrate-binding protein NasS  38.08 
 
 		 400 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.837424  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  34.49 
 
 		 431 aa  255  8e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4435  nitrate transporter, putative  34.1 
 
 		 461 aa  256  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.210676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3527  nitrate transport protein  34.75 
 
 		 442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  37.35 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  34 
 
 		 417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  34.29 
 
 		 438 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  33.42 
 
 		 414 aa  254  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1210  putative nitrate transporter component, nrtA  41.74 
 
 		 387 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  35.64 
 
 		 427 aa  253  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3730  nitrate transporter  33.49 
 
 		 467 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0457947  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  38.1 
 
 		 673 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  36.36 
 
 		 403 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  35.73 
 
 		 415 aa  252  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.2 
 
 		 669 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  37.59 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  41.44 
 
 		 385 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3676  twin-arginine translocation pathway signal  33.57 
 
 		 467 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  35.64 
 
 		 414 aa  252  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  37.32 
 
 		 669 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  32.67 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1438  nitrate-binding proteint  37.19 
 
 		 432 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28551  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  36.1 
 
 		 475 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3656  twin-arginine translocation pathway signal  33.17 
 
 		 427 aa  249  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  34.12 
 
 		 444 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  34.12 
 
 		 444 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  36.12 
 
 		 403 aa  249  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  36.52 
 
 		 403 aa  249  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  38.22 
 
 		 663 aa  249  6e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3518  hypothetical protein  39.31 
 
 		 402 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  34.75 
 
 		 443 aa  249  7e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  34 
 
 		 414 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  34 
 
 		 414 aa  247  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>