216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0381 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  100 
 
 		 420 aa  859    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  72.66 
 
 		 425 aa  648    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  85.01 
 
 		 437 aa  734    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  91.08 
 
 		 426 aa  805    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  72.91 
 
 		 414 aa  634    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  85.75 
 
 		 434 aa  735    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  73.11 
 
 		 431 aa  662    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  91.55 
 
 		 426 aa  807    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  72.41 
 
 		 414 aa  631  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  76.29 
 
 		 414 aa  631  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  72.41 
 
 		 414 aa  630  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  72.41 
 
 		 414 aa  629  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  72.41 
 
 		 414 aa  629  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  71.92 
 
 		 414 aa  623  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  70.43 
 
 		 426 aa  620  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  74.1 
 
 		 423 aa  611  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  68.97 
 
 		 417 aa  598  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  69.88 
 
 		 417 aa  600  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  67.15 
 
 		 414 aa  578  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  66.5 
 
 		 419 aa  572  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  65.39 
 
 		 418 aa  564  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  62.59 
 
 		 433 aa  565  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  64.51 
 
 		 419 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  64.03 
 
 		 419 aa  557  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1438  nitrate-binding proteint  66.19 
 
 		 432 aa  557  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28551  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  62.56 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  57.56 
 
 		 415 aa  471  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  56.14 
 
 		 403 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  55.61 
 
 		 403 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  56.36 
 
 		 440 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  55.35 
 
 		 404 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  55.24 
 
 		 403 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  54.97 
 
 		 403 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  55.09 
 
 		 404 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1605  nitrate-binding protein NasS  54.05 
 
 		 421 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1612  nitrate-binding protein NasS  54.05 
 
 		 400 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.837424  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41480  hypothetical protein  54.68 
 
 		 402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3518  hypothetical protein  53.42 
 
 		 402 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  48.26 
 
 		 385 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5674  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  46.65 
 
 		 383 aa  345  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.679378 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3446  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  46.34 
 
 		 380 aa  345  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  46.67 
 
 		 407 aa  343  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  43.55 
 
 		 405 aa  339  4e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0247  nitrate transport ATP-binding protein  48.99 
 
 		 353 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1166  regulatory protein NasS, putative  48.68 
 
 		 353 aa  335  9e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1672  putative regulatory protein  48.99 
 
 		 353 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1760  putative regulatory protein  47.83 
 
 		 353 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1091  putative regulatory protein NasS  47.83 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0089  putative regulatory protein NasS  47.83 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.964988  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0332  putative regulatory protein NasS  47.83 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0240199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1257  putative regulatory protein NasS  47.83 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0276079  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1339  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  47.65 
 
 		 353 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3941  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  46.33 
 
 		 347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0774649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4404  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  46.33 
 
 		 347 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.116895 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4511  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  48.28 
 
 		 353 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000302779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4143  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  47.21 
 
 		 347 aa  305  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553251 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3857  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  48.28 
 
 		 350 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5793  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  48.28 
 
 		 350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  37.03 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  40.66 
 
 		 437 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  40.43 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  39.77 
 
 		 475 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  40.45 
 
 		 430 aa  270  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  40.72 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  40.72 
 
 		 430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  38.92 
 
 		 432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  40.3 
 
 		 431 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  40.15 
 
 		 444 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  40.15 
 
 		 444 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  39.09 
 
 		 442 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  38.23 
 
 		 434 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  40.95 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.63 
 
 		 669 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  38.5 
 
 		 450 aa  259  7e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  38.35 
 
 		 438 aa  259  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3527  nitrate transport protein  39.14 
 
 		 442 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.7 
 
 		 673 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  36.14 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  35.6 
 
 		 668 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  35.6 
 
 		 668 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4540  twin-arginine translocation pathway signal  38.34 
 
 		 440 aa  242  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.41 
 
 		 668 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  35.54 
 
 		 669 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  35.54 
 
 		 669 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5415  putative nitrate ABC transporter (substrate-binding protein) (ntrA-like protein)  36.27 
 
 		 461 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  34.93 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0964  putative nitrate transporter component  33.9 
 
 		 486 aa  232  9e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.511943 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2054  twin-arginine translocation pathway signal  36.36 
 
 		 462 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  35.87 
 
 		 460 aa  229  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4663  ABC transporter nitrate-binding protein  35.59 
 
 		 453 aa  229  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3656  twin-arginine translocation pathway signal  32.94 
 
 		 427 aa  229  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2403  ABC transporter nitrate-binding protein  34.38 
 
 		 462 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0310148  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4818  ABC transporter nitrate-binding protein  36.24 
 
 		 456 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1148  ABC transporter nitrate-binding protein  34.38 
 
 		 453 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294193  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2589  putative nitrate transporter component  33.25 
 
 		 475 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200575 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1115  putative nitrate transport protein  33.55 
 
 		 491 aa  225  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1307  ABC transporter nitrate-binding protein  34.14 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.870256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0997  ABC transporter nitrate-binding protein  34.54 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2819  putative nitrate transport protein  32.75 
 
 		 469 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.469609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3316  putative nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein  34.4 
 
 		 461 aa  224  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>