223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3730 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0875  twin-arginine translocation pathway signal  68.33 
 
 		 480 aa  710    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0516063  hitchhiker  0.00230539 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3676  twin-arginine translocation pathway signal  99.79 
 
 		 467 aa  971    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3730  nitrate transporter  100 
 
 		 467 aa  973    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0457947  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0641  twin-arginine translocation pathway signal  70.59 
 
 		 477 aa  719    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1968  nitrate transport protein, NrtC like protein  37.56 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  35.58 
 
 		 467 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4373  nitrate transport protein, NrtC like protein  32.47 
 
 		 461 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4435  nitrate transporter, putative  33.65 
 
 		 461 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.210676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.81 
 
 		 668 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.9 
 
 		 669 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  33.98 
 
 		 657 aa  245  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.85 
 
 		 669 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.85 
 
 		 669 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  33.33 
 
 		 418 aa  240  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.54 
 
 		 668 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.54 
 
 		 668 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  33.49 
 
 		 432 aa  237  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  34.22 
 
 		 667 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.2 
 
 		 673 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  32.78 
 
 		 433 aa  230  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.07 
 
 		 668 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  31.28 
 
 		 419 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  32.09 
 
 		 427 aa  224  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  31.71 
 
 		 663 aa  223  6e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  30.84 
 
 		 419 aa  223  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  31.5 
 
 		 405 aa  219  7e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  32.43 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  31.03 
 
 		 420 aa  217  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  32.53 
 
 		 415 aa  217  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  30.88 
 
 		 426 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  30.88 
 
 		 426 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  29.31 
 
 		 437 aa  213  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  30.94 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1438  nitrate-binding proteint  31.19 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28551  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  30.05 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  29.36 
 
 		 419 aa  210  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  30.47 
 
 		 417 aa  210  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  30.15 
 
 		 425 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  30.88 
 
 		 414 aa  207  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  28.64 
 
 		 403 aa  206  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  32.66 
 
 		 407 aa  206  9e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  30.64 
 
 		 414 aa  206  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  27.99 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  30.37 
 
 		 414 aa  204  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  30.62 
 
 		 414 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  27.27 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  30.64 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  31.36 
 
 		 475 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  29.38 
 
 		 414 aa  200  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  29.14 
 
 		 431 aa  200  6e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.14 
 
 		 404 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  29.38 
 
 		 414 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  28.85 
 
 		 437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  31.13 
 
 		 414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  29.98 
 
 		 437 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  30.77 
 
 		 432 aa  197  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  29.98 
 
 		 414 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  28.64 
 
 		 404 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  30.24 
 
 		 430 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  30.24 
 
 		 430 aa  195  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 		 430 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  29.22 
 
 		 442 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0964  putative nitrate transporter component  31.35 
 
 		 486 aa  193  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.511943 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  28.16 
 
 		 440 aa  193  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  30.34 
 
 		 454 aa  193  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  27.95 
 
 		 431 aa  192  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  28.4 
 
 		 434 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1969  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transporter, substrate binding protein  29.47 
 
 		 457 aa  192  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  27.4 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  27.4 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  28.88 
 
 		 438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  29.17 
 
 		 450 aa  190  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41480  hypothetical protein  29.73 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1605  nitrate-binding protein NasS  28.47 
 
 		 421 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3518  hypothetical protein  29.98 
 
 		 402 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2596  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  28.28 
 
 		 457 aa  186  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3521  bicarbonate transport system substrate-binding protein  28.28 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1612  nitrate-binding protein NasS  27.65 
 
 		 400 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.837424  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2417  putative nitrate transport protein  30.04 
 
 		 466 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1115  putative nitrate transport protein  29.04 
 
 		 491 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1084  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system  30.41 
 
 		 467 aa  182  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4678  ABC-type bicarbonate transport system substrate-binding protein  27.64 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2403  ABC transporter nitrate-binding protein  30.69 
 
 		 462 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0310148  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3487  putative nitrate transporter component, nrtA  30.45 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  31.77 
 
 		 457 aa  180  5.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2264  histidine kinase  30.13 
 
 		 470 aa  179  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00574253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2819  putative nitrate transport protein  29.68 
 
 		 469 aa  179  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.469609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  29.76 
 
 		 382 aa  179  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05588  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic component  28.96 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1663  periplasmic binding protein-like II  28.72 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550763  normal  0.0123781 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2589  putative nitrate transporter component  29.53 
 
 		 475 aa  178  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.78 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2107  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  29.53 
 
 		 529 aa  177  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.287431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4925  bicarbonate transport system substrate-binding protein  28.75 
 
 		 454 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.794472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1488  membrane protein  27.18 
 
 		 450 aa  176  7e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.976236 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2054  twin-arginine translocation pathway signal  30.05 
 
 		 462 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1133  nitrate transporter, putative  28.17 
 
 		 406 aa  176  7e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226657  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3656  twin-arginine translocation pathway signal  27.54 
 
 		 427 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001607  nitrate ABC transporter nitrate-binding protein  28.73 
 
 		 449 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0997  ABC transporter nitrate-binding protein  28.79 
 
 		 457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>