221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_23460 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  100 
 
 		 440 aa  902    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  74.87 
 
 		 403 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  71.78 
 
 		 403 aa  600  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41480  hypothetical protein  71.6 
 
 		 402 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3518  hypothetical protein  73.13 
 
 		 402 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  68.89 
 
 		 403 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  68.61 
 
 		 404 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  68.38 
 
 		 403 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  68.35 
 
 		 404 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1612  nitrate-binding protein NasS  68.72 
 
 		 400 aa  564  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.837424  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1605  nitrate-binding protein NasS  67.59 
 
 		 421 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  65.27 
 
 		 427 aa  541  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  56.36 
 
 		 420 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  55.58 
 
 		 426 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  55.58 
 
 		 426 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  55.87 
 
 		 419 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  55.47 
 
 		 418 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  53.65 
 
 		 433 aa  455  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  55.87 
 
 		 419 aa  455  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  56.25 
 
 		 419 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  54.57 
 
 		 423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  50.95 
 
 		 425 aa  451  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  53.37 
 
 		 437 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  53.12 
 
 		 434 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1438  nitrate-binding proteint  55.73 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28551  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  51.69 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  51.17 
 
 		 414 aa  431  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  52.74 
 
 		 426 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  50.39 
 
 		 414 aa  428  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  50.52 
 
 		 417 aa  426  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  50.91 
 
 		 417 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  50.13 
 
 		 414 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  49.35 
 
 		 414 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  52.51 
 
 		 414 aa  424  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  52.51 
 
 		 414 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  50.79 
 
 		 414 aa  418  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  50.13 
 
 		 414 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  52.86 
 
 		 415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3446  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  47.11 
 
 		 380 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  48.14 
 
 		 385 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5674  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  46.54 
 
 		 383 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.679378 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1091  putative regulatory protein NasS  48.44 
 
 		 353 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0089  putative regulatory protein NasS  48.44 
 
 		 353 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.964988  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0332  putative regulatory protein NasS  48.44 
 
 		 353 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0240199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1257  putative regulatory protein NasS  48.44 
 
 		 353 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0276079  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1672  putative regulatory protein  48.73 
 
 		 353 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0247  nitrate transport ATP-binding protein  48.73 
 
 		 353 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1166  regulatory protein NasS, putative  48.83 
 
 		 353 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241228  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1760  putative regulatory protein  48.16 
 
 		 353 aa  312  9e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1339  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  49.14 
 
 		 353 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3941  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  49.86 
 
 		 347 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0774649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4404  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  50.63 
 
 		 347 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.116895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3857  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  49.37 
 
 		 350 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4511  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  49.37 
 
 		 353 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000302779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5793  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  49.37 
 
 		 350 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4143  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  49.69 
 
 		 347 aa  288  9e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553251 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  36.51 
 
 		 405 aa  281  2e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  38.96 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  38.83 
 
 		 669 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  35.42 
 
 		 467 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  37.41 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  37.62 
 
 		 437 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  35.26 
 
 		 432 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  36.06 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  35.81 
 
 		 431 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  36.06 
 
 		 430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  36.32 
 
 		 450 aa  240  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  35.81 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  36.34 
 
 		 434 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  35.35 
 
 		 442 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  33.57 
 
 		 444 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  33.57 
 
 		 444 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  34.36 
 
 		 438 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.93 
 
 		 668 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3527  nitrate transport protein  34.85 
 
 		 442 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  36.36 
 
 		 432 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  34.94 
 
 		 475 aa  227  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.34 
 
 		 668 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.34 
 
 		 668 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  34.92 
 
 		 443 aa  224  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  37.97 
 
 		 382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4540  twin-arginine translocation pathway signal  32.99 
 
 		 440 aa  219  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  35.03 
 
 		 657 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  35.9 
 
 		 669 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  35.9 
 
 		 669 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1084  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system  33.33 
 
 		 467 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03654  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  31.82 
 
 		 469 aa  209  8e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2417  putative nitrate transport protein  31.35 
 
 		 466 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05588  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic component  30.99 
 
 		 454 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.17 
 
 		 673 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  33.18 
 
 		 454 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001607  nitrate ABC transporter nitrate-binding protein  30.99 
 
 		 449 aa  207  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  35.28 
 
 		 435 aa  206  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  35.79 
 
 		 668 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  34.01 
 
 		 663 aa  205  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3656  twin-arginine translocation pathway signal  30.99 
 
 		 427 aa  205  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1153  nitrate transporter system, periplasmic component  30.59 
 
 		 461 aa  203  4e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2819  putative nitrate transport protein  30.33 
 
 		 469 aa  202  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.469609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2528  nitrate transporter, putative  39.08 
 
 		 370 aa  200  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4818  ABC transporter nitrate-binding protein  34.79 
 
 		 456 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>