217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4925 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3521  bicarbonate transport system substrate-binding protein  76.16 
 
 		 457 aa  715    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2596  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  76.38 
 
 		 457 aa  718    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4925  bicarbonate transport system substrate-binding protein  100 
 
 		 454 aa  924    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.794472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1027  bicarbonate transport system substrate-binding protein  68.41 
 
 		 458 aa  587  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4678  ABC-type bicarbonate transport system substrate-binding protein  62.25 
 
 		 452 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1488  membrane protein  58.85 
 
 		 450 aa  520  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.976236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  51.89 
 
 		 442 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  50.55 
 
 		 444 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  50.55 
 
 		 444 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3527  nitrate transport protein  48.32 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  48.25 
 
 		 443 aa  420  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  49.88 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  51.26 
 
 		 438 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  49.38 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  50.12 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  49.49 
 
 		 430 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  49.49 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  49.87 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  47.78 
 
 		 434 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  45.17 
 
 		 475 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  48.66 
 
 		 450 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4540  twin-arginine translocation pathway signal  46.22 
 
 		 440 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3656  twin-arginine translocation pathway signal  42.92 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  34.99 
 
 		 433 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  31.29 
 
 		 467 aa  231  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  31.8 
 
 		 405 aa  231  3e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  34.3 
 
 		 415 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  34 
 
 		 419 aa  227  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.34 
 
 		 668 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.25 
 
 		 669 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  34.29 
 
 		 419 aa  224  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  33.65 
 
 		 657 aa  223  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.99 
 
 		 668 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  33.92 
 
 		 423 aa  217  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.53 
 
 		 673 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.02 
 
 		 669 aa  216  9e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.02 
 
 		 669 aa  216  9e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  33.11 
 
 		 427 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  32.52 
 
 		 418 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  32.15 
 
 		 419 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  31.93 
 
 		 425 aa  206  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  33.57 
 
 		 432 aa  205  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  33.25 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  33.25 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  30 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  31.13 
 
 		 663 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  31.59 
 
 		 667 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  33 
 
 		 426 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  29.56 
 
 		 668 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  29.56 
 
 		 668 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1438  nitrate-binding proteint  32.59 
 
 		 432 aa  200  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28551  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  31.61 
 
 		 426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  32.75 
 
 		 434 aa  196  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  30.18 
 
 		 414 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  33.25 
 
 		 437 aa  196  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  31.65 
 
 		 414 aa  196  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  31.13 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  31.35 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1968  nitrate transport protein, NrtC like protein  28.29 
 
 		 444 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  31.35 
 
 		 414 aa  194  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  30.87 
 
 		 414 aa  193  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  31.83 
 
 		 417 aa  192  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  28.78 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1605  nitrate-binding protein NasS  29.63 
 
 		 421 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  29.67 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  30.43 
 
 		 431 aa  188  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  28.78 
 
 		 403 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.51 
 
 		 404 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4663  ABC transporter nitrate-binding protein  32.83 
 
 		 453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  31.91 
 
 		 417 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  30.2 
 
 		 440 aa  186  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  31.72 
 
 		 414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1454  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  30.63 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4373  nitrate transport protein, NrtC like protein  27.91 
 
 		 461 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  30.27 
 
 		 404 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1148  ABC transporter nitrate-binding protein  31.49 
 
 		 453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294193  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1307  ABC transporter nitrate-binding protein  31.19 
 
 		 453 aa  182  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.870256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0964  putative nitrate transporter component  29.4 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.511943 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2107  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  30.89 
 
 		 529 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.287431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0641  twin-arginine translocation pathway signal  28.25 
 
 		 477 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4435  nitrate transporter, putative  27.7 
 
 		 461 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.210676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  29.8 
 
 		 382 aa  180  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1969  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transporter, substrate binding protein  28.63 
 
 		 457 aa  179  7e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  30.22 
 
 		 414 aa  179  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3730  nitrate transporter  29.33 
 
 		 467 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0457947  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3676  twin-arginine translocation pathway signal  29.33 
 
 		 467 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2403  ABC transporter nitrate-binding protein  31.78 
 
 		 462 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0310148  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1612  nitrate-binding protein NasS  29.51 
 
 		 400 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.837424  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.2 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3518  hypothetical protein  30.2 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2054  twin-arginine translocation pathway signal  30.94 
 
 		 462 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41480  hypothetical protein  30.33 
 
 		 402 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1115  putative nitrate transport protein  28.13 
 
 		 491 aa  171  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1631  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  30.86 
 
 		 424 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4818  ABC transporter nitrate-binding protein  30.9 
 
 		 456 aa  170  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5415  putative nitrate ABC transporter (substrate-binding protein) (ntrA-like protein)  32 
 
 		 461 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3742  twin-arginine translocation pathway signal  30.4 
 
 		 467 aa  168  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1449  nitrate transporter component, nrtA  29.82 
 
 		 403 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0875  twin-arginine translocation pathway signal  27.81 
 
 		 480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0516063  hitchhiker  0.00230539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>