199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0875 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0875  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 480 aa  1000    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0516063  hitchhiker  0.00230539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0641  twin-arginine translocation pathway signal  68.32 
 
 		 477 aa  706    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3676  twin-arginine translocation pathway signal  68.54 
 
 		 467 aa  704    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3730  nitrate transporter  68.33 
 
 		 467 aa  701    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0457947  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1968  nitrate transport protein, NrtC like protein  33.62 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4373  nitrate transport protein, NrtC like protein  31.66 
 
 		 461 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  30.33 
 
 		 467 aa  251  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4435  nitrate transporter, putative  31.67 
 
 		 461 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.210676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.06 
 
 		 668 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.26 
 
 		 669 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  33.66 
 
 		 657 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.15 
 
 		 668 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.33 
 
 		 673 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.15 
 
 		 668 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.24 
 
 		 669 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.24 
 
 		 669 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  32.54 
 
 		 663 aa  229  7e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  33.49 
 
 		 667 aa  229  8e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  32.27 
 
 		 432 aa  229  9e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  32.78 
 
 		 418 aa  228  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.1 
 
 		 668 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  30.79 
 
 		 419 aa  211  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  33.02 
 
 		 420 aa  209  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  30.55 
 
 		 419 aa  209  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.15 
 
 		 427 aa  208  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  30.65 
 
 		 407 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  29.76 
 
 		 425 aa  205  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  30.75 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  31.83 
 
 		 434 aa  205  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  30.31 
 
 		 437 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  31.43 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  31.43 
 
 		 426 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  30.95 
 
 		 414 aa  202  9e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  30.34 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  29.98 
 
 		 433 aa  199  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1438  nitrate-binding proteint  32.13 
 
 		 432 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28551  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  30.14 
 
 		 414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  30.14 
 
 		 414 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  30.14 
 
 		 414 aa  196  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  29.98 
 
 		 426 aa  196  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  29.58 
 
 		 450 aa  196  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  31.1 
 
 		 414 aa  196  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  28.95 
 
 		 438 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  29.83 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  28.42 
 
 		 437 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  28.27 
 
 		 417 aa  194  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  30.14 
 
 		 414 aa  194  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  30.95 
 
 		 414 aa  194  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  29.43 
 
 		 414 aa  194  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  29.43 
 
 		 417 aa  193  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  29.55 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  29.06 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.43 
 
 		 404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  29.11 
 
 		 434 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  29.24 
 
 		 431 aa  191  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  28.74 
 
 		 431 aa  190  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  29.22 
 
 		 437 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  28.95 
 
 		 404 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  27.79 
 
 		 430 aa  188  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  28.45 
 
 		 442 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  27.55 
 
 		 430 aa  186  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  27.55 
 
 		 430 aa  186  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  27.34 
 
 		 403 aa  186  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  28.13 
 
 		 403 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41480  hypothetical protein  29.32 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  28.6 
 
 		 444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  28.6 
 
 		 444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2589  putative nitrate transporter component  27.99 
 
 		 475 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  28.4 
 
 		 440 aa  183  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  27.87 
 
 		 460 aa  183  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1612  nitrate-binding protein NasS  27.97 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.837424  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  28.42 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  29.89 
 
 		 475 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  27.96 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2403  ABC transporter nitrate-binding protein  29.24 
 
 		 462 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0310148  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3518  hypothetical protein  28.77 
 
 		 402 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3487  putative nitrate transporter component, nrtA  28.69 
 
 		 464 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1605  nitrate-binding protein NasS  27.99 
 
 		 421 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2054  twin-arginine translocation pathway signal  29.66 
 
 		 462 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0964  putative nitrate transporter component  27.91 
 
 		 486 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.511943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  28.67 
 
 		 382 aa  176  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3521  bicarbonate transport system substrate-binding protein  27.09 
 
 		 457 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2596  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  27.09 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1488  membrane protein  26.43 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.976236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4678  ABC-type bicarbonate transport system substrate-binding protein  26.83 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  27.54 
 
 		 454 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1027  bicarbonate transport system substrate-binding protein  28.07 
 
 		 458 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1115  putative nitrate transport protein  26.69 
 
 		 491 aa  170  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3446  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  29.51 
 
 		 380 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3972  ABC transporter nitrate-binding protein  27.8 
 
 		 471 aa  169  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5415  putative nitrate ABC transporter (substrate-binding protein) (ntrA-like protein)  28.23 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001607  nitrate ABC transporter nitrate-binding protein  28.06 
 
 		 449 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0292  ABC transporter nitrate-binding protein  27.41 
 
 		 451 aa  167  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.89 
 
 		 403 aa  167  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  29.11 
 
 		 385 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1153  nitrate transporter system, periplasmic component  26.97 
 
 		 461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0997  ABC transporter nitrate-binding protein  28.85 
 
 		 457 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4925  bicarbonate transport system substrate-binding protein  27.61 
 
 		 454 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.794472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2819  putative nitrate transport protein  28.7 
 
 		 469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.469609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05588  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic component  27.84 
 
 		 454 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>