261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4678 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4678  ABC-type bicarbonate transport system substrate-binding protein  100 
 
 		 452 aa  932    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2596  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  63.83 
 
 		 457 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3521  bicarbonate transport system substrate-binding protein  63.83 
 
 		 457 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1027  bicarbonate transport system substrate-binding protein  65.94 
 
 		 458 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1488  membrane protein  60.04 
 
 		 450 aa  552  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.976236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4925  bicarbonate transport system substrate-binding protein  62.39 
 
 		 454 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.794472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  47.44 
 
 		 442 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  48.22 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  48.22 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  45.67 
 
 		 443 aa  396  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3527  nitrate transport protein  45.76 
 
 		 442 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  44.72 
 
 		 437 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  44.72 
 
 		 437 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  49.87 
 
 		 430 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 		 430 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 		 431 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  45.15 
 
 		 432 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  49.5 
 
 		 430 aa  378  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  47.74 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4540  twin-arginine translocation pathway signal  44.86 
 
 		 440 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  47.12 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  47.62 
 
 		 450 aa  365  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3656  twin-arginine translocation pathway signal  40.62 
 
 		 427 aa  359  6e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  41.96 
 
 		 475 aa  345  6e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  35.73 
 
 		 419 aa  247  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  36.96 
 
 		 433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  35.73 
 
 		 419 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  35.04 
 
 		 419 aa  237  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  33.85 
 
 		 418 aa  237  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  34.94 
 
 		 423 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  35.04 
 
 		 415 aa  230  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  34.6 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  34.09 
 
 		 427 aa  223  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  30.53 
 
 		 467 aa  222  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  30.96 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1438  nitrate-binding proteint  34 
 
 		 432 aa  219  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28551  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.49 
 
 		 668 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.49 
 
 		 668 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  33.71 
 
 		 420 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31 
 
 		 668 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  33.58 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  33.11 
 
 		 417 aa  215  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  35.34 
 
 		 426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  35.34 
 
 		 426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  34.09 
 
 		 426 aa  213  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  33.84 
 
 		 414 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  32.06 
 
 		 414 aa  210  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  33.59 
 
 		 414 aa  209  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  33.25 
 
 		 437 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  32.59 
 
 		 657 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  33.75 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  34.18 
 
 		 414 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  32.59 
 
 		 414 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  30.27 
 
 		 669 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1968  nitrate transport protein, NrtC like protein  30 
 
 		 444 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  30.5 
 
 		 667 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  29.47 
 
 		 669 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  29.47 
 
 		 669 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  30.32 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  30.38 
 
 		 673 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  33.08 
 
 		 414 aa  203  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  28.44 
 
 		 432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  30.33 
 
 		 663 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  28.89 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  33.84 
 
 		 414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  31.57 
 
 		 431 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  32.24 
 
 		 414 aa  196  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  29.38 
 
 		 440 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  29.4 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  30.5 
 
 		 403 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  29.25 
 
 		 668 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.28 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1148  ABC transporter nitrate-binding protein  30.26 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294193  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4373  nitrate transport protein, NrtC like protein  28.09 
 
 		 461 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1307  ABC transporter nitrate-binding protein  30.04 
 
 		 453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.870256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3518  hypothetical protein  29.93 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4663  ABC transporter nitrate-binding protein  31.41 
 
 		 453 aa  184  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3730  nitrate transporter  28.81 
 
 		 467 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0457947  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1605  nitrate-binding protein NasS  29 
 
 		 421 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4435  nitrate transporter, putative  28.16 
 
 		 461 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.210676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  29.76 
 
 		 382 aa  183  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3676  twin-arginine translocation pathway signal  28.81 
 
 		 467 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41480  hypothetical protein  30 
 
 		 402 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0875  twin-arginine translocation pathway signal  27.44 
 
 		 480 aa  179  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0516063  hitchhiker  0.00230539 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  30.13 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1449  nitrate transporter component, nrtA  27.94 
 
 		 403 aa  178  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  28.82 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2403  ABC transporter nitrate-binding protein  31.14 
 
 		 462 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0310148  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.82 
 
 		 404 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1969  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transporter, substrate binding protein  28.72 
 
 		 457 aa  176  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0964  putative nitrate transporter component  29.22 
 
 		 486 aa  176  8e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.511943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1612  nitrate-binding protein NasS  28.43 
 
 		 400 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.837424  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2107  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  29.11 
 
 		 529 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.287431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2054  twin-arginine translocation pathway signal  30.89 
 
 		 462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3446  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  27.96 
 
 		 380 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2589  putative nitrate transporter component  27.58 
 
 		 475 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0641  twin-arginine translocation pathway signal  26.19 
 
 		 477 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3487  putative nitrate transporter component, nrtA  29.15 
 
 		 464 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4818  ABC transporter nitrate-binding protein  30.56 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5415  putative nitrate ABC transporter (substrate-binding protein) (ntrA-like protein)  30.9 
 
 		 461 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>