More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2172 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  100 
 
 
460 aa  956    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3487  putative nitrate transporter component, nrtA  62.09 
 
 
464 aa  625  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3742  twin-arginine translocation pathway signal  61.29 
 
 
467 aa  619  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0292  ABC transporter nitrate-binding protein  61.82 
 
 
451 aa  617  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0997  ABC transporter nitrate-binding protein  60.95 
 
 
457 aa  613  9.999999999999999e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3972  ABC transporter nitrate-binding protein  59.4 
 
 
471 aa  597  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  55.97 
 
 
457 aa  581  1.0000000000000001e-165  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5415  putative nitrate ABC transporter (substrate-binding protein) (ntrA-like protein)  54.95 
 
 
461 aa  542  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2054  twin-arginine translocation pathway signal  52.38 
 
 
462 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1148  ABC transporter nitrate-binding protein  57.05 
 
 
453 aa  535  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294193  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2403  ABC transporter nitrate-binding protein  52.6 
 
 
462 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0310148  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1307  ABC transporter nitrate-binding protein  56.18 
 
 
453 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.870256  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4663  ABC transporter nitrate-binding protein  56.52 
 
 
453 aa  528  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2589  putative nitrate transporter component  52.78 
 
 
475 aa  520  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200575 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4818  ABC transporter nitrate-binding protein  52.95 
 
 
456 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2617  ABC transporter nitrate-binding protein  54.5 
 
 
454 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0708468 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0964  putative nitrate transporter component  49.56 
 
 
486 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.511943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3774  putative nitrate transporter component, NrtA  49.22 
 
 
454 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.944319  normal  0.102556 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2107  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  43.43 
 
 
529 aa  353  2.9999999999999997e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.287431  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  35.34 
 
 
433 aa  237  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  35.87 
 
 
420 aa  229  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  34.28 
 
 
426 aa  229  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  34.28 
 
 
426 aa  229  9e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  36.04 
 
 
423 aa  227  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  35.02 
 
 
425 aa  223  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  34.41 
 
 
434 aa  223  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  35.83 
 
 
427 aa  223  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  33.5 
 
 
426 aa  222  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  30.45 
 
 
467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  33.66 
 
 
437 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  32.45 
 
 
417 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  34.02 
 
 
417 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.59 
 
 
669 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  33.33 
 
 
432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  33.57 
 
 
418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.03 
 
 
668 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  30.88 
 
 
431 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  32.93 
 
 
414 aa  214  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  32.21 
 
 
414 aa  212  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  32.54 
 
 
414 aa  210  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  32.54 
 
 
414 aa  210  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  31.49 
 
 
414 aa  210  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  33.25 
 
 
382 aa  210  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  30.94 
 
 
414 aa  209  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  33.82 
 
 
419 aa  209  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  32.72 
 
 
657 aa  207  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  32.85 
 
 
419 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3518  hypothetical protein  36.63 
 
 
402 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  33.24 
 
 
403 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  32.1 
 
 
414 aa  202  9e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  31.28 
 
 
475 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  32.3 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  30 
 
 
432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  33.06 
 
 
403 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  31.76 
 
 
430 aa  200  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41480  hypothetical protein  34.27 
 
 
402 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  32.02 
 
 
430 aa  199  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  31.76 
 
 
430 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1438  nitrate-binding proteint  35.46 
 
 
432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28551  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1969  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transporter, substrate binding protein  33.17 
 
 
457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  32.12 
 
 
419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  33.87 
 
 
404 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1605  nitrate-binding protein NasS  34.05 
 
 
421 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  32.36 
 
 
415 aa  197  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  33.87 
 
 
404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  29.83 
 
 
405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  32.98 
 
 
440 aa  196  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  32.27 
 
 
407 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  30.95 
 
 
434 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  33.07 
 
 
403 aa  193  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.66 
 
 
673 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4373  nitrate transport protein, NrtC like protein  28.35 
 
 
461 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4540  twin-arginine translocation pathway signal  33.07 
 
 
440 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  30.02 
 
 
437 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1612  nitrate-binding protein NasS  33.87 
 
 
400 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.837424  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  29.55 
 
 
437 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.32 
 
 
669 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  31.69 
 
 
403 aa  189  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.32 
 
 
669 aa  189  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  30.8 
 
 
450 aa  189  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4435  nitrate transporter, putative  27.97 
 
 
461 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.210676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1084  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system  31.18 
 
 
467 aa  187  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  31.5 
 
 
431 aa  186  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  31.36 
 
 
442 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  30.75 
 
 
444 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  30.75 
 
 
444 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0875  twin-arginine translocation pathway signal  27.87 
 
 
480 aa  183  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0516063  hitchhiker  0.00230539 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.62 
 
 
668 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.62 
 
 
668 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  29.08 
 
 
454 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1153  nitrate transporter system, periplasmic component  29.52 
 
 
461 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  29.64 
 
 
438 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05588  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic component  28.76 
 
 
454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3521  bicarbonate transport system substrate-binding protein  31.14 
 
 
457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1488  membrane protein  31.45 
 
 
450 aa  180  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.976236 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  30.71 
 
 
663 aa  180  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2596  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  31.91 
 
 
457 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2820  nitrate transporter  32.63 
 
 
397 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.694753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2417  putative nitrate transport protein  28.64 
 
 
466 aa  179  9e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3656  twin-arginine translocation pathway signal  27.73 
 
 
427 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>