More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3487 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3487  putative nitrate transporter component, nrtA  100 
 
 		 464 aa  964    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3742  twin-arginine translocation pathway signal  79.39 
 
 		 467 aa  777    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  62.09 
 
 		 460 aa  634    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0292  ABC transporter nitrate-binding protein  71.99 
 
 		 451 aa  704    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0997  ABC transporter nitrate-binding protein  70.81 
 
 		 457 aa  667    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3972  ABC transporter nitrate-binding protein  71.49 
 
 		 471 aa  676    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  60.61 
 
 		 457 aa  624  1e-177  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2054  twin-arginine translocation pathway signal  60.22 
 
 		 462 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5415  putative nitrate ABC transporter (substrate-binding protein) (ntrA-like protein)  58.11 
 
 		 461 aa  578  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2589  putative nitrate transporter component  57.98 
 
 		 475 aa  578  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200575 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2403  ABC transporter nitrate-binding protein  59.91 
 
 		 462 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0310148  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4818  ABC transporter nitrate-binding protein  60.18 
 
 		 456 aa  549  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0964  putative nitrate transporter component  54.49 
 
 		 486 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.511943 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1307  ABC transporter nitrate-binding protein  57.55 
 
 		 453 aa  543  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.870256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1148  ABC transporter nitrate-binding protein  58.56 
 
 		 453 aa  542  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294193  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2617  ABC transporter nitrate-binding protein  58.71 
 
 		 454 aa  536  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0708468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4663  ABC transporter nitrate-binding protein  57.05 
 
 		 453 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3774  putative nitrate transporter component, NrtA  51.58 
 
 		 454 aa  484  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.944319  normal  0.102556 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2107  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  48.99 
 
 		 529 aa  392  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.287431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  36.08 
 
 		 433 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  32.86 
 
 		 417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  33.03 
 
 		 467 aa  233  6e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  34.07 
 
 		 426 aa  232  9e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  33.17 
 
 		 426 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  33.17 
 
 		 426 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  33.41 
 
 		 425 aa  231  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  34.45 
 
 		 420 aa  230  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  35.41 
 
 		 427 aa  230  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  31.81 
 
 		 431 aa  229  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  33.25 
 
 		 437 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  35.54 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  33.75 
 
 		 414 aa  224  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  33.75 
 
 		 414 aa  224  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  32.37 
 
 		 414 aa  223  8e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  31.94 
 
 		 414 aa  222  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  31.57 
 
 		 414 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  34.03 
 
 		 414 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  33.51 
 
 		 417 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  32.45 
 
 		 418 aa  219  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  33.41 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  32.77 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  34.59 
 
 		 430 aa  216  8e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  32.76 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  31.97 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  33.89 
 
 		 415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  31.63 
 
 		 419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  31.76 
 
 		 414 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  34.07 
 
 		 407 aa  213  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  33.76 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  33.76 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  33.92 
 
 		 434 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  31.8 
 
 		 419 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  31.43 
 
 		 475 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  32 
 
 		 450 aa  207  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  34.48 
 
 		 431 aa  206  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  32.32 
 
 		 442 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  32.47 
 
 		 432 aa  203  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4540  twin-arginine translocation pathway signal  31.12 
 
 		 440 aa  202  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  31.44 
 
 		 432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  32.5 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  30.66 
 
 		 437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  31.82 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  30.26 
 
 		 437 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  31.52 
 
 		 444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  31.52 
 
 		 444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.04 
 
 		 668 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  31.47 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  32.38 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  32.11 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1969  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transporter, substrate binding protein  32.31 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3527  nitrate transport protein  31.91 
 
 		 442 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3518  hypothetical protein  33.16 
 
 		 402 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  31.11 
 
 		 403 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  31.71 
 
 		 404 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  31.71 
 
 		 404 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  31.39 
 
 		 657 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  30.54 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41480  hypothetical protein  32.38 
 
 		 402 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.08 
 
 		 669 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1438  nitrate-binding proteint  33.09 
 
 		 432 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28551  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1454  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  30.87 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5899  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  31.02 
 
 		 423 aa  186  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  31.65 
 
 		 440 aa  184  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0875  twin-arginine translocation pathway signal  29.12 
 
 		 480 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0516063  hitchhiker  0.00230539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1605  nitrate-binding protein NasS  30.47 
 
 		 421 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1631  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  31.12 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3316  putative nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein  30.23 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163343  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  31.58 
 
 		 435 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2417  putative nitrate transport protein  29.55 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05588  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic component  29.15 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3656  twin-arginine translocation pathway signal  28.97 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3730  nitrate transporter  30.45 
 
 		 467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0457947  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3676  twin-arginine translocation pathway signal  30.45 
 
 		 467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03654  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  28.95 
 
 		 469 aa  180  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1153  nitrate transporter system, periplasmic component  29.65 
 
 		 461 aa  179  7e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.04 
 
 		 669 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.04 
 
 		 669 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  31.7 
 
 		 443 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.81 
 
 		 673 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001607  nitrate ABC transporter nitrate-binding protein  30.31 
 
 		 449 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>