More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3774 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3774  putative nitrate transporter component, NrtA  100 
 
 		 454 aa  938    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.944319  normal  0.102556 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  49.44 
 
 		 457 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3487  putative nitrate transporter component, nrtA  51.58 
 
 		 464 aa  485  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2403  ABC transporter nitrate-binding protein  50 
 
 		 462 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0310148  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  49.22 
 
 		 460 aa  484  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2054  twin-arginine translocation pathway signal  48.88 
 
 		 462 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0292  ABC transporter nitrate-binding protein  49.44 
 
 		 451 aa  472  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5415  putative nitrate ABC transporter (substrate-binding protein) (ntrA-like protein)  47.87 
 
 		 461 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2589  putative nitrate transporter component  49.24 
 
 		 475 aa  467  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200575 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3742  twin-arginine translocation pathway signal  47.79 
 
 		 467 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0997  ABC transporter nitrate-binding protein  47.87 
 
 		 457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1148  ABC transporter nitrate-binding protein  48.87 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294193  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1307  ABC transporter nitrate-binding protein  48.42 
 
 		 453 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.870256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3972  ABC transporter nitrate-binding protein  50.49 
 
 		 471 aa  451  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4663  ABC transporter nitrate-binding protein  49.11 
 
 		 453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0964  putative nitrate transporter component  49.04 
 
 		 486 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.511943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4818  ABC transporter nitrate-binding protein  50.68 
 
 		 456 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2617  ABC transporter nitrate-binding protein  47.37 
 
 		 454 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0708468 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2107  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  40.55 
 
 		 529 aa  332  1e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.287431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  34.07 
 
 		 426 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  34.07 
 
 		 426 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  33.09 
 
 		 433 aa  229  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  35.11 
 
 		 427 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  34.07 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  32.77 
 
 		 437 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  31.4 
 
 		 431 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  33.42 
 
 		 423 aa  217  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  32.46 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  30.28 
 
 		 414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  30.94 
 
 		 425 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  31.1 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  32.3 
 
 		 414 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  31.12 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  32.3 
 
 		 414 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  31.26 
 
 		 414 aa  210  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.68 
 
 		 668 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  32.53 
 
 		 417 aa  209  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  31.62 
 
 		 426 aa  208  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.59 
 
 		 669 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  32.45 
 
 		 419 aa  206  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1605  nitrate-binding protein NasS  33.51 
 
 		 421 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  31.57 
 
 		 414 aa  205  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  30.27 
 
 		 414 aa  204  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  33.25 
 
 		 404 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  30.7 
 
 		 418 aa  203  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  33.25 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  31.72 
 
 		 414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  31.85 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 		 414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  32.4 
 
 		 440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  31.47 
 
 		 403 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  30.86 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  31.73 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  30.9 
 
 		 419 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  29.86 
 
 		 467 aa  195  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  30.54 
 
 		 432 aa  190  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.67 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  32.72 
 
 		 663 aa  189  7e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  30.17 
 
 		 419 aa  189  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41480  hypothetical protein  31.62 
 
 		 402 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  30.83 
 
 		 415 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  29.92 
 
 		 430 aa  187  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4373  nitrate transport protein, NrtC like protein  30.02 
 
 		 461 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  29.92 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  29.4 
 
 		 430 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  30.93 
 
 		 673 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  31.2 
 
 		 667 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1612  nitrate-binding protein NasS  32.8 
 
 		 400 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.837424  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  30.11 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  31.95 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4435  nitrate transporter, putative  29.26 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.210676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.17 
 
 		 669 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3518  hypothetical protein  32.36 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.17 
 
 		 669 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1438  nitrate-binding proteint  31.19 
 
 		 432 aa  180  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28551  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0332  putative regulatory protein NasS  34.51 
 
 		 353 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0240199  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1091  putative regulatory protein NasS  34.51 
 
 		 353 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0089  putative regulatory protein NasS  34.51 
 
 		 353 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.964988  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1257  putative regulatory protein NasS  34.51 
 
 		 353 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0276079  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  29.97 
 
 		 444 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  29.97 
 
 		 444 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.69 
 
 		 385 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5674  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  31.75 
 
 		 383 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.679378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3656  twin-arginine translocation pathway signal  27.08 
 
 		 427 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  27.95 
 
 		 657 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  29.02 
 
 		 454 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1166  regulatory protein NasS, putative  34.78 
 
 		 353 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241228  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3730  nitrate transporter  29.72 
 
 		 467 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0457947  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1760  putative regulatory protein  34.45 
 
 		 353 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  30.42 
 
 		 434 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3676  twin-arginine translocation pathway signal  29.72 
 
 		 467 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4540  twin-arginine translocation pathway signal  29.38 
 
 		 440 aa  172  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0247  nitrate transport ATP-binding protein  34.23 
 
 		 353 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1672  putative regulatory protein  34.23 
 
 		 353 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  26.38 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0641  twin-arginine translocation pathway signal  28.91 
 
 		 477 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  28.99 
 
 		 668 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  29.81 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  28.74 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  28.99 
 
 		 668 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>