258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2617 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2054  twin-arginine translocation pathway signal  68.55 
 
 		 462 aa  679    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1148  ABC transporter nitrate-binding protein  69.3 
 
 		 453 aa  659    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294193  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2403  ABC transporter nitrate-binding protein  67.68 
 
 		 462 aa  662    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0310148  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2617  ABC transporter nitrate-binding protein  100 
 
 		 454 aa  938    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0708468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4663  ABC transporter nitrate-binding protein  70.61 
 
 		 453 aa  655    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1307  ABC transporter nitrate-binding protein  69.3 
 
 		 453 aa  663    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.870256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5415  putative nitrate ABC transporter (substrate-binding protein) (ntrA-like protein)  71.52 
 
 		 461 aa  697    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4818  ABC transporter nitrate-binding protein  66.45 
 
 		 456 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  59.69 
 
 		 457 aa  578  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2589  putative nitrate transporter component  58.3 
 
 		 475 aa  575  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3487  putative nitrate transporter component, nrtA  58.71 
 
 		 464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0292  ABC transporter nitrate-binding protein  59.45 
 
 		 451 aa  545  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3972  ABC transporter nitrate-binding protein  57.46 
 
 		 471 aa  542  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0964  putative nitrate transporter component  53.85 
 
 		 486 aa  538  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.511943 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0997  ABC transporter nitrate-binding protein  55.53 
 
 		 457 aa  523  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3742  twin-arginine translocation pathway signal  54.82 
 
 		 467 aa  520  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  54.5 
 
 		 460 aa  520  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3774  putative nitrate transporter component, NrtA  48.41 
 
 		 454 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.944319  normal  0.102556 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2107  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  47.06 
 
 		 529 aa  381  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.287431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  39.29 
 
 		 427 aa  247  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  35.84 
 
 		 433 aa  243  5e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  34.62 
 
 		 417 aa  230  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  34.3 
 
 		 426 aa  229  8e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  34.3 
 
 		 426 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  35.11 
 
 		 426 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  33.9 
 
 		 431 aa  227  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  35.08 
 
 		 417 aa  225  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  33.18 
 
 		 467 aa  224  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  34.87 
 
 		 420 aa  223  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  34.43 
 
 		 414 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  34.22 
 
 		 425 aa  221  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  34.43 
 
 		 414 aa  221  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  34.86 
 
 		 437 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  35.99 
 
 		 423 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  33.97 
 
 		 414 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  33.73 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  34.22 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  33.25 
 
 		 414 aa  216  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  36.32 
 
 		 414 aa  216  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  34.04 
 
 		 414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  34.06 
 
 		 414 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  33.25 
 
 		 430 aa  210  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  33.89 
 
 		 415 aa  209  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  33.08 
 
 		 430 aa  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  33.16 
 
 		 430 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  32.03 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  31.47 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  32.45 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  31.77 
 
 		 403 aa  203  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  31.01 
 
 		 405 aa  203  6e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  33.42 
 
 		 431 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  33.16 
 
 		 403 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  32.61 
 
 		 419 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  33.58 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  32.18 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  32.13 
 
 		 419 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3518  hypothetical protein  33.51 
 
 		 402 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  30.18 
 
 		 437 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.38 
 
 		 668 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  32.35 
 
 		 404 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  31.06 
 
 		 432 aa  196  8.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  32.35 
 
 		 404 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  31.88 
 
 		 419 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  31.07 
 
 		 438 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1605  nitrate-binding protein NasS  32.98 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  30.87 
 
 		 669 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  31.99 
 
 		 432 aa  192  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  30.05 
 
 		 437 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1454  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  33.42 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  30.5 
 
 		 657 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  32.12 
 
 		 440 aa  189  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1631  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  34.43 
 
 		 424 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5899  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  33.75 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1612  nitrate-binding protein NasS  32.35 
 
 		 400 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.837424  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  30.67 
 
 		 673 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.83 
 
 		 403 aa  186  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41480  hypothetical protein  32.02 
 
 		 402 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  33.84 
 
 		 435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.28 
 
 		 669 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.28 
 
 		 669 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1968  nitrate transport protein, NrtC like protein  29.25 
 
 		 444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  32.99 
 
 		 382 aa  182  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.08 
 
 		 668 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.08 
 
 		 668 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  29.13 
 
 		 475 aa  180  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1438  nitrate-binding proteint  33.65 
 
 		 432 aa  179  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28551  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4540  twin-arginine translocation pathway signal  31.44 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  30.26 
 
 		 442 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  30.43 
 
 		 444 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  30.43 
 
 		 444 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  29.91 
 
 		 454 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0875  twin-arginine translocation pathway signal  29.76 
 
 		 480 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0516063  hitchhiker  0.00230539 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3656  twin-arginine translocation pathway signal  27.76 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2596  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  32.58 
 
 		 457 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3521  bicarbonate transport system substrate-binding protein  32.58 
 
 		 457 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4678  ABC-type bicarbonate transport system substrate-binding protein  30.9 
 
 		 452 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05588  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic component  28.1 
 
 		 454 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4373  nitrate transport protein, NrtC like protein  27.03 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  29.64 
 
 		 668 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  30.26 
 
 		 667 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.129474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>