183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2778 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2778  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 
325 aa  657    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1180  putative ABC transporter, periplasmic protein  66.45 
 
 
323 aa  424  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6301  NMT1/THI5-like domain-containing protein  42.6 
 
 
325 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0619  NMT1/THI5 like domain protein  34.15 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  25.23 
 
 
337 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2293  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.79 
 
 
336 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2575  hypothetical protein  25.5 
 
 
336 aa  91.3  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.225151  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  25.89 
 
 
340 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11510  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  24.34 
 
 
336 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000048144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0878  hypothetical protein  23.84 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0057402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  23.76 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  24.07 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  24.07 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1347  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.5 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.65 
 
 
364 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000374426  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  23.2 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.33 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.2 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  23.7 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.91 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.77 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.59 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2782  ABC transporter substrate-binding protein  23.47 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4935  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  22.96 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  28.63 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.1 
 
 
1004 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0746  hypothetical protein  24.59 
 
 
300 aa  63.2  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0465  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.45 
 
 
347 aa  62.8  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.176308  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  26.75 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  23.17 
 
 
1065 aa  62  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.27 
 
 
1004 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3175  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.88 
 
 
367 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311198  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  31.97 
 
 
346 aa  61.2  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3168  ABC transporter, periplasmic binding protein  27.27 
 
 
343 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4767  NlpA lipoprotein  28.99 
 
 
348 aa  60.8  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3906  WD-40 repeat-containing protein  27.27 
 
 
343 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.59 
 
 
338 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1738  hypothetical protein  25.97 
 
 
322 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0611482  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0722  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.27 
 
 
300 aa  60.5  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2219  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  25.86 
 
 
341 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1466  hypothetical protein  25.97 
 
 
322 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0764811  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2561  NLPA lipoprotein  26.99 
 
 
339 aa  57.8  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.79068 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0652  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  38.16 
 
 
261 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1757  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  26.24 
 
 
346 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502422  normal  0.0158469 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.15 
 
 
346 aa  57  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  26.58 
 
 
342 aa  57  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4593  NMT1/THI5 like domain protein  26.71 
 
 
335 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.39 
 
 
1075 aa  56.6  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  27.24 
 
 
342 aa  56.6  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4459  NMT1/THI5 like domain protein  26.71 
 
 
335 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0725563  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2556  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  22 
 
 
365 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0212  hypothetical protein  22.67 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000728433  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4931  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  28.67 
 
 
325 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4112  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  26.24 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4254  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  26.24 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000917513  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  28.74 
 
 
361 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.1 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.69 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4336  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.77 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379972  normal  0.507879 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0244  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.48 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.576373  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.28 
 
 
331 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3263  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.86 
 
 
344 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0622389  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3083  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.4 
 
 
328 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261971  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5981  ABC transporter substrate-binding protein  28.87 
 
 
311 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  23.6 
 
 
335 aa  53.5  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3678  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  26.06 
 
 
344 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.987849 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4151  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.06 
 
 
344 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  0.147422 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0646  ABC transporter, substrate-binding protein  24.88 
 
 
311 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.714673  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  25.43 
 
 
674 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1487  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
334 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.143655  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2299  ABC transporter, substrate-binding protein  24.88 
 
 
311 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0813032 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1186  taurine ABC transporter, taurine-binding protein  23.99 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.217841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.94 
 
 
335 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4355  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  29.23 
 
 
334 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000418029  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1057  extracellular solute-binding protein family 3  30.83 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227515  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1089  taurine ABC transporter, taurine-binding protein  23.99 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2543  putative binding protein  25.24 
 
 
352 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.721383 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  24.91 
 
 
360 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2671  NMT1/THI5 like domain protein  27.78 
 
 
367 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.85 
 
 
318 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2375  ABC transporter substrate-binding protein  22.52 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000866  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter substrate-binding component  25.6 
 
 
316 aa  50.8  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3098  hypothetical protein  26.45 
 
 
364 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  24.23 
 
 
348 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 
340 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.06 
 
 
344 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 
332 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  25.08 
 
 
340 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  24.9 
 
 
686 aa  50.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0655  NMT1/THI5-like protein  26.19 
 
 
350 aa  50.1  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 
341 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  26.92 
 
 
349 aa  49.3  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2165  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  25.38 
 
 
345 aa  49.3  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
915 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06841  nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  24.47 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0586  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.46 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891954  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3256  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  30.66 
 
 
383 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117955 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6311  putative ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  21.75 
 
 
311 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.794983  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0041  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.08 
 
 
338 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.487407 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.28 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>