195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3175 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3175  NMT1/THI5-like domain-containing protein  100 
 
 
367 aa  749    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311198  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3098  hypothetical protein  29.73 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2986  NMT1/THI5 like domain protein  30.49 
 
 
354 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0769  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.41 
 
 
354 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3124  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.38 
 
 
362 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.45434  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1170  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  29.82 
 
 
356 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0662412  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7630  hypothetical protein  26.01 
 
 
363 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2543  putative binding protein  25.42 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.721383 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0363  putative sulfonate/nitrate/taurine transport system substrate-binding protein  26.73 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  33.74 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0909  NMT1/THI5 like domain protein  27.24 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0643839  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  33.74 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  27.42 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  31.93 
 
 
340 aa  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0085  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  29.69 
 
 
350 aa  64.7  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  28.3 
 
 
342 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  33.13 
 
 
349 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  33.13 
 
 
349 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
330 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  24.31 
 
 
342 aa  63.9  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  26.22 
 
 
343 aa  63.5  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0489  hypothetical protein  26.22 
 
 
315 aa  63.2  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2205  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  28.46 
 
 
332 aa  63.2  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142056  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  29 
 
 
349 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0520  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.78 
 
 
323 aa  63.2  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  26 
 
 
311 aa  62.8  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1032  putative aliphatic sulfonate binding protein precursor  29.03 
 
 
327 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  26.12 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  28.05 
 
 
333 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  28.05 
 
 
333 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2778  NMT1/THI5 like domain protein  24.88 
 
 
325 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 
347 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
311 aa  60.5  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3018  NMT1/THI5 like domain protein  31.28 
 
 
342 aa  60.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.15 
 
 
333 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  32 
 
 
348 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  25.44 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.6 
 
 
333 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  27.6 
 
 
333 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.6 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  27.6 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  29.1 
 
 
361 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2283  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  29.82 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.6 
 
 
333 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.09 
 
 
331 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  25.88 
 
 
332 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.6 
 
 
333 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  24.67 
 
 
323 aa  58.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  27.15 
 
 
333 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3789  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  24.11 
 
 
320 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  28.74 
 
 
349 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  27.62 
 
 
344 aa  56.6  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0851  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.21 
 
 
328 aa  56.6  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0219644  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1296  nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein, putative  26.21 
 
 
474 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232575  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.15 
 
 
333 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.12 
 
 
338 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  29.17 
 
 
346 aa  55.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5823  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.15 
 
 
326 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  hitchhiker  0.00768111 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.79 
 
 
316 aa  55.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0586  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.56 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891954  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  25.79 
 
 
316 aa  55.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2673  putative ABC transporter, substrate binding protein  27.46 
 
 
326 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416834  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 
341 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4880  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.05 
 
 
481 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0732129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1304  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  26.26 
 
 
417 aa  53.1  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165264  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 
341 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1735  twin-arginine translocation pathway signal  28.93 
 
 
319 aa  52.8  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0646  ABC transporter, substrate-binding protein  24.24 
 
 
311 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.714673  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06841  nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  22.29 
 
 
337 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  26.32 
 
 
356 aa  52.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0655  NMT1/THI5-like protein  24.22 
 
 
350 aa  52.8  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1669  NMT1/THI5 like domain protein  28.3 
 
 
360 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.833326  normal  0.535701 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  23.81 
 
 
457 aa  52.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2299  ABC transporter, substrate-binding protein  24.24 
 
 
311 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0813032 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3168  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.32 
 
 
343 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2107  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  25.85 
 
 
529 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.287431  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3125  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.74 
 
 
311 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3906  WD-40 repeat-containing protein  26.32 
 
 
343 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.77 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4331  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.94 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1998  nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein, putative  25.4 
 
 
474 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.420561  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  26.86 
 
 
344 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0291  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  28 
 
 
320 aa  50.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000806858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5011  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  27.02 
 
 
468 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.89 
 
 
328 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4540  NMT1/THI5 like domain protein  27.03 
 
 
327 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.184718 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  27.27 
 
 
335 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0207  nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein, putative  27.42 
 
 
468 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.497934 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  28.04 
 
 
328 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0526  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.93 
 
 
357 aa  50.8  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 
336 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.49 
 
 
915 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.48 
 
 
318 aa  50.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1901  twin-arginine translocation pathway signal  23.58 
 
 
321 aa  50.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00273857  hitchhiker  0.00000000000094829 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2131  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.54 
 
 
319 aa  50.1  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603164  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.44 
 
 
336 aa  50.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2024  NMT1/THI5 like domain protein  23.42 
 
 
344 aa  50.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1570  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
353 aa  50.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000866  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter substrate-binding component  22.29 
 
 
316 aa  50.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>