124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3124 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3124  NMT1/THI5-like domain-containing protein  100 
 
 
362 aa  740    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.45434  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3098  hypothetical protein  31.61 
 
 
364 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0769  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33 
 
 
354 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2986  NMT1/THI5 like domain protein  32.89 
 
 
354 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7630  hypothetical protein  28.76 
 
 
363 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3175  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.71 
 
 
367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311198  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1170  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.55 
 
 
356 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0662412  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  29 
 
 
360 aa  97.4  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2543  putative binding protein  27.57 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.721383 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  24.59 
 
 
342 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.09 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3168  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.79 
 
 
343 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3906  WD-40 repeat-containing protein  24.79 
 
 
343 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.75 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  25.75 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.75 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.75 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  25.42 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  25.42 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  25.42 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.08 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.42 
 
 
333 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2782  NLPA lipoprotein  27.37 
 
 
319 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0743027  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0815  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  24.48 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.57 
 
 
331 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1152  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.58 
 
 
340 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4355  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  30.77 
 
 
334 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000418029  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.73 
 
 
333 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  28.37 
 
 
311 aa  59.7  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.17 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  25.17 
 
 
340 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  24.65 
 
 
336 aa  56.6  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  24.92 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  22.85 
 
 
375 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  26.36 
 
 
354 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1144  NMT1/THI5 like domain protein  26.1 
 
 
357 aa  53.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144377  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  28.37 
 
 
333 aa  53.5  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  36.26 
 
 
332 aa  53.5  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  23 
 
 
343 aa  53.1  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.55 
 
 
329 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  23.1 
 
 
331 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  23.81 
 
 
339 aa  53.1  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  23.62 
 
 
349 aa  52.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  28.24 
 
 
391 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  27.02 
 
 
319 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  27.63 
 
 
335 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.41 
 
 
342 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.78 
 
 
322 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0477  NMT1/THI5 like domain protein  21.07 
 
 
320 aa  50.1  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2219  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  23.38 
 
 
341 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.6 
 
 
318 aa  50.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  25.52 
 
 
686 aa  50.1  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  29.37 
 
 
334 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  29.37 
 
 
334 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  25.71 
 
 
365 aa  49.7  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  29.72 
 
 
361 aa  49.7  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  26.7 
 
 
346 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.78 
 
 
327 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  24.23 
 
 
593 aa  49.7  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.38 
 
 
348 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  26.09 
 
 
328 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1483  ABC transporter substrate-binding protein  27.48 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  23.65 
 
 
328 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  27.31 
 
 
323 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  23.11 
 
 
325 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2375  ABC transporter substrate-binding protein  24.81 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  27.31 
 
 
329 aa  47.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.43 
 
 
338 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  24.42 
 
 
321 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2622  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  27.67 
 
 
341 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000404129  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 
340 aa  47.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0066  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  25.45 
 
 
316 aa  47.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  21.75 
 
 
318 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.477186 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  22.7 
 
 
347 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.79 
 
 
344 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0878  NMT1/THI5 like domain protein  26.09 
 
 
339 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000508636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1356  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.07 
 
 
367 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.459208  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  24.7 
 
 
778 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.73 
 
 
346 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5012  ABC transporter substrate-binding protein  24.35 
 
 
343 aa  46.6  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0405  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  22.35 
 
 
331 aa  46.6  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1757  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  24.22 
 
 
346 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502422  normal  0.0158469 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.85 
 
 
1075 aa  46.2  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0363  putative sulfonate/nitrate/taurine transport system substrate-binding protein  25.76 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1555  hypothetical protein  24.57 
 
 
355 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4593  NMT1/THI5 like domain protein  24.09 
 
 
335 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.26 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4459  NMT1/THI5 like domain protein  24.09 
 
 
335 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0725563  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2477  NMT1/THI5 like domain protein  25.42 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2671  NMT1/THI5 like domain protein  27.2 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  27.59 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  25.59 
 
 
349 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  23.7 
 
 
460 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  22.77 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2975  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.53 
 
 
336 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.459543  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  27.97 
 
 
349 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  29.36 
 
 
340 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0489  hypothetical protein  25.26 
 
 
315 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1989  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter  39.13 
 
 
339 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.553257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>