More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0229 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 
391 aa  801    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  33.11 
 
 
341 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  32.77 
 
 
340 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  32.09 
 
 
341 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  31.99 
 
 
333 aa  143  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  33.89 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  29.53 
 
 
328 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  27.89 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3116  ABC transporter, substrate-binding protein  31.85 
 
 
336 aa  119  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  26.15 
 
 
349 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3118  ABC transporter, substrate-binding protein  31.63 
 
 
336 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.671223  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 
347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  25.85 
 
 
349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  26.74 
 
 
349 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 
340 aa  116  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5343  putative ABC transporter, substrate-binding protein  31.51 
 
 
337 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.524159 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5063  putative ABC transporter, substrate-binding protein  30.82 
 
 
337 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  26.71 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.11 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  28.62 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  26.35 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1529  putative substrate-binding component of ABC transporter  29.3 
 
 
348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  26.45 
 
 
349 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3327  ABC transporter substrate binding protein  30.48 
 
 
303 aa  113  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  27.85 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
336 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  25.82 
 
 
340 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  25.8 
 
 
349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.52 
 
 
346 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.61 
 
 
338 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  27.78 
 
 
334 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0952  putative substrate-binding component of ABC transporter  28.18 
 
 
332 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0791916  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  27.8 
 
 
371 aa  109  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  27.78 
 
 
334 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  25.41 
 
 
344 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  28.14 
 
 
364 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  28.14 
 
 
337 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  28.14 
 
 
337 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  28.14 
 
 
337 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  28.14 
 
 
337 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  28.14 
 
 
337 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  28.14 
 
 
337 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.19 
 
 
344 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  27.55 
 
 
337 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0036  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.89 
 
 
334 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  27.36 
 
 
348 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3512  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.91 
 
 
345 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3218  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  27.55 
 
 
334 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  27.7 
 
 
345 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0053  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.55 
 
 
334 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.92 
 
 
345 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.36 
 
 
345 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0035  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.55 
 
 
334 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0026  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  27.55 
 
 
334 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0036  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  27.21 
 
 
334 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0034  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  27.21 
 
 
334 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4035  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  26.85 
 
 
339 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  25.08 
 
 
361 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3959  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.51 
 
 
336 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0495  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.84 
 
 
339 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106589  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2648  putative signal peptide protein  23.99 
 
 
353 aa  91.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00493903 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1057  extracellular solute-binding protein family 3  24.92 
 
 
332 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227515  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2782  ABC transporter substrate-binding protein  24.92 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 
332 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0589  putative signal peptide protein  25.47 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.66482  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3083  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.09 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261971  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0288  NMT1/THI5 like domain protein  30.45 
 
 
327 aa  77  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133462  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  23.72 
 
 
340 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2330  NMT1/THI5 like domain-containing protein  26.32 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5419  NMT1/THI5 like domain protein  24.23 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5603  ABC transporter substrate-binding protein  24.41 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.069875  normal  0.939883 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  24.88 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  22.58 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2782  NLPA lipoprotein  28.52 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0743027  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  26.79 
 
 
329 aa  72.4  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  25.26 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.68 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  22.68 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5921  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.49 
 
 
302 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  0.23339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1134  NMT1/THI5 like domain protein  27.7 
 
 
365 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4215  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.29 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.68 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  22.36 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.41 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.36 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2659  NMT1/THI5 like domain protein  25.44 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  22.12 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  22.12 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.3 
 
 
364 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000374426  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  27.02 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3033  hypothetical protein  27.06 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233167  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1647  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  27.66 
 
 
324 aa  65.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0117  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.74 
 
 
347 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1035  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  26.8 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1144  NMT1/THI5 like domain protein  26.46 
 
 
357 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144377  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  20.81 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0260  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 
331 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.388479  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4935  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  22.36 
 
 
325 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>