187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3218 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3218  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 
334 aa  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0036  NMT1/THI5-like domain-containing protein  96.41 
 
 
334 aa  630  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0036  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  94.31 
 
 
334 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0026  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  94.61 
 
 
334 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0034  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  94.31 
 
 
334 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0035  NMT1/THI5-like domain-containing protein  94.31 
 
 
334 aa  618  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0053  NMT1/THI5-like domain-containing protein  94.01 
 
 
334 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  88.13 
 
 
364 aa  597  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  88.43 
 
 
337 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  88.13 
 
 
337 aa  598  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  88.13 
 
 
337 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  88.43 
 
 
337 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  88.43 
 
 
337 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  88.43 
 
 
337 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  88.43 
 
 
337 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0495  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  82.62 
 
 
339 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106589  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4035  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  82.3 
 
 
339 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3959  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  75.68 
 
 
336 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  76.73 
 
 
356 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  61.51 
 
 
349 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  61.51 
 
 
349 aa  417  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  59.81 
 
 
328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1529  putative substrate-binding component of ABC transporter  60.96 
 
 
348 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5343  putative ABC transporter, substrate-binding protein  64.03 
 
 
337 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.524159 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3118  ABC transporter, substrate-binding protein  62.07 
 
 
336 aa  383  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.671223  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5063  putative ABC transporter, substrate-binding protein  63.49 
 
 
337 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3512  NMT1/THI5-like domain-containing protein  63.16 
 
 
345 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3116  ABC transporter, substrate-binding protein  60.56 
 
 
336 aa  381  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3327  ABC transporter substrate binding protein  62.38 
 
 
303 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0952  putative substrate-binding component of ABC transporter  51.08 
 
 
332 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0791916  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  38.02 
 
 
332 aa  228  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  40.46 
 
 
341 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  40 
 
 
341 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  38.99 
 
 
342 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  40.33 
 
 
340 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  37.88 
 
 
349 aa  219  7e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  37.58 
 
 
349 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  37.62 
 
 
349 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5603  ABC transporter substrate-binding protein  40.26 
 
 
376 aa  212  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.069875  normal  0.939883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  38.61 
 
 
338 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  35.28 
 
 
346 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  35.95 
 
 
333 aa  206  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  34.94 
 
 
346 aa  205  7e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.42 
 
 
344 aa  205  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  35.1 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  33.63 
 
 
340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  36.89 
 
 
347 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  35.15 
 
 
344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  37.17 
 
 
334 aa  199  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  37.17 
 
 
334 aa  199  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  39.2 
 
 
346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.25 
 
 
346 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.96 
 
 
345 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  37.29 
 
 
345 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 
332 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1057  extracellular solute-binding protein family 3  37.83 
 
 
332 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227515  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.96 
 
 
345 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  35.92 
 
 
347 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  34.11 
 
 
348 aa  186  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  32.67 
 
 
361 aa  182  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2648  putative signal peptide protein  33.65 
 
 
353 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00493903 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0589  putative signal peptide protein  31.16 
 
 
355 aa  170  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.66482  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
336 aa  155  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  29.93 
 
 
371 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  30.63 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  27.55 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2525  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.44 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.610523  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2570  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.44 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2562  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.96 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.27 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.15 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.96 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  27 
 
 
334 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2659  NMT1/THI5 like domain protein  25.1 
 
 
324 aa  59.7  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  27.73 
 
 
335 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4148  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  30.57 
 
 
326 aa  59.3  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.193725  normal  0.38818 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.73 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  27.73 
 
 
338 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  27.73 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.73 
 
 
335 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  24.8 
 
 
337 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  28.15 
 
 
335 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.15 
 
 
335 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0769  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.4 
 
 
354 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0213  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  26 
 
 
393 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2782  ABC transporter substrate-binding protein  26.05 
 
 
332 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1570  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 
353 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0465  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25 
 
 
347 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.176308  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0454  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.76 
 
 
327 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4931  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  26.97 
 
 
325 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4935  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  27.31 
 
 
325 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2782  NLPA lipoprotein  24.33 
 
 
319 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0743027  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  29.83 
 
 
311 aa  53.5  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2986  NMT1/THI5 like domain protein  24.67 
 
 
354 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4355  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  24.54 
 
 
334 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000418029  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0354  NMT1/THI5 like domain protein  23.71 
 
 
316 aa  53.1  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1370  ABC transporter substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  29.66 
 
 
345 aa  52.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.759822  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4513  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.34 
 
 
335 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2575  hypothetical protein  23.48 
 
 
336 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.225151  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4373  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  28.08 
 
 
352 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742305  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>