269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0038 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  99.7 
 
 		 364 aa  676    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  678    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  678    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  678    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  678    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  97.92 
 
 		 337 aa  667    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  678    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  99.7 
 
 		 337 aa  677    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3218  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  88.43 
 
 		 334 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0036  NMT1/THI5-like domain-containing protein  88.13 
 
 		 334 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0053  NMT1/THI5-like domain-containing protein  87.83 
 
 		 334 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0036  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  87.83 
 
 		 334 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0034  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  87.83 
 
 		 334 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0035  NMT1/THI5-like domain-containing protein  86.94 
 
 		 334 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0026  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  86.65 
 
 		 334 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4035  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  80.66 
 
 		 339 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0495  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  80 
 
 		 339 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  77.07 
 
 		 356 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3959  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  78.62 
 
 		 336 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  63.55 
 
 		 349 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  62.74 
 
 		 349 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  60.63 
 
 		 328 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1529  putative substrate-binding component of ABC transporter  62.24 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3512  NMT1/THI5-like domain-containing protein  64.69 
 
 		 345 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5343  putative ABC transporter, substrate-binding protein  64.03 
 
 		 337 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.524159 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5063  putative ABC transporter, substrate-binding protein  63.04 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3327  ABC transporter substrate binding protein  62.88 
 
 		 303 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3116  ABC transporter, substrate-binding protein  61.06 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3118  ABC transporter, substrate-binding protein  60.63 
 
 		 336 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.671223  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0952  putative substrate-binding component of ABC transporter  52.98 
 
 		 332 aa  315  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0791916  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  41.91 
 
 		 332 aa  245  9e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  41.12 
 
 		 341 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  41.78 
 
 		 340 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  40.65 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  38.99 
 
 		 342 aa  229  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  37.21 
 
 		 346 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  38.56 
 
 		 349 aa  219  7e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5603  ABC transporter substrate-binding protein  40.58 
 
 		 376 aa  218  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.069875  normal  0.939883 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  38.24 
 
 		 349 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  34.99 
 
 		 346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  37.72 
 
 		 333 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  37.01 
 
 		 344 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  39.47 
 
 		 338 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  38.61 
 
 		 349 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  39.87 
 
 		 346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  39.6 
 
 		 334 aa  212  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  39.6 
 
 		 334 aa  212  7e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.53 
 
 		 346 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  38.94 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  37.09 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  36.09 
 
 		 349 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  35.64 
 
 		 340 aa  203  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  39.27 
 
 		 345 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  35.93 
 
 		 347 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.94 
 
 		 345 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  37.95 
 
 		 332 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2648  putative signal peptide protein  34.72 
 
 		 353 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00493903 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  36.17 
 
 		 347 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1057  extracellular solute-binding protein family 3  37.62 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227515  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  34.94 
 
 		 348 aa  193  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  34.11 
 
 		 361 aa  189  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0589  putative signal peptide protein  32.24 
 
 		 355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.66482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  34.83 
 
 		 336 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  31.58 
 
 		 371 aa  159  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  31.02 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  28.23 
 
 		 391 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  29.11 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.38 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  30.25 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  29.83 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  29.83 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  29.83 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.83 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.83 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  30.25 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  30.25 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4935  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  29.69 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2525  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.14 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.610523  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2570  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.14 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.86 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2562  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.67 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6455  ABC transporter substrate-binding protein  30.73 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.871345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2782  NLPA lipoprotein  25.48 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0743027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4931  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  31.22 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1570  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1047  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2782  ABC transporter substrate-binding protein  25.69 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2720  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.91 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  22.82 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4373  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  29.45 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3869  NMT1/THI5 like domain protein  32.46 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.478553  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4459  NMT1/THI5 like domain protein  29.71 
 
 		 335 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0725563  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0769  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.47 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1757  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  29.61 
 
 		 346 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502422  normal  0.0158469 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4593  NMT1/THI5 like domain protein  29.71 
 
 		 335 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0354  NMT1/THI5 like domain protein  24.14 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0408  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.29 
 
 		 438 aa  57  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0469  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.89 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4148  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  30.46 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.193725  normal  0.38818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>