252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4038 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 
356 aa  722    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  75.15 
 
 
364 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  75.45 
 
 
337 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  75.45 
 
 
337 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  75.45 
 
 
337 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  75.45 
 
 
337 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  75.45 
 
 
337 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  75.15 
 
 
337 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  75.45 
 
 
337 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0036  NMT1/THI5-like domain-containing protein  78.14 
 
 
334 aa  501  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4035  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  77.38 
 
 
339 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0495  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  76.72 
 
 
339 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106589  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3959  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  75.57 
 
 
336 aa  498  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3218  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  77.56 
 
 
334 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0026  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  76.6 
 
 
334 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0035  NMT1/THI5-like domain-containing protein  76.28 
 
 
334 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0036  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  75.96 
 
 
334 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0034  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  75.96 
 
 
334 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0053  NMT1/THI5-like domain-containing protein  75.96 
 
 
334 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  61.18 
 
 
349 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  59.94 
 
 
349 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  58.7 
 
 
328 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3512  NMT1/THI5-like domain-containing protein  63.46 
 
 
345 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1529  putative substrate-binding component of ABC transporter  59.59 
 
 
348 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5343  putative ABC transporter, substrate-binding protein  59.59 
 
 
337 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.524159 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3118  ABC transporter, substrate-binding protein  61.08 
 
 
336 aa  396  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.671223  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5063  putative ABC transporter, substrate-binding protein  58.7 
 
 
337 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3116  ABC transporter, substrate-binding protein  59.24 
 
 
336 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3327  ABC transporter substrate binding protein  59.08 
 
 
303 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0952  putative substrate-binding component of ABC transporter  52.45 
 
 
332 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0791916  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  41.35 
 
 
332 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  39.1 
 
 
341 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  39.61 
 
 
340 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  38.53 
 
 
342 aa  236  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  39.74 
 
 
341 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  38.8 
 
 
333 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  37.32 
 
 
349 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  37.46 
 
 
349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.75 
 
 
344 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  38.19 
 
 
349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  37.26 
 
 
338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.82 
 
 
346 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  36.12 
 
 
346 aa  215  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  35.4 
 
 
349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5603  ABC transporter substrate-binding protein  37.5 
 
 
376 aa  212  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.069875  normal  0.939883 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  35.56 
 
 
340 aa  209  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  36.57 
 
 
347 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  35.83 
 
 
344 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  35.2 
 
 
347 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  32.83 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.97 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.07 
 
 
345 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  36.13 
 
 
334 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  36.13 
 
 
334 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  36.25 
 
 
345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.92 
 
 
345 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  34.53 
 
 
348 aa  193  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2648  putative signal peptide protein  35.22 
 
 
353 aa  192  8e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00493903 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 
332 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  32.9 
 
 
361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1057  extracellular solute-binding protein family 3  34.87 
 
 
332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227515  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  34.93 
 
 
336 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  32.36 
 
 
340 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0589  putative signal peptide protein  30.29 
 
 
355 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.66482  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  31 
 
 
371 aa  164  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  28.74 
 
 
391 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29 
 
 
322 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.8 
 
 
335 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  28.36 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.03 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  27.41 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  27.41 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  27.41 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.64 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.41 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  27.85 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  27.03 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.03 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  23.29 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2525  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.23 
 
 
321 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.610523  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2570  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.23 
 
 
321 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4935  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.25 
 
 
325 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2562  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.65 
 
 
321 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1035  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  26.67 
 
 
349 aa  63.2  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2963  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  24.1 
 
 
341 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0954314  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0465  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.27 
 
 
347 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.176308  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0806  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  22.52 
 
 
328 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488938  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2209  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  30.56 
 
 
327 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00476916  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  28.32 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0406  NMT1/THI5 like domain protein  26.22 
 
 
334 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2720  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.93 
 
 
336 aa  57.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2620  NMT1/THI5 like domain protein  24.11 
 
 
328 aa  57.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.985405  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2859  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.14 
 
 
317 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23743  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1347  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.32 
 
 
330 aa  57.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0041  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.32 
 
 
338 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.487407 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1430  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.11 
 
 
314 aa  57  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1047  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 
322 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1134  NMT1/THI5 like domain protein  25.82 
 
 
365 aa  57  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  23.21 
 
 
319 aa  56.2  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>