More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2254 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
336 aa  675    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  58.08 
 
 
340 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  44.31 
 
 
340 aa  279  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  43.73 
 
 
349 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  43.73 
 
 
349 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  45.28 
 
 
344 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  43.77 
 
 
349 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  43.85 
 
 
349 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  42.31 
 
 
344 aa  255  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  43.33 
 
 
346 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.26 
 
 
346 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  43.53 
 
 
347 aa  252  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  43.35 
 
 
347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  42.22 
 
 
332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  41.19 
 
 
346 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  40.88 
 
 
346 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  44.34 
 
 
338 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.51 
 
 
345 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  40.19 
 
 
345 aa  231  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  40.51 
 
 
345 aa  228  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  40.51 
 
 
348 aa  225  8e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  38.54 
 
 
341 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  38.87 
 
 
341 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  41.98 
 
 
332 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  37.5 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  37.5 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1057  extracellular solute-binding protein family 3  42.66 
 
 
332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227515  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  35.84 
 
 
371 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  37.31 
 
 
333 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  37.46 
 
 
340 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  36.05 
 
 
342 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  35.39 
 
 
361 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2648  putative signal peptide protein  36.58 
 
 
353 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00493903 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  34.24 
 
 
356 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3959  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.79 
 
 
336 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  34.71 
 
 
337 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  34.83 
 
 
364 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4035  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  34.14 
 
 
339 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  34.83 
 
 
337 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  34.83 
 
 
337 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  34.83 
 
 
337 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  34.83 
 
 
337 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  34.83 
 
 
337 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  34.83 
 
 
337 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0495  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.11 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106589  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0589  putative signal peptide protein  36.6 
 
 
355 aa  173  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.66482  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3512  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.79 
 
 
345 aa  169  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  33.79 
 
 
328 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1529  putative substrate-binding component of ABC transporter  33.56 
 
 
348 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0036  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.14 
 
 
334 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0053  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.33 
 
 
334 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0035  NMT1/THI5-like domain-containing protein  32.99 
 
 
334 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3218  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.33 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0026  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  32.99 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  33.03 
 
 
349 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0036  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  32.99 
 
 
334 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0034  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  32.99 
 
 
334 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  33.03 
 
 
349 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0952  putative substrate-binding component of ABC transporter  32.43 
 
 
332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0791916  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5063  putative ABC transporter, substrate-binding protein  32.53 
 
 
337 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5343  putative ABC transporter, substrate-binding protein  31.85 
 
 
337 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.524159 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3116  ABC transporter, substrate-binding protein  32.76 
 
 
336 aa  149  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3327  ABC transporter substrate binding protein  31.97 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3118  ABC transporter, substrate-binding protein  31.4 
 
 
336 aa  142  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.671223  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  27.21 
 
 
391 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5603  ABC transporter substrate-binding protein  25.73 
 
 
376 aa  95.9  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.069875  normal  0.939883 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2293  membrane lipoprotein lipid attachment site  27.3 
 
 
336 aa  88.6  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  27.01 
 
 
340 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2575  hypothetical protein  27.84 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.225151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.26 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2782  ABC transporter substrate-binding protein  23.34 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11510  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  23.9 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000048144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.05 
 
 
335 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.78 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.51 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  24.1 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  23.7 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.7 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  24.9 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.78 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2964  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  28.25 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0878  hypothetical protein  25.08 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0057402  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  30.33 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  23.38 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  23.05 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.05 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  23.2 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0806  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  23.76 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5414  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  28.15 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.445951  hitchhiker  0.00207004 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4935  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.28 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4331  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.34 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.72 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1134  NMT1/THI5 like domain protein  27.06 
 
 
365 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6158  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  32.89 
 
 
337 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2507  ABC transporter substrate-binding protein  29.72 
 
 
334 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.553979  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  30.11 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1347  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.83 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2570  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.47 
 
 
321 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2525  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.47 
 
 
321 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.610523  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2659  NMT1/THI5 like domain protein  25.96 
 
 
324 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>