259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3280 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  100 
 
 		 349 aa  703    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  96.85 
 
 		 349 aa  686    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  81.85 
 
 		 328 aa  535  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  63.55 
 
 		 337 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  63.55 
 
 		 337 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  63.55 
 
 		 337 aa  418  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  61.18 
 
 		 356 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  63.02 
 
 		 337 aa  418  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  63.55 
 
 		 337 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  63.55 
 
 		 337 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  62.74 
 
 		 364 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0036  NMT1/THI5-like domain-containing protein  62.9 
 
 		 334 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3218  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  62.06 
 
 		 334 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  63.23 
 
 		 337 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0035  NMT1/THI5-like domain-containing protein  62.38 
 
 		 334 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4035  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  62.05 
 
 		 339 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3959  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  61.11 
 
 		 336 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0026  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  62.7 
 
 		 334 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0495  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  61.72 
 
 		 339 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0036  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  62.38 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0034  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  62.38 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0053  NMT1/THI5-like domain-containing protein  62.38 
 
 		 334 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5343  putative ABC transporter, substrate-binding protein  56.03 
 
 		 337 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.524159 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3118  ABC transporter, substrate-binding protein  54.55 
 
 		 336 aa  363  3e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.671223  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3116  ABC transporter, substrate-binding protein  53.85 
 
 		 336 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5063  putative ABC transporter, substrate-binding protein  55.05 
 
 		 337 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3512  NMT1/THI5-like domain-containing protein  52.47 
 
 		 345 aa  359  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1529  putative substrate-binding component of ABC transporter  52.81 
 
 		 348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3327  ABC transporter substrate binding protein  53.47 
 
 		 303 aa  349  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0952  putative substrate-binding component of ABC transporter  47.35 
 
 		 332 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0791916  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  39.75 
 
 		 332 aa  232  7.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  38.91 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  37.2 
 
 		 349 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  37.79 
 
 		 341 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  36.61 
 
 		 349 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  37.38 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  36.62 
 
 		 342 aa  222  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  37.34 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  36.22 
 
 		 349 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  35.74 
 
 		 340 aa  212  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  34.35 
 
 		 347 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  35.9 
 
 		 344 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  36.54 
 
 		 347 aa  209  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  36.09 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  36.09 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  35.26 
 
 		 344 aa  202  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  34.95 
 
 		 333 aa  202  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.36 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  35.39 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  36.6 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.27 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  38.31 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.98 
 
 		 346 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  32.81 
 
 		 346 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  35.35 
 
 		 348 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  35.09 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5603  ABC transporter substrate-binding protein  35.14 
 
 		 376 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.069875  normal  0.939883 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  33.84 
 
 		 371 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  30.12 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  33.22 
 
 		 332 aa  176  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1057  extracellular solute-binding protein family 3  33.66 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227515  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2648  putative signal peptide protein  35.81 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00493903 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0589  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 355 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.66482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  30.77 
 
 		 340 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  33.22 
 
 		 336 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  26.74 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1134  NMT1/THI5 like domain protein  25.46 
 
 		 365 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  23.79 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11510  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  22.1 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000048144  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2720  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1144  NMT1/THI5 like domain protein  23 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3168  ABC transporter, periplasmic binding protein  25.94 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3906  WD-40 repeat-containing protein  25.94 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.92 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2659  NMT1/THI5 like domain protein  27.88 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535056  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.7 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1347  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.23 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2645  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  28.65 
 
 		 320 aa  62  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4931  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  24.76 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3098  hypothetical protein  25.21 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0406  NMT1/THI5 like domain protein  24.41 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2561  NLPA lipoprotein  24.15 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.79068 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2575  hypothetical protein  21.43 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.225151  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1430  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.11 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3641  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0351893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1570  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1047  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1647  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  22.12 
 
 		 324 aa  59.3  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  27.12 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2859  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.38 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4355  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  25.99 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000418029  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0362  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0825  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  22.13 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.262946  normal  0.791109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6455  ABC transporter substrate-binding protein  27.01 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.871345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2969  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  27.08 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381415  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5921  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.15 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  0.23339 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2620  NMT1/THI5 like domain protein  23.42 
 
 		 328 aa  57  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.985405  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  28.89 
 
 		 311 aa  57  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0454  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.47 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8277  ABC transport system substrate-binding protein  23.79 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0627957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>