More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2258 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 
340 aa  691    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  59.09 
 
 
336 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  43.49 
 
 
340 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  43.79 
 
 
349 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  44.14 
 
 
349 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  44.94 
 
 
349 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  42.06 
 
 
349 aa  275  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  45.62 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  43.58 
 
 
347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  42.38 
 
 
344 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  39.35 
 
 
344 aa  265  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  42.69 
 
 
347 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  41.82 
 
 
346 aa  262  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.46 
 
 
346 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  41.57 
 
 
346 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  43.75 
 
 
345 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  42.9 
 
 
348 aa  256  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  42.58 
 
 
346 aa  255  6e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  41.19 
 
 
332 aa  255  9e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.03 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  43.71 
 
 
345 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  39.23 
 
 
371 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  40.32 
 
 
341 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  39.68 
 
 
341 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  39.33 
 
 
342 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  38.46 
 
 
333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  38.31 
 
 
340 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  35.91 
 
 
361 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1057  extracellular solute-binding protein family 3  42.39 
 
 
332 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  40.19 
 
 
332 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  36.98 
 
 
334 aa  215  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  36.98 
 
 
334 aa  215  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2648  putative signal peptide protein  35.21 
 
 
353 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00493903 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0589  putative signal peptide protein  35.23 
 
 
355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.66482  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  32.36 
 
 
356 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  30.93 
 
 
337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4035  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  33.44 
 
 
339 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3959  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.79 
 
 
336 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  31.02 
 
 
364 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  31.02 
 
 
337 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1529  putative substrate-binding component of ABC transporter  30.63 
 
 
348 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  31.02 
 
 
337 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  31.02 
 
 
337 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  31.02 
 
 
337 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  31.02 
 
 
337 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  31.02 
 
 
337 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0495  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.82 
 
 
339 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106589  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  31.1 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  30.77 
 
 
349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  28.66 
 
 
328 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0036  NMT1/THI5-like domain-containing protein  32.88 
 
 
334 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5063  putative ABC transporter, substrate-binding protein  31.85 
 
 
337 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5343  putative ABC transporter, substrate-binding protein  31.51 
 
 
337 aa  159  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.524159 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3512  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.9 
 
 
345 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0053  NMT1/THI5-like domain-containing protein  32.08 
 
 
334 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3218  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  31.74 
 
 
334 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0035  NMT1/THI5-like domain-containing protein  32.42 
 
 
334 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0026  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  32.42 
 
 
334 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0952  putative substrate-binding component of ABC transporter  30.27 
 
 
332 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0791916  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3116  ABC transporter, substrate-binding protein  30.06 
 
 
336 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0036  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  31.74 
 
 
334 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0034  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  31.74 
 
 
334 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3118  ABC transporter, substrate-binding protein  30.38 
 
 
336 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.671223  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3327  ABC transporter substrate binding protein  29.35 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  26.14 
 
 
391 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  27.78 
 
 
340 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4935  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.37 
 
 
325 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 
335 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  25.09 
 
 
335 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.09 
 
 
335 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2575  hypothetical protein  28.46 
 
 
336 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.225151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  25 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 
335 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.04 
 
 
335 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  25.27 
 
 
325 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.84 
 
 
335 aa  89.7  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.72 
 
 
335 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.36 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  23 
 
 
334 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11510  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  28.45 
 
 
336 aa  87  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000048144  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2293  membrane lipoprotein lipid attachment site  23.99 
 
 
336 aa  86.7  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2782  ABC transporter substrate-binding protein  24.61 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0806  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  27.46 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5603  ABC transporter substrate-binding protein  23.1 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.069875  normal  0.939883 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3256  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  25.7 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0115  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.64 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5316  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  30.74 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.34 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4876  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  30.74 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3098  hypothetical protein  25 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1347  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.99 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0878  hypothetical protein  25.47 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0057402  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  29.76 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2645  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.65 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  26.61 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6455  ABC transporter substrate-binding protein  25.24 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.871345  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  27.01 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1682  hypothetical protein  29.25 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2306  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  35.33 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.779689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>