150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0952 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0952  putative substrate-binding component of ABC transporter  100 
 
 		 332 aa  671    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0791916  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1529  putative substrate-binding component of ABC transporter  60.98 
 
 		 348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3512  NMT1/THI5-like domain-containing protein  59.04 
 
 		 345 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3116  ABC transporter, substrate-binding protein  58.57 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3118  ABC transporter, substrate-binding protein  58.36 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.671223  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5063  putative ABC transporter, substrate-binding protein  59.48 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5343  putative ABC transporter, substrate-binding protein  60.6 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.524159 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3327  ABC transporter substrate binding protein  59.6 
 
 		 303 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4035  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  54.97 
 
 		 339 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0495  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.1 
 
 		 339 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3959  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.64 
 
 		 336 aa  332  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  52.19 
 
 		 356 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  52.98 
 
 		 337 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  52.98 
 
 		 337 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  52.98 
 
 		 337 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  52.98 
 
 		 337 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  52.98 
 
 		 337 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  52.98 
 
 		 337 aa  315  9e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  52.65 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  51.39 
 
 		 364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0036  NMT1/THI5-like domain-containing protein  52.98 
 
 		 334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3218  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  51.99 
 
 		 334 aa  309  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0026  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  52.32 
 
 		 334 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0036  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  52.98 
 
 		 334 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0034  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  52.98 
 
 		 334 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0053  NMT1/THI5-like domain-containing protein  52.98 
 
 		 334 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0035  NMT1/THI5-like domain-containing protein  51.99 
 
 		 334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  47.2 
 
 		 328 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  47.04 
 
 		 349 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  47.35 
 
 		 349 aa  298  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  40 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  38.41 
 
 		 341 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  37.84 
 
 		 344 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  38.85 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5603  ABC transporter substrate-binding protein  39.62 
 
 		 376 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.069875  normal  0.939883 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  40.14 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  40.14 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  38.39 
 
 		 347 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  38.39 
 
 		 347 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.76 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  38.02 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.69 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  38.94 
 
 		 345 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  37.42 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  36.39 
 
 		 346 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  35.24 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  35.24 
 
 		 349 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  36.23 
 
 		 333 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  35.81 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  38.61 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  35.26 
 
 		 342 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  35.48 
 
 		 340 aa  192  7e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.55 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  34.24 
 
 		 346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  37.38 
 
 		 332 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1057  extracellular solute-binding protein family 3  37.7 
 
 		 332 aa  189  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227515  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  35.13 
 
 		 348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  34.09 
 
 		 349 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  34.42 
 
 		 344 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2648  putative signal peptide protein  33.02 
 
 		 353 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00493903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  29.61 
 
 		 361 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  32.08 
 
 		 371 aa  149  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  30.27 
 
 		 340 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0589  putative signal peptide protein  28.12 
 
 		 355 aa  135  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.66482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  26.8 
 
 		 391 aa  92.8  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  25.85 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5799  twin-arginine translocation pathway signal  25.9 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2575  hypothetical protein  25.51 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.225151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  23.59 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  28.93 
 
 		 339 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2525  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.12 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.610523  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2570  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.12 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.43 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  24.34 
 
 		 460 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2562  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.63 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.18 
 
 		 335 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  23.18 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.77 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  25.11 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  28.95 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1647  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  26.87 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4767  NlpA lipoprotein  26.61 
 
 		 348 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1134  NMT1/THI5 like domain protein  25.11 
 
 		 365 aa  50.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2720  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 325 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1423  extracellular solute-binding protein family 3  30.15 
 
 		 326 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0964  putative nitrate transporter component  21.79 
 
 		 486 aa  50.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.511943 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1347  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.27 
 
 		 330 aa  50.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.15 
 
 		 326 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.302787 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.11 
 
 		 335 aa  50.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3774  putative nitrate transporter component, NrtA  24.27 
 
 		 454 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.944319  normal  0.102556 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  24.18 
 
 		 338 aa  49.7  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1212  NMT1/THI5 like domain protein  30.15 
 
 		 326 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0153956  normal  0.631224 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  22.19 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1047  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.19 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2963  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  26.32 
 
 		 341 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0954314  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4513  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.14 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  31.25 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0465  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.176308  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>