More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0284 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  93.06 
 
 
346 aa  655    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  100 
 
 
346 aa  701    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  59.01 
 
 
338 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1057  extracellular solute-binding protein family 3  62.78 
 
 
332 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  60.9 
 
 
332 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  46.2 
 
 
349 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  46.2 
 
 
349 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  46.47 
 
 
349 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  43.92 
 
 
332 aa  287  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  44.78 
 
 
340 aa  285  7e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  46.04 
 
 
347 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  43.89 
 
 
344 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  45.89 
 
 
347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  43.55 
 
 
349 aa  269  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  44.55 
 
 
346 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  45.66 
 
 
345 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  42.86 
 
 
344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  45.22 
 
 
345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.64 
 
 
346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.9 
 
 
345 aa  265  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  42.58 
 
 
348 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  40.19 
 
 
334 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  40.19 
 
 
334 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2648  putative signal peptide protein  38.51 
 
 
353 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00493903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  39.74 
 
 
361 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  42.22 
 
 
340 aa  235  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  37.86 
 
 
341 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  37.42 
 
 
333 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  35.87 
 
 
341 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  36.01 
 
 
340 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  36.69 
 
 
342 aa  222  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  35.8 
 
 
371 aa  220  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  34.99 
 
 
364 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  34.99 
 
 
337 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  34.99 
 
 
337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  34.99 
 
 
337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  34.99 
 
 
337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  34.99 
 
 
337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  34.99 
 
 
337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  35.28 
 
 
337 aa  216  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  40.45 
 
 
336 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0589  putative signal peptide protein  34.77 
 
 
355 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.66482  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3218  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.42 
 
 
334 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0036  NMT1/THI5-like domain-containing protein  35.67 
 
 
334 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  33.65 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0053  NMT1/THI5-like domain-containing protein  35.11 
 
 
334 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0036  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  34.8 
 
 
334 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0034  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  34.8 
 
 
334 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0035  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.17 
 
 
334 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0026  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.86 
 
 
334 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5063  putative ABC transporter, substrate-binding protein  33.44 
 
 
337 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0952  putative substrate-binding component of ABC transporter  34.24 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0791916  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3512  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.36 
 
 
345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3116  ABC transporter, substrate-binding protein  31.93 
 
 
336 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3959  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.68 
 
 
336 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1529  putative substrate-binding component of ABC transporter  32.8 
 
 
348 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5343  putative ABC transporter, substrate-binding protein  32.45 
 
 
337 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.524159 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0495  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.68 
 
 
339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106589  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4035  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  32.79 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3118  ABC transporter, substrate-binding protein  31.45 
 
 
336 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.671223  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  30.12 
 
 
349 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3327  ABC transporter substrate binding protein  31.46 
 
 
303 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  30.12 
 
 
349 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  30.67 
 
 
328 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5603  ABC transporter substrate-binding protein  27.15 
 
 
376 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.069875  normal  0.939883 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  26.35 
 
 
391 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2570  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  34.67 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2525  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  34.67 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.610523  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2562  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  34.67 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  26.81 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2963  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  25.61 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0954314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2575  hypothetical protein  27.2 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.225151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  26.5 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.47 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  26.61 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.61 
 
 
335 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  26.61 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.61 
 
 
335 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2564  putative ABC transporter, periplasmic subunit  29.91 
 
 
334 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365629 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  26.61 
 
 
335 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.61 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  26.18 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.18 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0777  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.82 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11510  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  27.04 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000048144  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4935  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.18 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1430  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.23 
 
 
314 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3641  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  29.27 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105087  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  26.07 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19500  hypothetical protein  27.55 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2293  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.79 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2165  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  26.45 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2834  twin-arginine translocation pathway signal  27.78 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.960299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1678  hypothetical protein  27.17 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0878  hypothetical protein  25.36 
 
 
329 aa  67  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0057402  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2276  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.48 
 
 
401 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.278656  normal  0.376143 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1757  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  23.73 
 
 
346 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502422  normal  0.0158469 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1347  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.68 
 
 
330 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2219  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  28.24 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5064  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.98 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133964  normal  0.134479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>