More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1814 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  100 
 
 
322 aa  635    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  44.2 
 
 
327 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5419  NMT1/THI5 like domain protein  34.46 
 
 
345 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4669  NMT1/THI5 like domain protein  39.52 
 
 
335 aa  196  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  36.19 
 
 
319 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  34.97 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0457  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  32.93 
 
 
333 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2477  NMT1/THI5 like domain protein  28.94 
 
 
331 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0288  NMT1/THI5 like domain protein  32.35 
 
 
327 aa  123  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133462  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3083  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.34 
 
 
328 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2330  NMT1/THI5 like domain-containing protein  27 
 
 
314 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5731  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.2 
 
 
329 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5352  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.2 
 
 
329 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5441  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.2 
 
 
329 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.558403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3542  NLPA lipoprotein  27.64 
 
 
313 aa  90.1  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0833  ABC transporter, substrate binding protein  29.33 
 
 
335 aa  89.4  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0266  NMT1/THI5 like domain protein  27.15 
 
 
334 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3748  ABC transporter, substrate binding protein  25.33 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  29.03 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
347 aa  82.4  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  29.84 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0465  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.26 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.176308  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  29.03 
 
 
460 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  29.44 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0291  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  30.28 
 
 
320 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000806858 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.48 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2107  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  27.24 
 
 
529 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.287431  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1570  extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0292  ABC transporter nitrate-binding protein  28.47 
 
 
451 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  29.1 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2277  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.59 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191617  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.08 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0997  ABC transporter nitrate-binding protein  26.55 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1035  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  28.44 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7861  hypothetical protein  25 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491165  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2673  putative ABC transporter, substrate binding protein  31.61 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416834  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4876  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  29.48 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  26.77 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0325  NMT1/THI5 like domain protein  28.29 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5981  ABC transporter substrate-binding protein  25.42 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  28.8 
 
 
371 aa  72.8  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3742  twin-arginine translocation pathway signal  26.86 
 
 
467 aa  72.4  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  29 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0105  NMT1/THI5 like domain protein  24.17 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.318497  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  26.91 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3487  putative nitrate transporter component, nrtA  26.59 
 
 
464 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5316  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  29.08 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3972  ABC transporter nitrate-binding protein  26.3 
 
 
471 aa  70.1  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  28.21 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  26.94 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  28.21 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0114  sulfonate binding protein  26.41 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.802065  hitchhiker  0.00280198 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  28.21 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  28.21 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  28.21 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  28.21 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.24 
 
 
346 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5471  ABC transporter substrate binding protein (aliphatic sulfonate)  31.4 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  28.21 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3462  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  29.38 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  25.16 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  38.36 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5414  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  29.71 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.445951  hitchhiker  0.00207004 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  27.52 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40070  periplasmic sulfonate-binding protein of ABC transporter  29.76 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30510  ABC transporter periplasmic aliphatic sulfonate-binding protein  28.2 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.846388  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1144  NMT1/THI5 like domain protein  27.24 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144377  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5799  twin-arginine translocation pathway signal  28.14 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  29.41 
 
 
339 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2969  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  27.31 
 
 
321 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381415  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  27.24 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0466  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  29.94 
 
 
330 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.93 
 
 
345 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1682  hypothetical protein  34.64 
 
 
323 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1047  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 
322 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0363  putative sulfonate/nitrate/taurine transport system substrate-binding protein  31.68 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 
336 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9276  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  28.29 
 
 
355 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19540  hypothetical protein  34.64 
 
 
323 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0383  NlpA lipoprotein  24.5 
 
 
312 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391974  normal  0.191867 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  24.09 
 
 
338 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4880  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  36.21 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.184039  normal  0.779449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2403  ABC transporter nitrate-binding protein  26.42 
 
 
462 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0310148  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1185  ABC transporter, substrate binding protein  24.1 
 
 
331 aa  64.3  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.987715  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  24.73 
 
 
433 aa  63.9  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  24.09 
 
 
335 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2834  twin-arginine translocation pathway signal  26.43 
 
 
411 aa  63.5  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.960299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  30.47 
 
 
349 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  24.07 
 
 
325 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1483  ABC transporter substrate-binding protein  31.43 
 
 
330 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.09 
 
 
335 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.8 
 
 
335 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6455  ABC transporter substrate-binding protein  26.5 
 
 
314 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.871345  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  29.92 
 
 
349 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1469  aliphatic compound ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.53 
 
 
328 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  29.92 
 
 
340 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2622  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  23.88 
 
 
341 aa  62.8  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000404129  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0964  putative nitrate transporter component  25.62 
 
 
486 aa  62.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.511943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>