66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3350 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  100 
 
 
364 aa  756    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000374426  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11510  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  34.08 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000048144  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  32.35 
 
 
340 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2556  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  29.43 
 
 
365 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0878  hypothetical protein  32.06 
 
 
329 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0057402  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  29.46 
 
 
337 aa  176  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2293  membrane lipoprotein lipid attachment site  32.2 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1474  hypothetical protein  31.66 
 
 
332 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000729086  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2782  ABC transporter substrate-binding protein  29.73 
 
 
332 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2575  hypothetical protein  28.81 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.225151  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1347  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.57 
 
 
330 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  26.36 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.75 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.4 
 
 
335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.84 
 
 
335 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.5 
 
 
335 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  25.5 
 
 
335 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  25.34 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4935  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.17 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  24.83 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  25 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2778  NMT1/THI5 like domain protein  22.73 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0494  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  21.18 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.547109  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.61 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  23.86 
 
 
344 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  23.11 
 
 
349 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  24.42 
 
 
349 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  24.42 
 
 
349 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  23.81 
 
 
349 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 
340 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  24.8 
 
 
348 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6301  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.41 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  27.3 
 
 
391 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 
347 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 
347 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.57 
 
 
344 aa  57  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.07 
 
 
346 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  22.69 
 
 
328 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  21.93 
 
 
371 aa  54.3  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  20.86 
 
 
336 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  21.58 
 
 
356 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0619  NMT1/THI5 like domain protein  22.22 
 
 
339 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1180  putative ABC transporter, periplasmic protein  19.94 
 
 
323 aa  52.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  20.58 
 
 
346 aa  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1285  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.3 
 
 
341 aa  51.2  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0376066 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  20.77 
 
 
334 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  20.77 
 
 
334 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  22.18 
 
 
346 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  23.2 
 
 
340 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  21.69 
 
 
346 aa  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  23.32 
 
 
345 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.32 
 
 
345 aa  49.7  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  21.71 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  20.66 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.13 
 
 
345 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  21.01 
 
 
341 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2659  NMT1/THI5 like domain protein  23.36 
 
 
324 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535056  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2165  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  25.91 
 
 
345 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  21.74 
 
 
342 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  20.86 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4888  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  21.76 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.962716  normal  0.144986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0589  putative signal peptide protein  22.4 
 
 
355 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.66482  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0520  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.07 
 
 
323 aa  43.9  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6336  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.21 
 
 
396 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0652  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  35.71 
 
 
261 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>