52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2556 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2556  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  100 
 
 		 365 aa  748    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.43 
 
 		 364 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000374426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1474  hypothetical protein  30.68 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000729086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  29.39 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2293  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.78 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2575  hypothetical protein  31.23 
 
 		 336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.225151  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  28.09 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11510  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  29.35 
 
 		 336 aa  153  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000048144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0878  hypothetical protein  27.71 
 
 		 329 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0057402  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1347  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.24 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.68 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  25.68 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.98 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.98 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2782  ABC transporter substrate-binding protein  24.26 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.38 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  25.67 
 
 		 334 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.9 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  25.9 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  25.68 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  25.9 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4935  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.9 
 
 		 325 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0494  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.62 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.547109  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2778  NMT1/THI5 like domain protein  22 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  25.55 
 
 		 312 aa  54.7  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.22 
 
 		 338 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2986  NMT1/THI5 like domain protein  28.86 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.4 
 
 		 336 aa  50.4  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  21.72 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.36 
 
 		 331 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.34 
 
 		 346 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1901  twin-arginine translocation pathway signal  22.49 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00273857  hitchhiker  0.00000000000094829 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 347 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  23.51 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  19.81 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  22.99 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  22.99 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0878  NMT1/THI5 like domain protein  21.47 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000508636  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.21 
 
 		 316 aa  44.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  23.21 
 
 		 316 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0454  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  21.92 
 
 		 327 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  22.18 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.35 
 
 		 344 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 332 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6513  twin-arginine translocation pathway signal  28.1 
 
 		 396 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.47119  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6747  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system periplasmic component  28.1 
 
 		 396 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.248513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0769  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.5 
 
 		 354 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2648  putative signal peptide protein  21.97 
 
 		 353 aa  43.1  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00493903 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5127  Fis family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 325 aa  43.1  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295645  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  21.84 
 
 		 346 aa  43.1  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>