135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0454 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0454  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 
327 aa  663    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4355  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  24.79 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000418029  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0212  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.25 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  27.39 
 
 
360 aa  67  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1134  NMT1/THI5 like domain protein  24.12 
 
 
365 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0520  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.5 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1999  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.25 
 
 
331 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1144  NMT1/THI5 like domain protein  24.54 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144377  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.45 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  26.92 
 
 
338 aa  60.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2330  NMT1/THI5 like domain-containing protein  25.75 
 
 
314 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1032  putative aliphatic sulfonate binding protein precursor  23.46 
 
 
327 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  29.95 
 
 
340 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2920  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  25.9 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10374e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1678  hypothetical protein  24.92 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  30.77 
 
 
344 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  23.13 
 
 
328 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2713  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  26.29 
 
 
328 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.38086  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2921  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  26.29 
 
 
328 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  23.47 
 
 
349 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  24.41 
 
 
356 aa  56.6  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2641  alkanesulfonates-binding protein  24.59 
 
 
328 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.245447  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3512  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.25 
 
 
345 aa  56.2  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2664  alkanesulfonates-binding protein  24.59 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760849  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0806  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  21.73 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488938  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19500  hypothetical protein  25 
 
 
334 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  25.65 
 
 
356 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  23.32 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4540  NMT1/THI5 like domain protein  23.29 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.184718 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3327  ABC transporter substrate binding protein  23.98 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  25.5 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5603  ABC transporter substrate-binding protein  24.32 
 
 
376 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.069875  normal  0.939883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1172  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.22 
 
 
358 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811616  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2931  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  25.4 
 
 
328 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6388  aliphatic sulfonate ABC transporter substrate-binding protein  22.83 
 
 
327 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.249456 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  31.22 
 
 
311 aa  53.9  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6202  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.93 
 
 
339 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.288537 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3116  ABC transporter, substrate-binding protein  22.34 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3218  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  25.45 
 
 
334 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0405  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  25.69 
 
 
331 aa  53.1  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  25.4 
 
 
328 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2205  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  20.72 
 
 
332 aa  52.8  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142056  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  25.64 
 
 
364 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0465  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.75 
 
 
347 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.176308  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3118  ABC transporter, substrate-binding protein  23.31 
 
 
336 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.671223  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1644  twin-arginine translocation pathway signal  26.74 
 
 
343 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  decreased coverage  0.00621187 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3018  NMT1/THI5 like domain protein  25.35 
 
 
342 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  25.64 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  27.1 
 
 
349 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  25.64 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  25.64 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  25.64 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  25.64 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  25.64 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2622  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  24.07 
 
 
341 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000404129  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5343  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.58 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.524159 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  24.44 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.34 
 
 
336 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
341 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 
341 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.88 
 
 
344 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2967  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  25.1 
 
 
328 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3647  NMT1/THI5 like domain protein  26.72 
 
 
336 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4301  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  25.86 
 
 
365 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389589  hitchhiker  0.0000586034 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0400  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  31.09 
 
 
316 aa  49.7  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.882612  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.13 
 
 
336 aa  49.7  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  25.58 
 
 
391 aa  49.7  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5063  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.15 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0851  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.13 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0219644  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1901  NMT1/THI5 like domain protein  23.56 
 
 
353 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3936  NMT1/THI5 like domain protein  26.64 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0655  NMT1/THI5-like protein  23.05 
 
 
350 aa  48.1  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1647  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  21.57 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3439  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  25 
 
 
345 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.93 
 
 
335 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0085  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.01 
 
 
350 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2788  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.42 
 
 
336 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0498257  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
340 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5127  Fis family transcriptional regulator  20.9 
 
 
325 aa  47  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295645  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4021  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.31 
 
 
326 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.391639  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4880  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  22.99 
 
 
330 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.184039  normal  0.779449 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1088  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  23.56 
 
 
329 aa  47  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.212665  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4215  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.97 
 
 
330 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0036  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.84 
 
 
334 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  25.23 
 
 
360 aa  46.6  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4767  NlpA lipoprotein  25.5 
 
 
348 aa  46.2  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  23.7 
 
 
778 aa  46.2  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1383  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  23.95 
 
 
349 aa  46.2  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0150888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4035  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  24.63 
 
 
339 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3571  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  29.37 
 
 
357 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1487  extracellular solute-binding protein  22.43 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.143655  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.11 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0495  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.57 
 
 
339 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106589  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0026  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  24.07 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0544  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.98 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.97989  normal  0.846557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7380  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  26.78 
 
 
374 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1920  NMT1/THI5 like domain protein  25.1 
 
 
344 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.14 
 
 
333 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0066  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  28.92 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0035  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.07 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>