112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5921 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5921  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  100 
 
 
302 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  0.23339 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2921  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  27.21 
 
 
331 aa  106  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025215  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1116  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.77 
 
 
330 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0362  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2923  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  25.42 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4355  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  28.3 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000418029  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  27.69 
 
 
328 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  32.1 
 
 
361 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  28.5 
 
 
319 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2659  NMT1/THI5 like domain protein  25.1 
 
 
324 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535056  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  25.49 
 
 
391 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  27.15 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4070  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.95 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.951946  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  27.15 
 
 
349 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0097  NLPA lipoprotein  26.84 
 
 
328 aa  55.8  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2543  putative binding protein  25.64 
 
 
352 aa  55.8  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.721383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.44 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0035  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.68 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3327  ABC transporter substrate binding protein  25.18 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1212  NMT1/THI5 like domain protein  29.15 
 
 
326 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0153956  normal  0.631224 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  27.89 
 
 
348 aa  54.3  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0026  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  27.31 
 
 
334 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0053  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.82 
 
 
334 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  26.95 
 
 
360 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.23 
 
 
327 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  23.02 
 
 
339 aa  53.1  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.15 
 
 
326 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.302787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1423  extracellular solute-binding protein family 3  29.15 
 
 
326 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2219  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  28.57 
 
 
341 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  25.68 
 
 
349 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3678  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  29.46 
 
 
344 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.987849 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4151  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.46 
 
 
344 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  0.147422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1757  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  28.67 
 
 
346 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502422  normal  0.0158469 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3116  ABC transporter, substrate-binding protein  26.84 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3263  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.46 
 
 
344 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0622389  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5343  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.24 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.524159 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5063  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.6 
 
 
337 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  26.77 
 
 
337 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4112  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  29.46 
 
 
344 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4254  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  29.46 
 
 
344 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000917513  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  25.85 
 
 
349 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.65 
 
 
322 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  26.67 
 
 
364 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0363  putative sulfonate/nitrate/taurine transport system substrate-binding protein  25.18 
 
 
317 aa  50.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0036  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  27.44 
 
 
334 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0034  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  27.44 
 
 
334 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  22.22 
 
 
360 aa  50.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4459  NMT1/THI5 like domain protein  30.66 
 
 
335 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0725563  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  26.35 
 
 
349 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0354  NMT1/THI5 like domain protein  25.57 
 
 
316 aa  50.4  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4593  NMT1/THI5 like domain protein  30.66 
 
 
335 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3542  NLPA lipoprotein  24.89 
 
 
313 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0036  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.65 
 
 
334 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  26.57 
 
 
337 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3118  ABC transporter, substrate-binding protein  25.55 
 
 
336 aa  49.7  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.671223  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2375  ABC transporter substrate-binding protein  29.14 
 
 
312 aa  49.7  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  26.57 
 
 
337 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  26.57 
 
 
337 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  26.57 
 
 
337 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  26.57 
 
 
337 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4336  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.97 
 
 
344 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379972  normal  0.507879 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  25.85 
 
 
349 aa  49.7  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  26.67 
 
 
337 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 
347 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 
347 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4052  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.08 
 
 
354 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1973  NLPA lipoprotein  25.47 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000524772  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36967  predicted protein  28.67 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.177714  normal  0.228714 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3959  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.64 
 
 
336 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3168  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.98 
 
 
343 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5012  ABC transporter substrate-binding protein  24.56 
 
 
343 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3906  WD-40 repeat-containing protein  26.98 
 
 
343 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  27.3 
 
 
382 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0288  NMT1/THI5 like domain protein  25.53 
 
 
327 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133462  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  26.74 
 
 
341 aa  47  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.21 
 
 
345 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  27.19 
 
 
356 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.5 
 
 
346 aa  46.2  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  27.11 
 
 
371 aa  46.2  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4091  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.35 
 
 
387 aa  46.2  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00248715  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0955  hypothetical protein  26.48 
 
 
349 aa  45.8  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7652  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  25.87 
 
 
332 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422947  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.57 
 
 
345 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  21.96 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0406  NMT1/THI5 like domain protein  27.57 
 
 
334 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1529  putative substrate-binding component of ABC transporter  25.35 
 
 
348 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5617  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system periplasmic component  29.71 
 
 
368 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  27.89 
 
 
345 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  27.01 
 
 
340 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3869  NMT1/THI5 like domain protein  26.06 
 
 
337 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.478553  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3218  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  24.54 
 
 
334 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.59 
 
 
346 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.97 
 
 
344 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0489  hypothetical protein  24.32 
 
 
315 aa  43.9  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0815  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  24.88 
 
 
326 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  27.59 
 
 
346 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  26.35 
 
 
344 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0260  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.388479  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3607  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.02 
 
 
351 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0793599 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>