90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2921 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2921  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  100 
 
 		 331 aa  672    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025215  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2923  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  43.69 
 
 		 341 aa  287  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1116  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.07 
 
 		 330 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5921  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.21 
 
 		 302 aa  106  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  0.23339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4070  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.78 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.951946  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0362  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0893  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  27.81 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.471336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3542  NLPA lipoprotein  25.19 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4189  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.6 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.623523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0844  ABC transporter substrate-binding protein  22.59 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0806  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  21.92 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3606  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.76 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3081  NMT1/THI5 like domain protein  25.65 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2659  NMT1/THI5 like domain protein  24.3 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535056  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2562  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.63 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0465  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.95 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.176308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14770  NLPA lipoprotein  26.56 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2525  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.15 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.610523  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2570  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.15 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  22.92 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31360  ABC transporter periplasmic aliphatic sulfonate-binding protein  27.85 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.694075  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0354  NMT1/THI5 like domain protein  25.25 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  25.17 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1743  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  31.01 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00139756  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3217  periplasmic aliphatic sulfonate-binding protein, putative  25.93 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  23.27 
 
 		 435 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1788  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, aliphatic sulfonates family  27.05 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1859  ABC transport system substrate-binding protein  23.89 
 
 		 330 aa  54.3  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2514  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.36 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304718 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0167  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.46 
 
 		 385 aa  53.5  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  30.4 
 
 		 339 aa  52.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 		 340 aa  52.8  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0041  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.67 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.487407 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2224  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  24.37 
 
 		 327 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000455762  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.32 
 
 		 327 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1035  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  22.39 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0097  NLPA lipoprotein  27.98 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0889  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  21.55 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.390575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5419  NMT1/THI5 like domain protein  24.02 
 
 		 345 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 		 361 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3886  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.05 
 
 		 374 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4154  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  29.06 
 
 		 367 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0230431  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  29.27 
 
 		 348 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 347 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3462  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  26.02 
 
 		 312 aa  47  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5414  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.35 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.445951  hitchhiker  0.00207004 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0790  NlpA lipoprotein  23.71 
 
 		 327 aa  47  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0774  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  27.01 
 
 		 316 aa  46.2  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0489455 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.69 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.19 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  27.07 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5234  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  22.22 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  27.31 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6690  putative periplasmic substrate-binding subunit (ABC transporter)  23.41 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1631  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  22.92 
 
 		 424 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.33 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2673  putative ABC transporter, substrate binding protein  23.46 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  23.4 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  25.85 
 
 		 657 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  22.94 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1800  NLPA lipoprotein  22.84 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6433  ABC transport system substrate-binding protein  24.55 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9276  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  22.46 
 
 		 355 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2848  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  24.37 
 
 		 350 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6388  aliphatic sulfonate ABC transporter substrate-binding protein  27.93 
 
 		 327 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.249456 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0964  putative nitrate transporter component  22.73 
 
 		 486 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.511943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0081  ABC transport system substrate-binding protein  25.86 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5562  ABC transport system substrate-binding protein  24.11 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5927  ABC transport system substrate-binding protein  24.11 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1377  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.22 
 
 		 329 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358866  hitchhiker  0.00572107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  29.84 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  23.93 
 
 		 385 aa  43.5  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4331  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.71 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4824  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  28.34 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1548  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.06 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40682  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4876  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.65 
 
 		 321 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1057  extracellular solute-binding protein family 3  26.62 
 
 		 332 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227515  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2879  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  25.23 
 
 		 317 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34510  hypothetical protein  28.1 
 
 		 399 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531773  normal  0.0856491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2306  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  23.08 
 
 		 344 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  24.23 
 
 		 667 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  27.33 
 
 		 349 aa  42.7  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  28.36 
 
 		 349 aa  42.7  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.84 
 
 		 345 aa  42.7  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2802  NLPA lipoprotein  23.1 
 
 		 327 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000138117  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 336 aa  42.7  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1172  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.32 
 
 		 358 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811616  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0350  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  27.81 
 
 		 311 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>