31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_36967 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_36967  predicted protein  100 
 
 
307 aa  625  1e-178  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.177714  normal  0.228714 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11058  conserved hypothetical protein  38.82 
 
 
317 aa  205  6e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.800129 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2834  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  33.71 
 
 
283 aa  146  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10968  uracil-DNA glycosylase  33.19 
 
 
284 aa  142  9e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01790  hypothetical protein  32.04 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3433  hypothetical protein  30.98 
 
 
281 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4151  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.46 
 
 
344 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  0.147422 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3678  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  28.46 
 
 
344 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.987849 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3263  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.69 
 
 
344 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0622389  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1757  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  27.91 
 
 
346 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502422  normal  0.0158469 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4336  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.13 
 
 
344 aa  52.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379972  normal  0.507879 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4112  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  26.92 
 
 
344 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4254  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  26.92 
 
 
344 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000917513  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2219  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  25.44 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7504  ABC transporter substrate-binding protein  21.97 
 
 
333 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.776958 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5921  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.67 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  0.23339 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  24.62 
 
 
360 aa  46.6  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4593  NMT1/THI5 like domain protein  25.44 
 
 
335 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4459  NMT1/THI5 like domain protein  25.44 
 
 
335 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0725563  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2375  ABC transporter substrate-binding protein  30.83 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1926  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.97 
 
 
328 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0900124  normal  0.764974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3869  NMT1/THI5 like domain protein  26.32 
 
 
337 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.478553  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.13 
 
 
345 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 
347 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1890  hypothetical protein  29.63 
 
 
328 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0206796  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  27.83 
 
 
333 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000866  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter substrate-binding component  29.46 
 
 
316 aa  43.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0806  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  22.05 
 
 
328 aa  43.1  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488938  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0573  hypothetical protein  25.07 
 
 
367 aa  43.1  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.973448  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 
347 aa  42.7  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  31.36 
 
 
340 aa  42.7  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>