135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0362 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0362  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
310 aa  628  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1116  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.87 
 
 
330 aa  238  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0893  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  31.27 
 
 
305 aa  119  7e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.471336  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4070  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.1 
 
 
295 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.951946  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4477  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5921  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.18 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  0.23339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1548  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.39 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40682  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2921  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  24.58 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025215  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  26.24 
 
 
332 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  27.49 
 
 
348 aa  63.2  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  25.61 
 
 
342 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.29 
 
 
338 aa  62.4  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  33.12 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  30.94 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2923  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  22.17 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  27.96 
 
 
371 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2645  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  29.07 
 
 
320 aa  59.3  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 
341 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  24.2 
 
 
340 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  22.94 
 
 
349 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1047  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  23.38 
 
 
349 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0465  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  32.08 
 
 
347 aa  57.4  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.176308  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.61 
 
 
346 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0889  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  27.35 
 
 
390 aa  57  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.390575  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  23.4 
 
 
319 aa  56.6  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6160  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.22 
 
 
343 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.419436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 
341 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.05 
 
 
333 aa  56.2  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  25.84 
 
 
344 aa  55.8  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  30.25 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  24.34 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1430  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.65 
 
 
314 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2277  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.87 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191617  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 
347 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.8 
 
 
339 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0041  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.41 
 
 
338 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.487407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  26.44 
 
 
361 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3263  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.07 
 
 
344 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0622389  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.97 
 
 
344 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0354  NMT1/THI5 like domain protein  25.23 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  24.86 
 
 
349 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
336 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  23.03 
 
 
349 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.38 
 
 
336 aa  53.1  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  25.17 
 
 
349 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4669  NMT1/THI5 like domain protein  25.66 
 
 
335 aa  52.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
347 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4336  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.33 
 
 
344 aa  52.8  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379972  normal  0.507879 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4112  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  33.33 
 
 
344 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463971  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0154  extracellular solute-binding protein, family 3  31.82 
 
 
323 aa  52.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4254  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  33.33 
 
 
344 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000917513  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1757  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  33.33 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502422  normal  0.0158469 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.12 
 
 
335 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  31.37 
 
 
311 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3678  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  32.59 
 
 
344 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.987849 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  23.68 
 
 
349 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.28 
 
 
331 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1379  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.86 
 
 
312 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0275994 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  22.5 
 
 
364 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0097  NLPA lipoprotein  26.55 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  20.52 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2219  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  33.07 
 
 
341 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2859  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.19 
 
 
317 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23743  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  21.77 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0145  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  31.17 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.156269 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4151  NMT1/THI5-like domain-containing protein  32.59 
 
 
344 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  0.147422 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  27.71 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  20.52 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  20.52 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  20.52 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  20.52 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  20.52 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6455  ABC transporter substrate-binding protein  27.14 
 
 
314 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.871345  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  27.71 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0325  NMT1/THI5 like domain protein  27.27 
 
 
313 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2720  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 
325 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.92 
 
 
327 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2969  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  29.83 
 
 
321 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381415  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 
332 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.73 
 
 
336 aa  49.3  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0036  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.98 
 
 
334 aa  49.3  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4931  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  29.45 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0769  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.14 
 
 
354 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3218  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  22.86 
 
 
334 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4593  NMT1/THI5 like domain protein  32.28 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5127  Fis family transcriptional regulator  23.35 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295645  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0057  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  27.33 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2986  NMT1/THI5 like domain protein  28.77 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1678  hypothetical protein  26.92 
 
 
334 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.66 
 
 
346 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2543  putative binding protein  27.6 
 
 
352 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.721383 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4459  NMT1/THI5 like domain protein  32.28 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0725563  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  30.92 
 
 
345 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3256  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  29.73 
 
 
383 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117955 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0481  NMT1/THI5 like domain protein  23.02 
 
 
327 aa  47  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3641  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 
319 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0351893  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1057  extracellular solute-binding protein family 3  23.87 
 
 
332 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227515  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.61 
 
 
345 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  26.42 
 
 
346 aa  46.6  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>