285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3542 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3542  NLPA lipoprotein  100 
 
 
313 aa  624  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5981  ABC transporter substrate-binding protein  29.65 
 
 
311 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0105  NMT1/THI5 like domain protein  29.63 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.318497  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0383  NlpA lipoprotein  30.88 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391974  normal  0.191867 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0288  NMT1/THI5 like domain protein  26.51 
 
 
327 aa  90.5  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133462  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2330  NMT1/THI5 like domain-containing protein  23.83 
 
 
314 aa  85.9  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.9 
 
 
322 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2477  NMT1/THI5 like domain protein  22.5 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.55 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3748  ABC transporter, substrate binding protein  26.39 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3081  NMT1/THI5 like domain protein  29.12 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3083  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  21.88 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261971  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1800  NLPA lipoprotein  32.52 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6160  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.62 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.419436 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  29.89 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  22.68 
 
 
319 aa  67  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0081  ABC transport system substrate-binding protein  32.95 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44550  ABC transporter periplasmic component  24.79 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4669  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5799  twin-arginine translocation pathway signal  24.63 
 
 
349 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2921  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  25.19 
 
 
331 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025215  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  24.25 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0481  NMT1/THI5 like domain protein  22.33 
 
 
327 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0354  NMT1/THI5 like domain protein  26.6 
 
 
316 aa  63.5  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4215  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.88 
 
 
330 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6388  aliphatic sulfonate ABC transporter substrate-binding protein  26.57 
 
 
327 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.249456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  22.71 
 
 
343 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5127  Fis family transcriptional regulator  23.48 
 
 
325 aa  63.2  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295645  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1901  NMT1/THI5 like domain protein  22.01 
 
 
353 aa  62.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5731  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.53 
 
 
329 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5515  extracellular solute-binding protein family 3  25.79 
 
 
333 aa  62.4  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5352  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.53 
 
 
329 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5441  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.53 
 
 
329 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.558403 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  29.32 
 
 
339 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2098  NMT1/THI5 like domain protein  31.18 
 
 
359 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5419  NMT1/THI5 like domain protein  23.1 
 
 
345 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1411  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.17 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.214398 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  27.62 
 
 
333 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0790  NlpA lipoprotein  28.92 
 
 
327 aa  60.8  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.27 
 
 
333 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.27 
 
 
333 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.62 
 
 
333 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  27.27 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  27.27 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14770  NLPA lipoprotein  22.81 
 
 
315 aa  60.1  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.53 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  27.27 
 
 
333 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.27 
 
 
333 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2923  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  25.44 
 
 
341 aa  59.7  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4025  ABC transport system substrate-binding protein  30.57 
 
 
336 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0167  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.36 
 
 
385 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  27.27 
 
 
333 aa  59.3  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1859  ABC transport system substrate-binding protein  31.75 
 
 
330 aa  59.3  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2620  NMT1/THI5 like domain protein  22.59 
 
 
328 aa  59.3  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.985405  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3730  ABC transport system substrate-binding protein  30.05 
 
 
336 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.201225 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.05 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  23.53 
 
 
360 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0097  NLPA lipoprotein  22.91 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1466  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  31.62 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  23.91 
 
 
329 aa  58.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2782  NLPA lipoprotein  22.26 
 
 
319 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0743027  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  30 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1920  NMT1/THI5 like domain protein  23.71 
 
 
344 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1487  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 
334 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.143655  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2802  NLPA lipoprotein  25.1 
 
 
327 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000138117  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0406  NMT1/THI5 like domain protein  25.1 
 
 
334 aa  57.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2659  NMT1/THI5 like domain protein  24.47 
 
 
324 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535056  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  29.03 
 
 
361 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  31.45 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2952  NMT1/THI5 like domain protein  39.64 
 
 
318 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0621  twin-arginine translocation pathway signal  23.46 
 
 
305 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000550698  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1116  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.13 
 
 
330 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0833  ABC transporter, substrate binding protein  24.04 
 
 
335 aa  56.2  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  22.89 
 
 
311 aa  55.8  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1644  twin-arginine translocation pathway signal  23.83 
 
 
343 aa  56.2  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  decreased coverage  0.00621187 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0465  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.37 
 
 
347 aa  55.8  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.176308  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4540  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.184718 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5064  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.88 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133964  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.12 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4058  twin-arginine translocation pathway signal  32.57 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2219  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  24.82 
 
 
341 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5012  ABC transporter substrate-binding protein  33.77 
 
 
343 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0179  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  30.15 
 
 
326 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.907617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1812  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  30.15 
 
 
326 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.661868  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2673  putative ABC transporter, substrate binding protein  24.31 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416834  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2967  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  24.03 
 
 
328 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2641  alkanesulfonates-binding protein  23.93 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.245447  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  29.51 
 
 
686 aa  53.9  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1570  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 
353 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  25 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  23.75 
 
 
360 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2838  twin-arginine translocation pathway signal  25.82 
 
 
318 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.884222  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  24.22 
 
 
321 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.09 
 
 
335 aa  53.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2402  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  22.88 
 
 
347 aa  53.5  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.150141  normal  0.561383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.43 
 
 
329 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0437  extracellular solute-binding protein family 3  23.38 
 
 
319 aa  52.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0271798  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1743  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  25.08 
 
 
306 aa  52.4  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00139756  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1182  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  22.36 
 
 
342 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.794723  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1757  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  24.82 
 
 
346 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502422  normal  0.0158469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>