103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1304 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1304  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 
417 aa  843    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165264  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4524  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.03 
 
 
374 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2964  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  24.34 
 
 
340 aa  94  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2963  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  25.56 
 
 
341 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0954314  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0085  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.05 
 
 
350 aa  64.3  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1032  putative aliphatic sulfonate binding protein precursor  27.62 
 
 
327 aa  63.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4355  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  28.34 
 
 
334 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000418029  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5352  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.57 
 
 
329 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5441  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.57 
 
 
329 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.558403 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5731  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.57 
 
 
329 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2205  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.67 
 
 
332 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142056  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0520  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.84 
 
 
323 aa  57.4  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0851  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.69 
 
 
328 aa  57  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0219644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4935  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.23 
 
 
325 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  24.85 
 
 
335 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  21.12 
 
 
340 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.85 
 
 
335 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  22.92 
 
 
342 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1172  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.2 
 
 
358 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811616  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0619  NMT1/THI5 like domain protein  23.08 
 
 
339 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2782  ABC transporter substrate-binding protein  21.05 
 
 
332 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0526  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.37 
 
 
357 aa  54.3  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2330  NMT1/THI5 like domain-containing protein  25.79 
 
 
314 aa  53.5  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3175  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.01 
 
 
367 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311198  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  28.97 
 
 
438 aa  53.1  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1230  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  29.59 
 
 
337 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.592722 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2131  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.33 
 
 
319 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.62 
 
 
335 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1411  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.08 
 
 
320 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.214398 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  28.77 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.84 
 
 
335 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1035  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  24.24 
 
 
349 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1735  twin-arginine translocation pathway signal  30.71 
 
 
319 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9276  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25 
 
 
355 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  22.48 
 
 
338 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5012  ABC transporter substrate-binding protein  26.03 
 
 
343 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4266  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.09 
 
 
341 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.533819  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  26.28 
 
 
420 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  22.7 
 
 
325 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.47 
 
 
331 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4189  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  39.34 
 
 
338 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.623523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4370  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.8 
 
 
341 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.460315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2686  ABC transporter substrate-binding protein  24.28 
 
 
362 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.7 
 
 
335 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  22.7 
 
 
335 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  27.63 
 
 
434 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4839  ABC transporter substrate-binding protein  25.33 
 
 
366 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.377956  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13660  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  28.49 
 
 
349 aa  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.2 
 
 
327 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  24.44 
 
 
328 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1329  ABC transporter substrate-binding protein  25.16 
 
 
361 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.123389  normal  0.17545 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0997  ABC transporter nitrate-binding protein  30.77 
 
 
457 aa  47.4  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2617  ABC transporter nitrate-binding protein  25.09 
 
 
454 aa  47.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0708468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4846  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.8 
 
 
341 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  20.79 
 
 
337 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5981  ABC transporter substrate-binding protein  26.94 
 
 
311 aa  46.6  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  22.46 
 
 
349 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  22.46 
 
 
349 aa  46.6  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1129  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.58 
 
 
333 aa  46.6  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1169  ABC transporter substrate-binding protein  24.84 
 
 
361 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0939824  normal  0.0445222 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6311  putative ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  26 
 
 
311 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.794983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5012  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.26 
 
 
369 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0114898  normal  0.178041 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0409  putative substrate-binding protein of aliphatic sulfonate ABC transporter  23.84 
 
 
348 aa  45.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.830213  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3774  putative nitrate transporter component, NrtA  32.33 
 
 
454 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.944319  normal  0.102556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  33.33 
 
 
340 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  25.83 
 
 
444 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  21.91 
 
 
349 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6904  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.72 
 
 
329 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  25.83 
 
 
444 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  28.93 
 
 
457 aa  46.2  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1186  taurine ABC transporter, taurine-binding protein  25.09 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.217841  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5799  twin-arginine translocation pathway signal  26.24 
 
 
349 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  32 
 
 
341 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3542  NLPA lipoprotein  26.6 
 
 
313 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3033  hypothetical protein  24.87 
 
 
343 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233167  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5415  putative nitrate ABC transporter (substrate-binding protein) (ntrA-like protein)  26.35 
 
 
461 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1089  taurine ABC transporter, taurine-binding protein  25.09 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  25 
 
 
405 aa  45.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2403  ABC transporter nitrate-binding protein  23.62 
 
 
462 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0310148  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3147  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.93 
 
 
344 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.77 
 
 
335 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  24.41 
 
 
328 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  24.84 
 
 
403 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  24.81 
 
 
450 aa  44.3  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3870  hypothetical protein  22.9 
 
 
354 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000795104  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  29.57 
 
 
382 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4818  ABC transporter nitrate-binding protein  28.46 
 
 
456 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1901  NMT1/THI5 like domain protein  27.3 
 
 
353 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3098  hypothetical protein  25.17 
 
 
364 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4215  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.65 
 
 
330 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  24.1 
 
 
426 aa  43.9  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  22.73 
 
 
467 aa  43.5  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2774  ABC transporter substrate-binding protein  22.77 
 
 
373 aa  43.5  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4896  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.16 
 
 
346 aa  43.5  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  26.69 
 
 
329 aa  43.5  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2165  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  27.2 
 
 
345 aa  43.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2931  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  24.08 
 
 
328 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7380  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  26.27 
 
 
374 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8277  ABC transport system substrate-binding protein  24.18 
 
 
336 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0627957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3571  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.79 
 
 
357 aa  43.1  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>