76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4839 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4839  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 366 aa  730    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.377956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1329  ABC transporter substrate-binding protein  83.61 
 
 		 361 aa  592  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.123389  normal  0.17545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1169  ABC transporter substrate-binding protein  83.33 
 
 		 361 aa  591  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0939824  normal  0.0445222 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4899  ABC transporter substrate-binding protein  81.97 
 
 		 359 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2774  ABC transporter substrate-binding protein  70.7 
 
 		 373 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0117  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.95 
 
 		 347 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2165  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  53.66 
 
 		 345 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2686  ABC transporter substrate-binding protein  51.28 
 
 		 362 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5012  ABC transporter substrate-binding protein  51.97 
 
 		 343 aa  350  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2671  NMT1/THI5 like domain protein  55.03 
 
 		 367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3303  putative alkanesulfonate ABC transporter, substrate binding protein  53.18 
 
 		 355 aa  339  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3678  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  50.5 
 
 		 344 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.987849 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4336  NMT1/THI5-like domain-containing protein  50.5 
 
 		 344 aa  329  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379972  normal  0.507879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1757  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  50.17 
 
 		 346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502422  normal  0.0158469 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3263  NMT1/THI5-like domain-containing protein  49.83 
 
 		 344 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0622389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4151  NMT1/THI5-like domain-containing protein  50.17 
 
 		 344 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  0.147422 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4254  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  49.5 
 
 		 344 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000917513  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4112  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  49.5 
 
 		 344 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463971  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2219  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  48.48 
 
 		 341 aa  316  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0857  putative nitrate transport protein NrtA  48.86 
 
 		 353 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4593  NMT1/THI5 like domain protein  47.65 
 
 		 335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4459  NMT1/THI5 like domain protein  47.65 
 
 		 335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0725563  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3869  NMT1/THI5 like domain protein  47.56 
 
 		 337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.478553  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3267  taurine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  51.01 
 
 		 356 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31110  ABC transporter substrate binding protein  50.85 
 
 		 360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2516  putative alkanesulfonate ABC transporter, substrate binding protein  43.77 
 
 		 344 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5617  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system periplasmic component  41.64 
 
 		 368 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2902  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  39.83 
 
 		 342 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3147  hypothetical protein  31.02 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.162814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1356  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.41 
 
 		 367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.459208  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1920  NMT1/THI5 like domain protein  26.36 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1570  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0526  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.86 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0167  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.92 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  32.65 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5731  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.34 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5441  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.34 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.558403 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5352  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.34 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0049  putative nitrate transport protein NrtA  27.09 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  34.35 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5156  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  27.45 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  32.8 
 
 		 360 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3098  hypothetical protein  29.86 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  26.51 
 
 		 343 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1304  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  25.39 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165264  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0856  hypothetical protein  26.06 
 
 		 342 aa  51.2  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.028683  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2802  NLPA lipoprotein  25 
 
 		 327 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000138117  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1033  hypothetical protein  25.45 
 
 		 342 aa  49.7  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.152767  normal  0.375545 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3147  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.99 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2024  NMT1/THI5 like domain protein  23.24 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  33.04 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1483  ABC transporter substrate-binding protein  32.86 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  30.92 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4643  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.78 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  31.54 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  30.92 
 
 		 349 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2570  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.56 
 
 		 321 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2525  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.56 
 
 		 321 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.610523  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 347 aa  47  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.43 
 
 		 338 aa  47  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0815  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  27.52 
 
 		 326 aa  47  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  35.56 
 
 		 385 aa  46.6  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2932  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  21.22 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2562  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.86 
 
 		 321 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  26.32 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14770  NLPA lipoprotein  31.03 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0964  putative nitrate transporter component  23.38 
 
 		 486 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.511943 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4355  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  23.53 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000418029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  24.24 
 
 		 357 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3501  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.73 
 
 		 347 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00652225  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  28.03 
 
 		 297 aa  43.5  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5003  NMT1/THI5 like domain protein  28.02 
 
 		 332 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2131  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.55 
 
 		 319 aa  43.1  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603164  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 		 341 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>