80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1329 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4899  ABC transporter substrate-binding protein  91.69 
 
 		 359 aa  641    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1169  ABC transporter substrate-binding protein  99.17 
 
 		 361 aa  717    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0939824  normal  0.0445222 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1329  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 361 aa  724    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.123389  normal  0.17545 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4839  ABC transporter substrate-binding protein  85.41 
 
 		 366 aa  558  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.377956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2774  ABC transporter substrate-binding protein  70.79 
 
 		 373 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5012  ABC transporter substrate-binding protein  54.02 
 
 		 343 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0117  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  56.21 
 
 		 347 aa  359  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2165  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  56.58 
 
 		 345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2686  ABC transporter substrate-binding protein  51.14 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2671  NMT1/THI5 like domain protein  57.05 
 
 		 367 aa  343  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4336  NMT1/THI5-like domain-containing protein  52.49 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379972  normal  0.507879 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3263  NMT1/THI5-like domain-containing protein  51.83 
 
 		 344 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0622389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1757  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  52.16 
 
 		 346 aa  338  7e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502422  normal  0.0158469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4112  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  51.5 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4254  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  51.5 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000917513  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3678  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  51.5 
 
 		 344 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.987849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3303  putative alkanesulfonate ABC transporter, substrate binding protein  51.24 
 
 		 355 aa  332  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4151  NMT1/THI5-like domain-containing protein  51.5 
 
 		 344 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  0.147422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2219  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  45.75 
 
 		 341 aa  325  5e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4593  NMT1/THI5 like domain protein  49.33 
 
 		 335 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4459  NMT1/THI5 like domain protein  49.33 
 
 		 335 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0725563  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3869  NMT1/THI5 like domain protein  46.83 
 
 		 337 aa  312  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.478553  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0857  putative nitrate transport protein NrtA  48 
 
 		 353 aa  310  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3267  taurine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  48.99 
 
 		 356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31110  ABC transporter substrate binding protein  49.15 
 
 		 360 aa  282  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5617  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system periplasmic component  44.55 
 
 		 368 aa  265  8.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2516  putative alkanesulfonate ABC transporter, substrate binding protein  44.41 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2902  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  38.94 
 
 		 342 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3147  hypothetical protein  30.36 
 
 		 364 aa  126  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.162814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1356  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.53 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.459208  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1920  NMT1/THI5 like domain protein  26.82 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1570  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0526  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.66 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0167  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  27.69 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  30.14 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  36.69 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0049  putative nitrate transport protein NrtA  25 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  32.41 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5441  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.4 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.558403 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5731  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.4 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5352  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.4 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3098  hypothetical protein  30.83 
 
 		 364 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3147  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.71 
 
 		 344 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2802  NLPA lipoprotein  25 
 
 		 327 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000138117  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2620  NMT1/THI5 like domain protein  24.71 
 
 		 328 aa  50.1  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.985405  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1304  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  25.16 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  33.88 
 
 		 385 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14770  NLPA lipoprotein  27.03 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1437  NMT1/THI5 like domain protein  29.34 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2131  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603164  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0815  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  27.52 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  32.14 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5156  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  27.04 
 
 		 350 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  24.58 
 
 		 460 aa  46.6  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.3 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1483  ABC transporter substrate-binding protein  30.04 
 
 		 330 aa  46.2  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  30.41 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5003  NMT1/THI5 like domain protein  26.25 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3521  bicarbonate transport system substrate-binding protein  24.21 
 
 		 457 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2276  ABC transporter, periplasmic binding protein  23.68 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.278656  normal  0.376143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2648  putative signal peptide protein  30.67 
 
 		 353 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00493903 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2570  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.47 
 
 		 321 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2525  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.47 
 
 		 321 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.610523  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  30.2 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  30.2 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0851  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.09 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0219644  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  27.91 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3501  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.55 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00652225  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1735  twin-arginine translocation pathway signal  24.78 
 
 		 319 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 347 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2562  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.78 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  23.61 
 
 		 343 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  23.93 
 
 		 357 aa  43.1  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2596  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  23.9 
 
 		 457 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 		 356 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.09 
 
 		 336 aa  42.7  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0451  NMT1/THI5 like domain protein  29.33 
 
 		 349 aa  42.7  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  normal  0.0280986 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0964  putative nitrate transporter component  23.47 
 
 		 486 aa  42.7  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.511943 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  31.03 
 
 		 361 aa  42.7  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0405  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  32.69 
 
 		 331 aa  42.7  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>