136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_31110 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_31110  ABC transporter substrate binding protein  100 
 
 
360 aa  739    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3267  taurine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  71.07 
 
 
356 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2165  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  54.03 
 
 
345 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0117  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.03 
 
 
347 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4336  NMT1/THI5-like domain-containing protein  46.73 
 
 
344 aa  306  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379972  normal  0.507879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3678  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  46.73 
 
 
344 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.987849 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5012  ABC transporter substrate-binding protein  48.34 
 
 
343 aa  303  4.0000000000000003e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2686  ABC transporter substrate-binding protein  46.07 
 
 
362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3263  NMT1/THI5-like domain-containing protein  46.73 
 
 
344 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0622389  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4151  NMT1/THI5-like domain-containing protein  46.41 
 
 
344 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  0.147422 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4112  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  46.41 
 
 
344 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4254  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  46.41 
 
 
344 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000917513  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1757  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  46.41 
 
 
346 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502422  normal  0.0158469 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2219  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  43.02 
 
 
341 aa  299  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0857  putative nitrate transport protein NrtA  49.32 
 
 
353 aa  299  6e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3303  putative alkanesulfonate ABC transporter, substrate binding protein  50 
 
 
355 aa  296  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2774  ABC transporter substrate-binding protein  49.01 
 
 
373 aa  294  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3869  NMT1/THI5 like domain protein  48.14 
 
 
337 aa  291  8e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.478553  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4839  ABC transporter substrate-binding protein  50.85 
 
 
366 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.377956  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2671  NMT1/THI5 like domain protein  48.65 
 
 
367 aa  286  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4593  NMT1/THI5 like domain protein  44.78 
 
 
335 aa  282  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4459  NMT1/THI5 like domain protein  44.78 
 
 
335 aa  282  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0725563  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1329  ABC transporter substrate-binding protein  49.15 
 
 
361 aa  276  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.123389  normal  0.17545 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4899  ABC transporter substrate-binding protein  49.15 
 
 
359 aa  275  9e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1169  ABC transporter substrate-binding protein  48.81 
 
 
361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0939824  normal  0.0445222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5617  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system periplasmic component  42.67 
 
 
368 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2516  putative alkanesulfonate ABC transporter, substrate binding protein  41.28 
 
 
344 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2902  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  37.29 
 
 
342 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1356  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.25 
 
 
367 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.459208  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3147  hypothetical protein  26.52 
 
 
364 aa  89.7  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.162814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1920  NMT1/THI5 like domain protein  27.65 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1570  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0526  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.36 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0049  putative nitrate transport protein NrtA  25.45 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.32 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.67 
 
 
333 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  25.47 
 
 
349 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2802  NLPA lipoprotein  26.09 
 
 
327 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000138117  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5352  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.22 
 
 
329 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5441  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.22 
 
 
329 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.558403 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5731  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.22 
 
 
329 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2932  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  25.46 
 
 
346 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
349 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  26.79 
 
 
343 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  24.24 
 
 
349 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3083  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.83 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261971  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.66 
 
 
345 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.64 
 
 
323 aa  53.5  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1032  putative aliphatic sulfonate binding protein precursor  24.88 
 
 
327 aa  53.5  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  22.14 
 
 
340 aa  53.1  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2205  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.72 
 
 
332 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142056  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.7 
 
 
327 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2120  hypothetical protein  24.24 
 
 
326 aa  52  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  24.79 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0260  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 
331 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.388479  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2782  NLPA lipoprotein  26.07 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0743027  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0167  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  22.26 
 
 
385 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 
347 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  22.94 
 
 
345 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2986  NMT1/THI5 like domain protein  34.11 
 
 
354 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  21.76 
 
 
337 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.94 
 
 
345 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0033  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  23.37 
 
 
417 aa  50.1  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0292  ABC transporter nitrate-binding protein  23.61 
 
 
451 aa  49.7  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0308  twin-arginine translocation pathway signal  23.42 
 
 
414 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1483  ABC transporter substrate-binding protein  27.34 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 
340 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  23.36 
 
 
460 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0769  NMT1/THI5-like domain-containing protein  32.79 
 
 
354 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  22.74 
 
 
346 aa  48.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  27.59 
 
 
657 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  25.26 
 
 
371 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  24.14 
 
 
349 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
347 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1307  ABC transporter nitrate-binding protein  25 
 
 
453 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.870256  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2673  putative ABC transporter, substrate binding protein  27.33 
 
 
326 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416834  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  24.68 
 
 
342 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1148  ABC transporter nitrate-binding protein  25 
 
 
453 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294193  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3972  ABC transporter nitrate-binding protein  23.83 
 
 
471 aa  47.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0586  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25 
 
 
309 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891954  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4331  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.69 
 
 
330 aa  47  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 
341 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  22.54 
 
 
334 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  22.54 
 
 
334 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  24.16 
 
 
297 aa  46.2  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2516  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  29.17 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445481  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1079  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.37 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0298231  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  25.15 
 
 
344 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1466  hypothetical protein  24.36 
 
 
322 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0764811  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0520  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.26 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  25.56 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4513  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.39 
 
 
335 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0105  NMT1/THI5 like domain protein  29.88 
 
 
314 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.318497  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.91 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2645  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.14 
 
 
320 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2683  hypothetical protein  29.67 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.857311  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0085  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.18 
 
 
350 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2834  twin-arginine translocation pathway signal  22.47 
 
 
411 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.960299 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0383  NlpA lipoprotein  28.75 
 
 
312 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391974  normal  0.191867 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>