178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2516 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2516  putative alkanesulfonate ABC transporter, substrate binding protein  100 
 
 
344 aa  695    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2165  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  42.77 
 
 
345 aa  275  9e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0117  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.71 
 
 
347 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1329  ABC transporter substrate-binding protein  44.41 
 
 
361 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.123389  normal  0.17545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2686  ABC transporter substrate-binding protein  40.11 
 
 
362 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1169  ABC transporter substrate-binding protein  44.41 
 
 
361 aa  256  6e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0939824  normal  0.0445222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4839  ABC transporter substrate-binding protein  43.56 
 
 
366 aa  255  8e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.377956  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2219  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  39.82 
 
 
341 aa  251  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1757  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  41.81 
 
 
346 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502422  normal  0.0158469 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3263  NMT1/THI5-like domain-containing protein  41.47 
 
 
344 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0622389  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2774  ABC transporter substrate-binding protein  41.96 
 
 
373 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4593  NMT1/THI5 like domain protein  41.14 
 
 
335 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4459  NMT1/THI5 like domain protein  41.14 
 
 
335 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0725563  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4112  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  41.14 
 
 
344 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4254  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  41.14 
 
 
344 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000917513  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4336  NMT1/THI5-like domain-containing protein  41.47 
 
 
344 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379972  normal  0.507879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3869  NMT1/THI5 like domain protein  42.14 
 
 
337 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.478553  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4899  ABC transporter substrate-binding protein  43.69 
 
 
359 aa  246  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2671  NMT1/THI5 like domain protein  40.86 
 
 
367 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3678  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  41.14 
 
 
344 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.987849 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5617  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system periplasmic component  41.67 
 
 
368 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4151  NMT1/THI5-like domain-containing protein  41.14 
 
 
344 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  0.147422 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0857  putative nitrate transport protein NrtA  39.13 
 
 
353 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3303  putative alkanesulfonate ABC transporter, substrate binding protein  40.24 
 
 
355 aa  229  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5012  ABC transporter substrate-binding protein  37.01 
 
 
343 aa  225  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31110  ABC transporter substrate binding protein  41.28 
 
 
360 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3267  taurine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  40.77 
 
 
356 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2902  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  34.13 
 
 
342 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3147  hypothetical protein  28.01 
 
 
364 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.162814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1356  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.18 
 
 
367 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.459208  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1920  NMT1/THI5 like domain protein  28.74 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1570  extracellular solute-binding protein  28 
 
 
353 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0167  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.34 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0526  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25 
 
 
357 aa  74.3  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  29.14 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  25.91 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.01 
 
 
339 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1483  ABC transporter substrate-binding protein  25.21 
 
 
330 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.37 
 
 
336 aa  63.9  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.82 
 
 
346 aa  63.5  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7630  hypothetical protein  23.48 
 
 
363 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3147  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.11 
 
 
344 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  26.3 
 
 
460 aa  62.4  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2107  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  26.2 
 
 
529 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.287431  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5515  extracellular solute-binding protein family 3  24.44 
 
 
333 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3742  twin-arginine translocation pathway signal  28.15 
 
 
467 aa  61.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0292  ABC transporter nitrate-binding protein  24.68 
 
 
451 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.92 
 
 
327 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27190  hypothetical protein  27.76 
 
 
376 aa  59.3  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  29.07 
 
 
349 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1973  NLPA lipoprotein  24.47 
 
 
335 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000524772  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  25.68 
 
 
339 aa  58.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  23.42 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  26 
 
 
329 aa  57.4  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0341  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  22.27 
 
 
323 aa  57.4  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3487  putative nitrate transporter component, nrtA  24.54 
 
 
464 aa  57.4  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  28.68 
 
 
349 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  22.59 
 
 
333 aa  57  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5415  putative nitrate ABC transporter (substrate-binding protein) (ntrA-like protein)  26.04 
 
 
461 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3972  ABC transporter nitrate-binding protein  24.22 
 
 
471 aa  57  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  25.26 
 
 
431 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0097  NLPA lipoprotein  26.55 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0041  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.71 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.487407 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2802  NLPA lipoprotein  26.83 
 
 
327 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000138117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5731  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.25 
 
 
329 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2782  NLPA lipoprotein  23.67 
 
 
319 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0743027  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0586  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.71 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891954  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  29.58 
 
 
349 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5352  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.25 
 
 
329 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5441  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.25 
 
 
329 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.558403 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0997  ABC transporter nitrate-binding protein  25.37 
 
 
457 aa  54.7  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3098  hypothetical protein  26.97 
 
 
364 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0769  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.37 
 
 
354 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0405  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  27.83 
 
 
331 aa  53.1  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4355  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  25 
 
 
334 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000418029  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1134  NMT1/THI5 like domain protein  21.93 
 
 
365 aa  52.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  24.36 
 
 
657 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 
341 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2986  NMT1/THI5 like domain protein  28.78 
 
 
354 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  25.33 
 
 
356 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1901  twin-arginine translocation pathway signal  24.7 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00273857  hitchhiker  0.00000000000094829 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  23.76 
 
 
457 aa  51.2  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4513  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.22 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  22.27 
 
 
297 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1144  NMT1/THI5 like domain protein  21.85 
 
 
357 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144377  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26 
 
 
338 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1027  bicarbonate transport system substrate-binding protein  23.53 
 
 
458 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0437  extracellular solute-binding protein family 3  24.39 
 
 
319 aa  51.2  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0271798  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4818  ABC transporter nitrate-binding protein  24.77 
 
 
456 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 
347 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1057  extracellular solute-binding protein family 3  25.35 
 
 
332 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227515  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0244  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.81 
 
 
306 aa  50.1  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.576373  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1148  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  20 
 
 
308 aa  50.4  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000156737  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 
347 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  25.56 
 
 
360 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2403  ABC transporter nitrate-binding protein  23.6 
 
 
462 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0310148  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0878  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  21.62 
 
 
299 aa  49.7  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00683705  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3542  NLPA lipoprotein  24.91 
 
 
313 aa  49.3  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  23.02 
 
 
364 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0406  NMT1/THI5 like domain protein  25.91 
 
 
334 aa  48.9  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>