60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3147 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3147  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  720    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.162814 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2165  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  29.82 
 
 		 345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0117  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.28 
 
 		 347 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5012  ABC transporter substrate-binding protein  30.66 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4839  ABC transporter substrate-binding protein  30.77 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.377956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1329  ABC transporter substrate-binding protein  30.36 
 
 		 361 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.123389  normal  0.17545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1169  ABC transporter substrate-binding protein  30.69 
 
 		 361 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0939824  normal  0.0445222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0857  putative nitrate transport protein NrtA  29.05 
 
 		 353 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2671  NMT1/THI5 like domain protein  29.33 
 
 		 367 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2774  ABC transporter substrate-binding protein  29.37 
 
 		 373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4899  ABC transporter substrate-binding protein  29.9 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2219  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  26.17 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2686  ABC transporter substrate-binding protein  26.48 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3303  putative alkanesulfonate ABC transporter, substrate binding protein  29.93 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4151  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.75 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  0.147422 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3678  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  25.42 
 
 		 344 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.987849 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4459  NMT1/THI5 like domain protein  25.84 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0725563  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4593  NMT1/THI5 like domain protein  25.84 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4336  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.42 
 
 		 344 aa  116  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379972  normal  0.507879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1757  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  25.08 
 
 		 346 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502422  normal  0.0158469 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3267  taurine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.94 
 
 		 356 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3263  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.75 
 
 		 344 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0622389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4254  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  24.75 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000917513  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4112  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  24.75 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463971  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2516  putative alkanesulfonate ABC transporter, substrate binding protein  28.01 
 
 		 344 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3869  NMT1/THI5 like domain protein  25.17 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.478553  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5617  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system periplasmic component  26.45 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2902  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  27.68 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31110  ABC transporter substrate binding protein  26.52 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.81 
 
 		 318 aa  52.8  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1920  NMT1/THI5 like domain protein  22.37 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4089  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  23.86 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4201  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  23.86 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0212  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  21.83 
 
 		 306 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1356  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.71 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.459208  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1383  putative alkanesulfonates binding protein precursor  25 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  26.14 
 
 		 475 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  28.35 
 
 		 437 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0260  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 331 aa  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.388479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  29.13 
 
 		 437 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1032  putative aliphatic sulfonate binding protein precursor  23.5 
 
 		 327 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  26.96 
 
 		 657 aa  46.2  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3386  hypothetical protein  26.46 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  23.49 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1570  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 353 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  27.84 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0520  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.14 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0049  putative nitrate transport protein NrtA  26.11 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2822  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  29.94 
 
 		 331 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  27.1 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0685  hypothetical protein  25.97 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.820561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1483  ABC transporter substrate-binding protein  22.05 
 
 		 330 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  24.84 
 
 		 450 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6546  ABC transporter substrate-binding protein  26.17 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.280995 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0409  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  28.68 
 
 		 462 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.309942  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1148  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  21.93 
 
 		 308 aa  43.1  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000156737  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  29.73 
 
 		 403 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4880  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  24.65 
 
 		 330 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.184039  normal  0.779449 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.57 
 
 		 427 aa  42.7  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  29.77 
 
 		 349 aa  42.7  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>