159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0857 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0857  putative nitrate transport protein NrtA  100 
 
 
353 aa  716    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2686  ABC transporter substrate-binding protein  50.33 
 
 
362 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3303  putative alkanesulfonate ABC transporter, substrate binding protein  50.33 
 
 
355 aa  322  9.000000000000001e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2774  ABC transporter substrate-binding protein  48.17 
 
 
373 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4839  ABC transporter substrate-binding protein  48.99 
 
 
366 aa  309  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.377956  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0117  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  47.84 
 
 
347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4899  ABC transporter substrate-binding protein  47.83 
 
 
359 aa  306  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1329  ABC transporter substrate-binding protein  48 
 
 
361 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.123389  normal  0.17545 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2165  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  48.32 
 
 
345 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1169  ABC transporter substrate-binding protein  48 
 
 
361 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0939824  normal  0.0445222 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31110  ABC transporter substrate binding protein  49.32 
 
 
360 aa  298  7e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2671  NMT1/THI5 like domain protein  45.79 
 
 
367 aa  297  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3267  taurine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  48.15 
 
 
356 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3869  NMT1/THI5 like domain protein  44.41 
 
 
337 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.478553  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2219  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  44.3 
 
 
341 aa  282  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5012  ABC transporter substrate-binding protein  43.59 
 
 
343 aa  278  8e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4593  NMT1/THI5 like domain protein  44.3 
 
 
335 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4459  NMT1/THI5 like domain protein  44.3 
 
 
335 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0725563  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4336  NMT1/THI5-like domain-containing protein  43.52 
 
 
344 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379972  normal  0.507879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1757  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  43.52 
 
 
346 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502422  normal  0.0158469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4112  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  43.52 
 
 
344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4254  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  43.52 
 
 
344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000917513  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3678  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  43.85 
 
 
344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.987849 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3263  NMT1/THI5-like domain-containing protein  43.19 
 
 
344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0622389  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4151  NMT1/THI5-like domain-containing protein  43.52 
 
 
344 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  0.147422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5617  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system periplasmic component  40.26 
 
 
368 aa  245  6.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.415554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2516  putative alkanesulfonate ABC transporter, substrate binding protein  39.13 
 
 
344 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2902  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  32.31 
 
 
342 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3147  hypothetical protein  29.05 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.162814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1356  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.4 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.459208  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1570  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 
353 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1920  NMT1/THI5 like domain protein  27.19 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0049  putative nitrate transport protein NrtA  30.53 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0526  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.08 
 
 
357 aa  74.3  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0437  extracellular solute-binding protein family 3  24.79 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0271798  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.57 
 
 
336 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2932  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  25.23 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1483  ABC transporter substrate-binding protein  27.36 
 
 
330 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1901  twin-arginine translocation pathway signal  23.9 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00273857  hitchhiker  0.00000000000094829 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1973  NLPA lipoprotein  26.82 
 
 
335 aa  56.6  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000524772  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  26.55 
 
 
391 aa  56.2  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  27.62 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3147  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2802  NLPA lipoprotein  25.65 
 
 
327 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000138117  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1032  putative aliphatic sulfonate binding protein precursor  24.75 
 
 
327 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1647  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  24.81 
 
 
324 aa  53.9  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0520  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.09 
 
 
323 aa  53.5  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0212  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.68 
 
 
306 aa  53.1  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  32.99 
 
 
460 aa  52.8  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3869  twin-arginine translocation pathway signal  24.78 
 
 
408 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0223785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3098  hypothetical protein  29.17 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  25.96 
 
 
668 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3795  twin-arginine translocation pathway signal  25.22 
 
 
408 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.296999 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0308  twin-arginine translocation pathway signal  23.31 
 
 
414 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.9 
 
 
333 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1170  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.01 
 
 
356 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0662412  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  24.79 
 
 
360 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44550  ABC transporter periplasmic component  23.4 
 
 
371 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3487  twin-arginine translocation pathway signal  25.22 
 
 
408 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  25.24 
 
 
332 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0260  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 
331 aa  50.8  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.388479  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4513  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.35 
 
 
335 aa  50.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2782  NLPA lipoprotein  27.81 
 
 
319 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0743027  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  28.77 
 
 
349 aa  49.7  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5352  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.37 
 
 
329 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5441  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.37 
 
 
329 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.558403 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5731  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.37 
 
 
329 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  24.82 
 
 
667 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0288  NMT1/THI5 like domain protein  27.52 
 
 
327 aa  49.3  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133462  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1454  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  24.9 
 
 
403 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140123  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1383  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  28.19 
 
 
349 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0150888 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2205  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.38 
 
 
332 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142056  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0481  NMT1/THI5 like domain protein  26.79 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4331  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.08 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7630  hypothetical protein  26.37 
 
 
363 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0167  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.85 
 
 
385 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4663  ABC transporter nitrate-binding protein  23.58 
 
 
453 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1079  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.44 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0298231  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3742  twin-arginine translocation pathway signal  30.21 
 
 
467 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0292  ABC transporter nitrate-binding protein  26.32 
 
 
451 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2986  NMT1/THI5 like domain protein  24.46 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  22.12 
 
 
457 aa  48.5  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  26.38 
 
 
323 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3487  putative nitrate transporter component, nrtA  27.68 
 
 
464 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  24.77 
 
 
334 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1307  ABC transporter nitrate-binding protein  23.58 
 
 
453 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.870256  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  24.77 
 
 
334 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3972  ABC transporter nitrate-binding protein  29.17 
 
 
471 aa  47.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0158  NLPA lipoprotein  22.87 
 
 
323 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0163  NLPA lipoprotein  22.87 
 
 
323 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1678  hypothetical protein  26.53 
 
 
334 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1148  ABC transporter nitrate-binding protein  23.58 
 
 
453 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294193  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  24.4 
 
 
340 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0449  NMT1/THI5 like domain protein  27.31 
 
 
327 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0997  ABC transporter nitrate-binding protein  28.26 
 
 
457 aa  46.6  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2834  twin-arginine translocation pathway signal  23.18 
 
 
411 aa  47  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.960299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2673  putative ABC transporter, substrate binding protein  22.82 
 
 
326 aa  46.6  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416834  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  27.15 
 
 
349 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0851  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.13 
 
 
328 aa  46.6  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0219644  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
341 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>