299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1454 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1454  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  100 
 
 
403 aa  804    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140123  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0457  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  51.88 
 
 
400 aa  394  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3636  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  51.82 
 
 
401 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429182  normal  0.917862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2276  ABC transporter, periplasmic binding protein  51.82 
 
 
401 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.278656  normal  0.376143 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6336  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  51.17 
 
 
396 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2097  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  51.82 
 
 
401 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6513  twin-arginine translocation pathway signal  51.17 
 
 
396 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.47119  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6747  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system periplasmic component  51.17 
 
 
396 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.248513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2931  hypothetical protein  53.74 
 
 
399 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0955897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34510  hypothetical protein  53.46 
 
 
399 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531773  normal  0.0856491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5823  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  51.14 
 
 
387 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.437918  normal  0.494999 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2629  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  48.48 
 
 
407 aa  367  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.272886  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0100  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.86 
 
 
396 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227114  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1540  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  46.72 
 
 
396 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2834  twin-arginine translocation pathway signal  45.24 
 
 
411 aa  331  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.960299 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0308  twin-arginine translocation pathway signal  46.71 
 
 
414 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3795  twin-arginine translocation pathway signal  47.18 
 
 
408 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.296999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3869  twin-arginine translocation pathway signal  46.32 
 
 
408 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0223785 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0033  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  42.86 
 
 
417 aa  316  4e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3487  twin-arginine translocation pathway signal  46.89 
 
 
408 aa  316  5e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0144  twin-arginine translocation pathway signal  40.16 
 
 
413 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0967  twin-arginine translocation pathway signal  41.39 
 
 
427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.107328 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1901  twin-arginine translocation pathway signal  35.47 
 
 
321 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00273857  hitchhiker  0.00000000000094829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2403  ABC transporter nitrate-binding protein  28.69 
 
 
462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0310148  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3742  twin-arginine translocation pathway signal  29.46 
 
 
467 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0997  ABC transporter nitrate-binding protein  29 
 
 
457 aa  146  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1735  twin-arginine translocation pathway signal  30.24 
 
 
319 aa  145  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  28.74 
 
 
457 aa  145  9e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2589  putative nitrate transporter component  29.83 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200575 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0964  putative nitrate transporter component  28.73 
 
 
486 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.511943 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2054  twin-arginine translocation pathway signal  27.87 
 
 
462 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3487  putative nitrate transporter component, nrtA  29.09 
 
 
464 aa  139  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  29.84 
 
 
460 aa  138  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0292  ABC transporter nitrate-binding protein  28.57 
 
 
451 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2107  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  27.43 
 
 
529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.287431  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4818  ABC transporter nitrate-binding protein  28.62 
 
 
456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2617  ABC transporter nitrate-binding protein  27.51 
 
 
454 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0708468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3972  ABC transporter nitrate-binding protein  28.33 
 
 
471 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1973  NLPA lipoprotein  29.58 
 
 
335 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000524772  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4663  ABC transporter nitrate-binding protein  26.02 
 
 
453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1307  ABC transporter nitrate-binding protein  25.68 
 
 
453 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.870256  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1148  ABC transporter nitrate-binding protein  25.68 
 
 
453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294193  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3774  putative nitrate transporter component, NrtA  27.81 
 
 
454 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.944319  normal  0.102556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5415  putative nitrate ABC transporter (substrate-binding protein) (ntrA-like protein)  26.05 
 
 
461 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0437  extracellular solute-binding protein family 3  27.74 
 
 
319 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0271798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2802  NLPA lipoprotein  31.25 
 
 
327 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000138117  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0621  twin-arginine translocation pathway signal  32.67 
 
 
305 aa  114  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000550698  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1130  twin-arginine translocation pathway signal  30.08 
 
 
305 aa  98.6  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.471389  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1644  twin-arginine translocation pathway signal  29.21 
 
 
343 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  decreased coverage  0.00621187 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1263  nitrate transporter component, nrtA  27.83 
 
 
403 aa  96.3  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1968  nitrate transport protein, NrtC like protein  27.1 
 
 
444 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  24.94 
 
 
475 aa  93.2  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  24.19 
 
 
405 aa  91.3  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  26.8 
 
 
467 aa  90.9  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0163  NLPA lipoprotein  27.71 
 
 
323 aa  90.9  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0158  NLPA lipoprotein  27.71 
 
 
323 aa  90.9  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  26.92 
 
 
668 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  26.92 
 
 
668 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1734  nitrate transporter, putative  31.52 
 
 
361 aa  90.1  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918495  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.22 
 
 
427 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0520  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.53 
 
 
323 aa  87.8  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  28.63 
 
 
668 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  23.51 
 
 
407 aa  87.4  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2932  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  26.34 
 
 
346 aa  86.3  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3316  putative nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein  25.7 
 
 
461 aa  85.5  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  23.23 
 
 
434 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  30.23 
 
 
382 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1115  putative nitrate transport protein  25.66 
 
 
491 aa  84  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  26.67 
 
 
669 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  23.83 
 
 
443 aa  84  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1663  periplasmic binding protein-like II  24.21 
 
 
455 aa  83.6  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550763  normal  0.0123781 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  25.08 
 
 
450 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  27.56 
 
 
432 aa  82  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  24.64 
 
 
418 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  26.14 
 
 
435 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1153  nitrate transporter system, periplasmic component  25.42 
 
 
461 aa  81.3  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1760  putative regulatory protein  30.53 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  24.61 
 
 
431 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4540  twin-arginine translocation pathway signal  22.73 
 
 
440 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  23.71 
 
 
417 aa  80.9  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2820  nitrate transporter  24.29 
 
 
397 aa  80.9  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.694753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2528  nitrate transporter, putative  26.9 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1172  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.08 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811616  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2972  nitrate transporter component, nrtA  26.46 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2264  histidine kinase  24.83 
 
 
470 aa  80.1  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00574253  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  22.98 
 
 
423 aa  80.1  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  21.59 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3656  twin-arginine translocation pathway signal  24.42 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  22.26 
 
 
430 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  22.26 
 
 
430 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  22.26 
 
 
430 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4228  putative nitrate transport protein  29.26 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0904389  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1704  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.02 
 
 
410 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  27.68 
 
 
404 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4138  putative nitrate transporter component, nrtA  28.15 
 
 
384 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0332  putative regulatory protein NasS  30.18 
 
 
353 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0240199  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1091  putative regulatory protein NasS  30.18 
 
 
353 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1257  putative regulatory protein NasS  30.18 
 
 
353 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0276079  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  25.67 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3040  putative nitrate transport protein  25.26 
 
 
452 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0757013  normal  0.570459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>