More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0967 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0967  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
427 aa  886    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.107328 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0308  twin-arginine translocation pathway signal  67.68 
 
 
414 aa  524  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0033  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  59.48 
 
 
417 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2834  twin-arginine translocation pathway signal  61.56 
 
 
411 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.960299 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3869  twin-arginine translocation pathway signal  56.35 
 
 
408 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0223785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3795  twin-arginine translocation pathway signal  56.35 
 
 
408 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.296999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3487  twin-arginine translocation pathway signal  56.08 
 
 
408 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0144  twin-arginine translocation pathway signal  45.34 
 
 
413 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6336  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  45.85 
 
 
396 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6513  twin-arginine translocation pathway signal  45.85 
 
 
396 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.47119  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6747  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system periplasmic component  45.85 
 
 
396 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.248513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3636  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  44.6 
 
 
401 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429182  normal  0.917862 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2629  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  45.1 
 
 
407 aa  348  1e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.272886  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2097  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  44.36 
 
 
401 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34510  hypothetical protein  47.38 
 
 
399 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531773  normal  0.0856491 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2276  ABC transporter, periplasmic binding protein  44.36 
 
 
401 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.278656  normal  0.376143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2931  hypothetical protein  46.56 
 
 
399 aa  342  9e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0955897  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5823  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  46.7 
 
 
387 aa  340  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.437918  normal  0.494999 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0100  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.34 
 
 
396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227114  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0457  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  43.13 
 
 
400 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1540  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.85 
 
 
396 aa  335  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1454  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  41.95 
 
 
403 aa  290  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140123  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1901  twin-arginine translocation pathway signal  30.25 
 
 
321 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00273857  hitchhiker  0.00000000000094829 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3487  putative nitrate transporter component, nrtA  27.75 
 
 
464 aa  138  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3742  twin-arginine translocation pathway signal  26.72 
 
 
467 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1735  twin-arginine translocation pathway signal  29.11 
 
 
319 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  27.6 
 
 
457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2589  putative nitrate transporter component  27.79 
 
 
475 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200575 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0997  ABC transporter nitrate-binding protein  27.34 
 
 
457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3972  ABC transporter nitrate-binding protein  28.73 
 
 
471 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2107  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  28.45 
 
 
529 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.287431  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0964  putative nitrate transporter component  28.29 
 
 
486 aa  129  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.511943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2403  ABC transporter nitrate-binding protein  26.67 
 
 
462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0310148  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  24.22 
 
 
460 aa  126  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0292  ABC transporter nitrate-binding protein  27.67 
 
 
451 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3774  putative nitrate transporter component, NrtA  28.95 
 
 
454 aa  124  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.944319  normal  0.102556 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2054  twin-arginine translocation pathway signal  26.29 
 
 
462 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1148  ABC transporter nitrate-binding protein  25.34 
 
 
453 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294193  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1307  ABC transporter nitrate-binding protein  25.34 
 
 
453 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.870256  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4663  ABC transporter nitrate-binding protein  25.79 
 
 
453 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4818  ABC transporter nitrate-binding protein  25.16 
 
 
456 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2617  ABC transporter nitrate-binding protein  25.25 
 
 
454 aa  117  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0708468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5415  putative nitrate ABC transporter (substrate-binding protein) (ntrA-like protein)  25.41 
 
 
461 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2932  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  27.92 
 
 
346 aa  107  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1973  NLPA lipoprotein  28.19 
 
 
335 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000524772  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1130  twin-arginine translocation pathway signal  29.93 
 
 
305 aa  102  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.471389  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0621  twin-arginine translocation pathway signal  29.13 
 
 
305 aa  102  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000550698  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0437  extracellular solute-binding protein family 3  25.66 
 
 
319 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0271798  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3039  putative nitrate transport protein  27.32 
 
 
389 aa  97.1  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.58476  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2802  NLPA lipoprotein  26.96 
 
 
327 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000138117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1644  twin-arginine translocation pathway signal  28.19 
 
 
343 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  decreased coverage  0.00621187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.22 
 
 
427 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  24.86 
 
 
467 aa  91.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4540  twin-arginine translocation pathway signal  25.32 
 
 
440 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  25.23 
 
 
437 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  25.49 
 
 
432 aa  90.5  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4138  putative nitrate transporter component, nrtA  24.67 
 
 
384 aa  86.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1115  putative nitrate transport protein  24.57 
 
 
491 aa  85.9  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  25.16 
 
 
450 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4228  putative nitrate transport protein  25.45 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0904389  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1662  periplasmic binding protein-like II  26.21 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.429682  hitchhiker  0.00361023 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  23.54 
 
 
435 aa  84.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1454  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  24.86 
 
 
425 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  25.32 
 
 
437 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  23.49 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  24.1 
 
 
431 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  25.21 
 
 
668 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1411  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.79 
 
 
320 aa  82  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.214398 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0158  NLPA lipoprotein  23.95 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0163  NLPA lipoprotein  23.95 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  22.42 
 
 
407 aa  80.9  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  23.35 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  24.85 
 
 
425 aa  80.1  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0520  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.57 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  25.08 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  26.67 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  24.79 
 
 
669 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  24.12 
 
 
430 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  25.16 
 
 
432 aa  77  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  24.12 
 
 
430 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1761  nitrate transporter component, nrtA  26.22 
 
 
386 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.786473  normal  0.0141893 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  24.23 
 
 
414 aa  77  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  22.55 
 
 
475 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  24.12 
 
 
430 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1631  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  22.44 
 
 
424 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4454  putative nitrate transport protein  26.33 
 
 
390 aa  76.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  25 
 
 
417 aa  76.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  23.97 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1449  nitrate transporter component, nrtA  23.29 
 
 
403 aa  75.5  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  23.63 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  23.63 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  23.69 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  23.53 
 
 
668 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  23.4 
 
 
418 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1210  putative nitrate transporter component, nrtA  23.64 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1084  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system  24.61 
 
 
467 aa  73.6  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  24.37 
 
 
668 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  24.37 
 
 
668 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  24.62 
 
 
433 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  23.97 
 
 
438 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>