35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4524 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4524  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  100 
 
 		 374 aa  758    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1304  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  30.03 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165264  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2963  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  23.9 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0954314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2293  membrane lipoprotein lipid attachment site  23.08 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  22.03 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2964  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  24.82 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  23.42 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  19.8 
 
 		 335 aa  50.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2575  hypothetical protein  24.29 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.225151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  19.8 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  19.8 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0878  hypothetical protein  23.33 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0057402  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  24.91 
 
 		 657 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2782  ABC transporter substrate-binding protein  21.25 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  22.22 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  20.89 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  19.8 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5012  ABC transporter substrate-binding protein  23.86 
 
 		 343 aa  47  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  19.45 
 
 		 335 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  23.72 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1172  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.95 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811616  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3098  hypothetical protein  24.6 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  19.72 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  19.11 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  19.72 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.23 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  20.65 
 
 		 325 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1570  extracellular solute-binding protein  22.01 
 
 		 353 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3870  hypothetical protein  28.57 
 
 		 354 aa  43.5  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000795104  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1347  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.34 
 
 		 330 aa  43.5  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  26.83 
 
 		 460 aa  43.1  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5799  twin-arginine translocation pathway signal  24.39 
 
 		 349 aa  43.1  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4189  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.78 
 
 		 338 aa  43.1  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.623523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.67 
 
 		 344 aa  42.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0619  NMT1/THI5 like domain protein  23.89 
 
 		 339 aa  42.7  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>