255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06841 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06841  nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  100 
 
 		 337 aa  689    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000866  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter substrate-binding component  96.52 
 
 		 316 aa  628  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0489  hypothetical protein  78.36 
 
 		 315 aa  501  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2375  ABC transporter substrate-binding protein  76.77 
 
 		 312 aa  498  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  53.55 
 
 		 311 aa  322  8e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  50.35 
 
 		 335 aa  320  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0909  NMT1/THI5 like domain protein  51.86 
 
 		 311 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0643839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  48 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  49.13 
 
 		 323 aa  304  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  49.82 
 
 		 322 aa  296  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  47.1 
 
 		 329 aa  295  9e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0204  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  48.99 
 
 		 322 aa  293  4e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0213  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  47.21 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0586  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  46.32 
 
 		 309 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0646  ABC transporter, substrate-binding protein  44.17 
 
 		 311 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.714673  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2299  ABC transporter, substrate-binding protein  44.17 
 
 		 311 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0813032 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3125  NMT1/THI5-like domain-containing protein  44 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1887  NMT1/THI5 like domain protein  36.81 
 
 		 319 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50224  normal  0.0288593 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  38.6 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  36.29 
 
 		 328 aa  155  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.84 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  35.22 
 
 		 333 aa  149  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  36.84 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  35.22 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  35.22 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  35.22 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  35.22 
 
 		 333 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  35.22 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  35.22 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  34.82 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  35.22 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  32.07 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  27.21 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.24 
 
 		 332 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.92 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  25.74 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.92 
 
 		 332 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.28 
 
 		 332 aa  99  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.92 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  26.92 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  26.92 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  26.92 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  26.92 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.92 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.96 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  37.41 
 
 		 336 aa  95.9  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0477  NMT1/THI5 like domain protein  25.71 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1522  hypothetical protein  24.04 
 
 		 314 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1461  hypothetical protein  23.61 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.77 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  26.77 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0243  ABC transporter, permease protein, putative  24.05 
 
 		 587 aa  87.8  2e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1222  NMT1/THI5 like domain protein  24.67 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  28.87 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  24.03 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477186 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2330  thiamine biosynthesis protein, putative  26.04 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4256  NMT1/THI5 like domain protein  24.38 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0797632  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0878  NMT1/THI5 like domain protein  25.26 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000508636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  24.92 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  25.97 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  30.43 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.62 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  23.53 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33535  predicted protein  24.7 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1152  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.94 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3936  NMT1/THI5 like domain protein  26.62 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0655  NMT1/THI5-like protein  27.68 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  24.91 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.5 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  25.56 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  23.05 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  25.31 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0392  NMT1/THI5 like domain protein  24.33 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.58 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  25.85 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  24.19 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4039  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  25.09 
 
 		 343 aa  67  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  25.21 
 
 		 334 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  30 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  25.96 
 
 		 721 aa  65.9  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3647  NMT1/THI5 like domain protein  26.47 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  25.68 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1669  NMT1/THI5 like domain protein  24.49 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.833326  normal  0.535701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.55 
 
 		 1075 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  28.36 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2098  NMT1/THI5 like domain protein  31.3 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  29.37 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0451  NMT1/THI5 like domain protein  32.28 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  normal  0.0280986 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  23.4 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.69 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.71 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  24.8 
 
 		 686 aa  59.7  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3466  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.05 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  24.06 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  25.74 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.69 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  26.22 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1941  NMT1/THI5 like domain protein  23.58 
 
 		 315 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.876036  hitchhiker  0.000270678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>