81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1738 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1738  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  633  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0611482  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1466  hypothetical protein  97.52 
 
 		 322 aa  621  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0764811  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2281  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  33.33 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0212  hypothetical protein  37.31 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000728433  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0437  hypothetical protein  30.19 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3902  hypothetical protein  28.61 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000029197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3870  hypothetical protein  27.6 
 
 		 354 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000795104  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4036  ABC sulfate transport system, periplasmic binding protein  26.69 
 
 		 331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.7213  normal  0.0122121 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2612  hypothetical protein  25.83 
 
 		 347 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0016523  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0722  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.74 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0746  hypothetical protein  29.37 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1148  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.41 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000156737  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0951  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.67 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00952521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0244  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.576373  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1931  ABC sulfate transport system, periplasmic binding protein  26.87 
 
 		 330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.10366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1346  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  24.35 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000809029  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0341  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  25.4 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1805  putative periplasmic component of ABC-type transport system  26.36 
 
 		 334 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0502884  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0136  ABC transporter substrate-binding protein  25.29 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0424  hypothetical protein  24.92 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1558  hypothetical protein  24.45 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000039017  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0564  hypothetical protein  28.62 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.52849  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03210  hypothetical protein  22.68 
 
 		 368 aa  102  9e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0198758 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0490  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  25.96 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000043628  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0878  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.07 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00683705  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2687  putative periplasmic component of ABC-type transport system  21.89 
 
 		 376 aa  97.1  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.130525  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1453  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  23.42 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.892723  normal  0.0689078 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0491  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  23.68 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00141878  normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  22.61 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  22.12 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0857  ABC-type transport system, periplasmic component  24.18 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1347  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.62 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2778  NMT1/THI5 like domain protein  25.97 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.17 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  23.53 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2816  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  27.37 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000863815 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2782  ABC transporter substrate-binding protein  22.39 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.95 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  23.95 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.67 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4935  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  22.69 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  21.65 
 
 		 340 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.67 
 
 		 335 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4169  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  23.53 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.22 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  23.22 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  23.22 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  23.22 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4189  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.03 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.623523 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3641  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  23.48 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105087  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2293  membrane lipoprotein lipid attachment site  23.45 
 
 		 336 aa  49.3  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0878  hypothetical protein  21.57 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0057402  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3117  NLPA lipoprotein  25.7 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  20.77 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2575  hypothetical protein  22.38 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.225151  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2205  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.63 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142056  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0213  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  26.16 
 
 		 393 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  21.92 
 
 		 342 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1035  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  27.95 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1411  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  22.66 
 
 		 320 aa  47  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.214398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0855  twin-arginine translocation pathway signal  20.27 
 
 		 326 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.584451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4540  twin-arginine translocation pathway signal  29.03 
 
 		 440 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3501  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  20.69 
 
 		 347 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00652225  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0085  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.44 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1488  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  20.91 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31110  ABC transporter substrate binding protein  24.36 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2153  putative solute-binding periplasmic protein of ABC transport  23.39 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2131  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.53 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603164  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3267  taurine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.9 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1935  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.22 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.49167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3338  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  32.88 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3780  NLPA lipoprotein  25.18 
 
 		 396 aa  43.1  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  23.6 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  27.42 
 
 		 444 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  27.42 
 
 		 444 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2921  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  23.13 
 
 		 328 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2713  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  23.13 
 
 		 328 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.38086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  23.88 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3528  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.86 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4507  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  25.84 
 
 		 326 aa  42.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0520  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.12 
 
 		 323 aa  42.7  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>