66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7250 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7250  putative ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  100 
 
 		 338 aa  684    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  0.156946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0806  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  25.59 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488938  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4215  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.97 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3083  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.8 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261971  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5127  Fis family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5352  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.74 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5731  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.36 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5441  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.74 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.558403 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2293  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.91 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0288  NMT1/THI5 like domain protein  33.33 
 
 		 327 aa  57  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133462  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.09 
 
 		 333 aa  57  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2477  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.53 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1144  NMT1/THI5 like domain protein  26.13 
 
 		 357 aa  52.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3303  putative alkanesulfonate ABC transporter, substrate binding protein  29.57 
 
 		 355 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2750  sulfonate/taurine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.51 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1134  NMT1/THI5 like domain protein  28.71 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  25.59 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5981  ABC transporter substrate-binding protein  24.48 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  26.45 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 915 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4436  hypothetical protein  27.08 
 
 		 357 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1347  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.38 
 
 		 330 aa  49.7  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.49 
 
 		 322 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  37.63 
 
 		 778 aa  49.3  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2671  NMT1/THI5 like domain protein  29.01 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  27.19 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5012  ABC transporter substrate-binding protein  31.97 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0117  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.49 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4058  twin-arginine translocation pathway signal  28.22 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  21.65 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2438  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.05 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1383  putative alkanesulfonates binding protein precursor  26.21 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2902  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  32.54 
 
 		 342 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2079  phosphonate-binding periplasmic protein  30.46 
 
 		 305 aa  47.4  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2165  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  27.56 
 
 		 345 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 341 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0097  NLPA lipoprotein  30 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3062  putative lipoprotein  23.84 
 
 		 340 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188548  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0878  hypothetical protein  22.04 
 
 		 329 aa  46.6  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0057402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3060  lipoprotein, putative  25.56 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2575  hypothetical protein  22.8 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.225151  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3748  ABC transporter, substrate binding protein  25.18 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4256  NMT1/THI5 like domain protein  26.53 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0797632  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2782  NLPA lipoprotein  27.21 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0743027  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3695  ABC phosphonate transporter periplasmic phosphonate-binding protein  28.12 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.37 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5419  NMT1/THI5 like domain protein  25.21 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0646  ABC transporter, substrate-binding protein  27.46 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.714673  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2299  ABC transporter, substrate-binding protein  27.46 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0813032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  24.46 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6080  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  29.41 
 
 		 343 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.147715 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0087  ABC taurine transporter, periplasmic ligand binding protein  30.99 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.191531  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  27.51 
 
 		 346 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.76 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.14 
 
 		 336 aa  43.5  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5471  ABC transporter substrate binding protein (aliphatic sulfonate)  28.06 
 
 		 321 aa  43.5  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5064  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  35.05 
 
 		 336 aa  43.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133964  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 347 aa  43.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  24.3 
 
 		 334 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  24.3 
 
 		 334 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0983  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.79 
 
 		 334 aa  42.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 347 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  22.17 
 
 		 349 aa  43.1  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1743  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  23.65 
 
 		 306 aa  42.7  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00139756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>